| 中文摘要 | 第4-8页 |
| abstract | 第8-11页 |
| 英文缩写词表 | 第15-18页 |
| 第1章 绪论 | 第18-40页 |
| 1.1 胃癌的研究现状 | 第18-20页 |
| 1.2 转录组学与转录组测序 | 第20-29页 |
| 1.2.1 转录组学 | 第20-22页 |
| 1.2.2 核苷酸测序技术 | 第22-27页 |
| 1.2.3 转录组测序及数据处理 | 第27-29页 |
| 1.3 长链非编码RNA | 第29-37页 |
| 1.3.1 长链非编码RNA概述 | 第29-34页 |
| 1.3.2 长链非编码RNA与恶性肿瘤 | 第34-35页 |
| 1.3.3 长链非编码RNA与胃癌 | 第35-37页 |
| 1.4 本论文的立题依据 | 第37-40页 |
| 第2章 基于RNA-seq数据构建胃癌基因差异表达谱 | 第40-56页 |
| 2.1 引言 | 第40页 |
| 2.2 材料方法 | 第40-47页 |
| 2.2.1 RNA-seq数据来源 | 第40-41页 |
| 2.2.2 数据预处理与读段定位 | 第41-44页 |
| 2.2.3 长链非编码RNA的预测 | 第44-45页 |
| 2.2.4 差异表达基因的筛选 | 第45-47页 |
| 2.3 分析结果 | 第47-52页 |
| 2.3.1 LncRNA预测结果 | 第47页 |
| 2.3.2 差异表达基因的筛选结果 | 第47-52页 |
| 2.4 讨论 | 第52-54页 |
| 2.5 本章小结 | 第54-56页 |
| 第3章 胃癌差异表达基因的功能富集及分子互作网络分析 | 第56-84页 |
| 3.1 引言 | 第56页 |
| 3.2 材料方法 | 第56-62页 |
| 3.2.1 基因集功能富集分析 | 第56-57页 |
| 3.2.2 蛋白质互作网络分析 | 第57-61页 |
| 3.2.3 LncRNA分析 | 第61-62页 |
| 3.3 分析结果 | 第62-76页 |
| 3.3.1 差异表达基因的富集分析结果 | 第62页 |
| 3.3.2 差异表达蛋白质的互作网络分析结果 | 第62-72页 |
| 3.3.3 差异表达lncRNA的功能分析结果 | 第72-76页 |
| 3.4 讨论 | 第76-82页 |
| 3.5 本章小结 | 第82-84页 |
| 第4章 长链非编码RNA TCONS_00068220功能的初步验证 | 第84-112页 |
| 4.1 引言 | 第84页 |
| 4.2 实验材料 | 第84-87页 |
| 4.2.1 临床标本 | 第84-85页 |
| 4.2.2 细胞系 | 第85页 |
| 4.2.3 主要仪器 | 第85-86页 |
| 4.2.4 主要试剂及耗材 | 第86-87页 |
| 4.3 实验方法 | 第87-101页 |
| 4.3.1 细胞培养 | 第87-88页 |
| 4.3.2 组织及细胞总RNA的抽提 | 第88-89页 |
| 4.3.3 逆转录 | 第89页 |
| 4.3.4 荧光实时定量PCR | 第89-91页 |
| 4.3.5 TCONS_00068220基因合成 | 第91页 |
| 4.3.6 重组质粒转化到大肠埃希菌 | 第91-92页 |
| 4.3.7 质粒的提取 | 第92-93页 |
| 4.3.8 重组质粒的测序及酶切电泳鉴定 | 第93页 |
| 4.3.9 插入目的载体 | 第93页 |
| 4.3.10 重组质粒转化到大肠埃希菌 | 第93页 |
| 4.3.11 挑选单克隆，提取质粒进行测序及酶切电泳鉴定 | 第93-94页 |
| 4.3.12 中量提取质粒 | 第94-95页 |
| 4.3.13 siRNA的制备 | 第95页 |
| 4.3.14 细胞转染 | 第95-96页 |
| 4.3.15 TCONS_00068220的过表达和干扰表达效果验证 | 第96页 |
| 4.3.16 细胞凋亡检测 | 第96页 |
| 4.3.17 细胞周期检测 | 第96-97页 |
| 4.3.18 台盼蓝染色 | 第97页 |
| 4.3.19 DAPI染色法检测细胞凋亡 | 第97-98页 |
| 4.3.20 Western Blot检测caspase-3蛋白的表达 | 第98-100页 |
| 4.3.21 统计分析 | 第100-101页 |
| 4.4 分析结果 | 第101-107页 |
| 4.4.1 TCONS_00068220在组织及细胞系中的表达水平 | 第101-102页 |
| 4.4.2 TCONS_00068220真核表达质粒构建结果 | 第102-103页 |
| 4.4.3 TCONS_00068220的过表达和干扰表达效果 | 第103-104页 |
| 4.4.4 细胞凋亡检测结果 | 第104-105页 |
| 4.4.5 细胞周期检测结果 | 第105页 |
| 4.4.6 台盼蓝染色检测细胞活性 | 第105页 |
| 4.4.7 凋亡细胞染色及caspase-3蛋白表达量的检测 | 第105-107页 |
| 4.5 讨论 | 第107-110页 |
| 4.6 本章小结 | 第110-112页 |
| 第5章 结论 | 第112-114页 |
| 参考文献 | 第114-130页 |
| 作者简介及科研成果 | 第130-132页 |
| 致谢 | 第132-133页 |
