六种园蛛线粒体全基因组序列测定及其进化分析
致谢 | 第6-7页 |
摘要 | 第7-9页 |
Abstract | 第9-10页 |
1 绪论 | 第14-25页 |
1.1 线粒体基因组 | 第14-16页 |
1.1.1 线粒体生物学 | 第14页 |
1.1.2 线粒体基因组 | 第14-15页 |
1.1.3 线粒体基因组在进化分析中的应用 | 第15-16页 |
1.2 蜘蛛线粒体基因组 | 第16-23页 |
1.2.1 蜘蛛线粒体基因组特征 | 第16-19页 |
1.2.1.1 蛋白质编码基因(PCGs) | 第16-17页 |
1.2.1.2 tRNA和rRNA基因 | 第17-18页 |
1.2.1.3 控制区 | 第18页 |
1.2.1.4 基因定向和排序 | 第18-19页 |
1.2.2 基于线粒体基因组的蜘蛛系统发育研究 | 第19-23页 |
1.2.2.1 蜘蛛的分类 | 第19-22页 |
1.2.2.2 蜘蛛目线粒体基因组研究进展 | 第22-23页 |
1.3 课题的研究背景和意义 | 第23-25页 |
1.3.1 研究物种的介绍 | 第23-24页 |
1.3.2 研究的背景和意义 | 第24-25页 |
2 材料与方法 | 第25-33页 |
2.1 实验材料 | 第25-27页 |
2.1.1 样本采集和物种鉴定 | 第25页 |
2.1.2 实验主要仪器 | 第25-26页 |
2.1.3 实验主要试剂 | 第26-27页 |
2.1.4 生物信息学软件 | 第27页 |
2.2 实验方法 | 第27-31页 |
2.2.1 总DNA的提取和检测 | 第27-28页 |
2.2.2 引物的设计 | 第28-29页 |
2.2.3 PCR扩增和产物纯化 | 第29-30页 |
2.2.4 PCR产物的克隆和测序 | 第30-31页 |
2.2.5 线粒体基因组序列拼接、注释和分析 | 第31页 |
2.3 系统发育分析 | 第31-33页 |
3 结果分析与讨论 | 第33-60页 |
3.1 六种园蛛线粒体基因组结构特征 | 第33-54页 |
3.1.1 基因组的序列结构 | 第33-43页 |
3.1.2 碱基组成 | 第43页 |
3.1.3 蛋白编码基因和密码子使用 | 第43-50页 |
3.1.4 tRNA和rRNA | 第50-51页 |
3.1.5 控制区 | 第51-53页 |
3.1.6 基因定向和排序 | 第53-54页 |
3.2 蛛形纲系统发育分析与讨论 | 第54-60页 |
3.2.1 建树结果 | 第54-57页 |
3.2.2 系统发育分析和讨论 | 第57-60页 |
4 结论与展望 | 第60-63页 |
4.1 课题结论 | 第60-62页 |
4.2 课题展望 | 第62-63页 |
参考文献 | 第63-71页 |
附表1 GenBank中收录的蛛形纲物种信息 | 第71-77页 |
附图1 六种园蛛线粒体基因组的tRNA二级结构图 | 第77-83页 |
作者简介 | 第83-84页 |