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IBA诱导下四倍体刺槐插穗生根的分子调控机制研究

摘要第6-9页
ABSTRACT第9-12页
前言第16-17页
第一章 文献综述第17-27页
    1.1 扦插繁殖研究第17页
    1.2 生根相关基因的研究进展第17-20页
        1.2.1 生长素影响植物生根相关基因的研究第18-19页
        1.2.2 IBA影响相关基因表达及其对生根的作用第19-20页
    1.3 扦插生根的重要MTA代谢通路及调控基因第20-23页
        1.3.1 MTA代谢通路第20-21页
        1.3.2 SAMS基因与生根调控第21-22页
        1.3.3 MTN基因与生根调控第22-23页
    1.4 转录组测序技术在非模式植物中的应用第23-24页
    1.5 四倍体刺槐扦插繁殖生根的研究进展第24-26页
        1.5.1 扦插繁殖第24页
        1.5.2 生理水平第24-25页
        1.5.3 蛋白水平第25-26页
    1.6 本研究的目的和意义第26-27页
第二章 SAMS和MTN的克隆、序列分析和亚细胞定位第27-54页
    2.1 材料与方法第27-35页
        2.1.1 组织样品的采取第27页
        2.1.2 RNA提取及cDNA的反转录第27-28页
        2.1.3 引物设计第28-29页
        2.1.4 SAMS和MTN基因的同源克隆第29-30页
        2.1.5 RACE技术克隆基因全长第30-31页
        2.1.6 SAMS和MTN基因序列分析第31-32页
        2.1.7 SAMS和MTN基因的亚细胞定位第32-35页
    2.2 结果与分析第35-52页
        2.2.1 四倍体刺槐总RNA的提取与质量检测第35-36页
        2.2.2 cDNA的制备第36页
        2.2.3 MTN和SAMS基因的同源克隆第36-37页
        2.2.4 MTN和SAMS基因的全长cDNA克隆第37-40页
        2.2.5 MTN和SAMS序列生物信息学分析第40-50页
        2.2.6 SAMS和MTN的亚细胞定位第50-52页
    2.3 讨论第52-53页
        2.3.1 SAMS和MTN基因全长的序列分析第52-53页
        2.3.2 SAMS和MTN的亚细胞定位第53页
    2.4 小结第53-54页
第三章 SAMS和MTN基因过表达载体的构建及拟南芥转化第54-61页
    3.1 材料与方法第54-56页
        3.1.1 菌株、质粒与拟南芥第54页
        3.1.2 转基因载体的构建第54-56页
        3.1.3 重组农杆菌工程菌株的制备第56页
        3.1.4 农杆菌介导基因转化拟南芥第56页
        3.1.5 转基因植株的分子鉴定第56页
    3.2 结果与分析第56-59页
        3.2.1 过表达载体的鉴定第56-58页
        3.2.2 转MTN基因植株的分子鉴定与表型分析第58页
        3.2.3 转SAMS基因植株的分子鉴定与表型分析第58-59页
    3.3 讨论第59-60页
        3.3.1 模式生物拟南芥第59-60页
        3.3.2 SAMS与生根调控第60页
    3.4 小结第60-61页
第四章 SAMS基因通过MTA代谢循环调控四倍体刺槐插穗生根第61-75页
    4.1 材料与方法第62-66页
        4.1.1 实验材料第62-63页
        4.1.2 RNA提取、cDNA的反转第63-64页
        4.1.3 同源克隆与定量引物设计第64页
        4.1.4 MTA代谢循环关键基因同源克隆第64-65页
        4.1.5 MTA代谢循环关键基因qPCR分析第65页
        4.1.6 MTA代谢循环关键酶和代谢产物含量分析第65-66页
        4.1.7 数据统计分析第66页
    4.2 结果与分析第66-73页
        4.2.1 总RNA的提取与质量检测第66页
        4.2.2 cDNA的制备与质量鉴定第66-67页
        4.2.3 MTA代谢循环关键基因的同源克隆第67-69页
        4.2.4 MTA代谢循环关键基因的时序表达第69-71页
        4.2.5 MTA代谢循环关键基因的组织表达谱第71页
        4.2.6 MTA代谢循环关键酶活性和产物测定第71-73页
    4.3 讨论第73-74页
        4.3.1 IBA处理四倍体刺槐嫩枝插穗促进SAMS基因的表达第73页
        4.3.2 SAMS基因通过MTA代谢循环调控生根第73-74页
    4.4 小结第74-75页
第五章 IBA诱导下四倍体刺槐插穗不定根发育过程中De novo测序比较分析第75-102页
    5.1 材料与方法第76-80页
        5.1.1 试验材料第76-77页
        5.1.2 RNA提取和分离第77页
        5.1.3 cDNA文库构建和Illumina/Solexa测序第77-78页
        5.1.4 序列分析和功能注释第78页
        5.1.5 SSR、SNP和LncRNA分析第78-79页
        5.1.6 基因表达量和共表达分析第79页
        5.1.7 qPCR验证分析第79-80页
    5.2 结果与分析第80-99页
        5.2.1 总RNA提取和检测结果第80-81页
        5.2.2 四倍体刺槐Illumina测序与序列分析第81-83页
        5.2.3 转录组功能注释及分类第83-86页
        5.2.4 SNP、SSRs和lncRNAs分析第86-88页
        5.2.5 不定根发育过程中的转录组变化第88-90页
        5.2.6 IBA处理组的不定根发育过程中的差异表达基因第90-92页
        5.2.7 差异基因的KEGG富集分析第92-95页
        5.2.8 IBA处理组和对照组4个阶段的转录组差异分析第95-97页
        5.2.9 定量PCR验证基因表达第97-99页
    5.3 讨论第99-101页
    5.4 小结第101-102页
第六章 结论和创新点第102-104页
    6.1 结论第102页
    6.2 创新点第102-103页
    6.3 研究展望第103-104页
参考文献第104-111页
附录第111-118页
致谢第118-119页
作者简介第119页

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