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罹病柑橘植株兼性厌氧型伴生菌鉴定及优势菌种分析

中文摘要第1-5页
英文摘要第5-11页
1 绪论第11-18页
   ·研究背景及意义第11-13页
     ·研究的背景第11-13页
     ·研究的意义第13页
   ·植物内生细菌的研究概况第13-15页
     ·植物内生细菌的定义第13-14页
     ·植物内生细菌的作用第14-15页
     ·植物内生细菌的应用前景第15页
   ·利用PCR-DGGE 技术研究微生物多样性第15页
     ·PCR-DGGE 技术原理简介第15页
     ·PFCR-DGGE 技术的应用第15页
   ·本研究的目的意义第15-16页
   ·本研究的创新点第16页
   ·技术路线第16-18页
2 内生细菌的定向分离培养第18-35页
   ·材料第18-19页
     ·实验材料第18-19页
     ·分离和纯化培养基第19页
     ·主要试剂和仪器第19页
   ·实验方法第19-25页
     ·样品的预处理第19-20页
     ·样品表面消毒效果检查第20页
     ·内生细菌的定向分离培养第20页
     ·内生菌的纯化及生理生化鉴定第20-21页
     ·内生细菌DNA 的提取第21页
     ·内生细菌16S rDNA 片段的扩增第21-22页
     ·纯化PCR 产物第22-23页
     ·高效感受态细胞的制备第23页
     ·目的片段的连接与转化第23-24页
     ·阳性克隆的筛选及测序第24-25页
     ·可培养菌的系统发育分析第25页
   ·结果与分析第25-32页
     ·柑橘组织中内生细菌的多样性第25-26页
     ·不同地区柑橘植株内生细菌的多样性第26-27页
     ·可培养兼性厌氧型内生细菌种类第27-32页
     ·内生细菌在病、健植株中的优势菌群第32页
     ·可培养内生细菌的系统发育分析第32页
   ·讨论第32-35页
3 PCR-DGGE 法分析柑橘内生细菌区系第35-52页
   ·实验材料第35-36页
     ·植物材料第35页
     ·主要试剂和仪器第35-36页
   ·实验方法第36-42页
     ·内生细菌基因组DNA 的提取第36页
     ·PCR 扩增细菌的16S rDNA 片段第36-38页
     ·PCR 产物的DGGE 分离第38-40页
     ·DGGE 分离条带的回收第40页
     ·16S rDNA 片段的PCR 再扩增和DGGE 分离第40页
     ·DGGE 条带的纯化和T-A 克隆第40-41页
     ·阳性克隆的鉴定和测序第41-42页
     ·内生细菌Shannon-Weaver 多样性指数计算第42页
     ·系统发育分析第42页
   ·实验结果第42-49页
     ·PCR 扩增内生菌的16S rDNA 片段第42-45页
     ·柑橘样品的DGGE 分离第45-48页
     ·内生细菌多样性分析第48-49页
     ·内生菌的系统发育分析第49页
   ·讨论第49-52页
4 结论与展望第52-54页
   ·病、健柑橘不同组织内生细菌多样性存在差异第52页
   ·病、健柑橘植株中的内生细菌优势菌属不同第52页
   ·定向分离培养与PCR-DGGE 的鉴定结果不一致第52-53页
   ·感黄龙病病果可作为黄龙病培养的首选材料第53页
   ·后续结果及展望第53-54页
致谢第54-55页
参考文献第55-59页
附录第59-62页
 A 作者在攻读学位期间发表的论文目录第59页
 B 作者在攻读硕士学位期间参加的科研项目第59-60页
 C 柑橘内生细菌形态及生理生化鉴定结果第60-62页

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