| 摘要 | 第6-9页 |
| ABSTRACT | 第9-12页 |
| 前言 | 第16-17页 |
| 第一章 文献综述 | 第17-27页 |
| 1.1 扦插繁殖研究 | 第17页 |
| 1.2 生根相关基因的研究进展 | 第17-20页 |
| 1.2.1 生长素影响植物生根相关基因的研究 | 第18-19页 |
| 1.2.2 IBA影响相关基因表达及其对生根的作用 | 第19-20页 |
| 1.3 扦插生根的重要MTA代谢通路及调控基因 | 第20-23页 |
| 1.3.1 MTA代谢通路 | 第20-21页 |
| 1.3.2 SAMS基因与生根调控 | 第21-22页 |
| 1.3.3 MTN基因与生根调控 | 第22-23页 |
| 1.4 转录组测序技术在非模式植物中的应用 | 第23-24页 |
| 1.5 四倍体刺槐扦插繁殖生根的研究进展 | 第24-26页 |
| 1.5.1 扦插繁殖 | 第24页 |
| 1.5.2 生理水平 | 第24-25页 |
| 1.5.3 蛋白水平 | 第25-26页 |
| 1.6 本研究的目的和意义 | 第26-27页 |
| 第二章 SAMS和MTN的克隆、序列分析和亚细胞定位 | 第27-54页 |
| 2.1 材料与方法 | 第27-35页 |
| 2.1.1 组织样品的采取 | 第27页 |
| 2.1.2 RNA提取及cDNA的反转录 | 第27-28页 |
| 2.1.3 引物设计 | 第28-29页 |
| 2.1.4 SAMS和MTN基因的同源克隆 | 第29-30页 |
| 2.1.5 RACE技术克隆基因全长 | 第30-31页 |
| 2.1.6 SAMS和MTN基因序列分析 | 第31-32页 |
| 2.1.7 SAMS和MTN基因的亚细胞定位 | 第32-35页 |
| 2.2 结果与分析 | 第35-52页 |
| 2.2.1 四倍体刺槐总RNA的提取与质量检测 | 第35-36页 |
| 2.2.2 cDNA的制备 | 第36页 |
| 2.2.3 MTN和SAMS基因的同源克隆 | 第36-37页 |
| 2.2.4 MTN和SAMS基因的全长cDNA克隆 | 第37-40页 |
| 2.2.5 MTN和SAMS序列生物信息学分析 | 第40-50页 |
| 2.2.6 SAMS和MTN的亚细胞定位 | 第50-52页 |
| 2.3 讨论 | 第52-53页 |
| 2.3.1 SAMS和MTN基因全长的序列分析 | 第52-53页 |
| 2.3.2 SAMS和MTN的亚细胞定位 | 第53页 |
| 2.4 小结 | 第53-54页 |
| 第三章 SAMS和MTN基因过表达载体的构建及拟南芥转化 | 第54-61页 |
| 3.1 材料与方法 | 第54-56页 |
| 3.1.1 菌株、质粒与拟南芥 | 第54页 |
| 3.1.2 转基因载体的构建 | 第54-56页 |
| 3.1.3 重组农杆菌工程菌株的制备 | 第56页 |
| 3.1.4 农杆菌介导基因转化拟南芥 | 第56页 |
| 3.1.5 转基因植株的分子鉴定 | 第56页 |
| 3.2 结果与分析 | 第56-59页 |
| 3.2.1 过表达载体的鉴定 | 第56-58页 |
| 3.2.2 转MTN基因植株的分子鉴定与表型分析 | 第58页 |
| 3.2.3 转SAMS基因植株的分子鉴定与表型分析 | 第58-59页 |
| 3.3 讨论 | 第59-60页 |
| 3.3.1 模式生物拟南芥 | 第59-60页 |
| 3.3.2 SAMS与生根调控 | 第60页 |
| 3.4 小结 | 第60-61页 |
| 第四章 SAMS基因通过MTA代谢循环调控四倍体刺槐插穗生根 | 第61-75页 |
| 4.1 材料与方法 | 第62-66页 |
| 4.1.1 实验材料 | 第62-63页 |
| 4.1.2 RNA提取、cDNA的反转 | 第63-64页 |
| 4.1.3 同源克隆与定量引物设计 | 第64页 |
| 4.1.4 MTA代谢循环关键基因同源克隆 | 第64-65页 |
| 4.1.5 MTA代谢循环关键基因qPCR分析 | 第65页 |
| 4.1.6 MTA代谢循环关键酶和代谢产物含量分析 | 第65-66页 |
| 4.1.7 数据统计分析 | 第66页 |
| 4.2 结果与分析 | 第66-73页 |
| 4.2.1 总RNA的提取与质量检测 | 第66页 |
| 4.2.2 cDNA的制备与质量鉴定 | 第66-67页 |
| 4.2.3 MTA代谢循环关键基因的同源克隆 | 第67-69页 |
| 4.2.4 MTA代谢循环关键基因的时序表达 | 第69-71页 |
| 4.2.5 MTA代谢循环关键基因的组织表达谱 | 第71页 |
| 4.2.6 MTA代谢循环关键酶活性和产物测定 | 第71-73页 |
| 4.3 讨论 | 第73-74页 |
| 4.3.1 IBA处理四倍体刺槐嫩枝插穗促进SAMS基因的表达 | 第73页 |
| 4.3.2 SAMS基因通过MTA代谢循环调控生根 | 第73-74页 |
| 4.4 小结 | 第74-75页 |
| 第五章 IBA诱导下四倍体刺槐插穗不定根发育过程中De novo测序比较分析 | 第75-102页 |
| 5.1 材料与方法 | 第76-80页 |
| 5.1.1 试验材料 | 第76-77页 |
| 5.1.2 RNA提取和分离 | 第77页 |
| 5.1.3 cDNA文库构建和Illumina/Solexa测序 | 第77-78页 |
| 5.1.4 序列分析和功能注释 | 第78页 |
| 5.1.5 SSR、SNP和LncRNA分析 | 第78-79页 |
| 5.1.6 基因表达量和共表达分析 | 第79页 |
| 5.1.7 qPCR验证分析 | 第79-80页 |
| 5.2 结果与分析 | 第80-99页 |
| 5.2.1 总RNA提取和检测结果 | 第80-81页 |
| 5.2.2 四倍体刺槐Illumina测序与序列分析 | 第81-83页 |
| 5.2.3 转录组功能注释及分类 | 第83-86页 |
| 5.2.4 SNP、SSRs和lncRNAs分析 | 第86-88页 |
| 5.2.5 不定根发育过程中的转录组变化 | 第88-90页 |
| 5.2.6 IBA处理组的不定根发育过程中的差异表达基因 | 第90-92页 |
| 5.2.7 差异基因的KEGG富集分析 | 第92-95页 |
| 5.2.8 IBA处理组和对照组4个阶段的转录组差异分析 | 第95-97页 |
| 5.2.9 定量PCR验证基因表达 | 第97-99页 |
| 5.3 讨论 | 第99-101页 |
| 5.4 小结 | 第101-102页 |
| 第六章 结论和创新点 | 第102-104页 |
| 6.1 结论 | 第102页 |
| 6.2 创新点 | 第102-103页 |
| 6.3 研究展望 | 第103-104页 |
| 参考文献 | 第104-111页 |
| 附录 | 第111-118页 |
| 致谢 | 第118-119页 |
| 作者简介 | 第119页 |
