| 摘要 | 第3-5页 |
| Abstract | 第5-6页 |
| 第1章 前言 | 第9-17页 |
| 1.1 线粒体及线粒体基因组 | 第9-10页 |
| 1.1.1 线粒体的起源进化及形态结构 | 第9页 |
| 1.1.2 线粒体基因组的主要特征 | 第9-10页 |
| 1.2 线粒体基因组各组分特征 | 第10-11页 |
| 1.3 线粒体基因组的分子生物学研究策略 | 第11-12页 |
| 1.4 系统发育分析 | 第12-14页 |
| 1.5 分类单元及研究物种介绍 | 第14-15页 |
| 1.5.1 无尾目简介及线粒体基因组研究进展 | 第14页 |
| 1.5.2 宁陕齿突蟾和六盘齿突蟾介绍 | 第14-15页 |
| 1.6 本研究的目的及意义 | 第15-17页 |
| 第2章 实验材料与方法 | 第17-25页 |
| 2.1 实验材料和方法 | 第17-18页 |
| 2.1.1 实验材料 | 第17页 |
| 2.1.2 实验仪器和试剂 | 第17页 |
| 2.1.3 实验方法 | 第17-18页 |
| 2.2 引物设计与PCR扩增及测序 | 第18-22页 |
| 2.3 数据处理及结果分析 | 第22-23页 |
| 2.4 系统发育分析 | 第23-25页 |
| 第3章 宁陕齿突蟾和六盘齿突蟾线粒体基因组的基本特征 | 第25-41页 |
| 3.1 宁陕齿突蟾线粒体基因组的基本特征 | 第25-33页 |
| 3.1.1 基因组的结构 | 第25-27页 |
| 3.1.2 碱基偏向性分析 | 第27-28页 |
| 3.1.3 蛋白质编码基因及其密码子的使用 | 第28-29页 |
| 3.1.4 tRNA基因和rRNA基因 | 第29-33页 |
| 3.1.5 控制区及转录复制起点 | 第33页 |
| 3.2 六盘齿突蟾线粒体基因组的基本特征 | 第33-41页 |
| 3.2.1 基因组的结构 | 第33-35页 |
| 3.2.2 碱基偏向性分析 | 第35-36页 |
| 3.2.3 蛋白质编码基因 | 第36-37页 |
| 3.2.4 tRNA基因与rRNA基因 | 第37-40页 |
| 3.2.5 控制区及转录复制起点 | 第40-41页 |
| 第4章 中蛙亚目动物线粒体基因组的比较分析 | 第41-55页 |
| 4.1 序列长度变异 | 第41-42页 |
| 4.2 线粒体全基因组的碱基组成情况 | 第42-45页 |
| 4.2.1 线粒体全基因组的碱基组成 | 第42-43页 |
| 4.2.2 中蛙亚目线粒体正反链编码基因碱基统计 | 第43-45页 |
| 4.3 中蛙亚目线粒体基因组蛋白质编码基因(PCGs)碱基组成 | 第45-49页 |
| 4.4 中蛙亚目线粒体基因组密码子使用偏好研究 | 第49-55页 |
| 第5章 中蛙亚目系统发育关系分析 | 第55-69页 |
| 5.1 系统发育信号数据集序列组成及系统发育树构建 | 第57-65页 |
| 5.1.1 最大简约法(MP法) | 第57-60页 |
| 5.1.2 最大似然法(ML法) | 第60-62页 |
| 5.1.3 贝叶斯推论法(BI法) | 第62-65页 |
| 5.2 系统发育结果分析与讨论 | 第65-69页 |
| 第6章 结论 | 第69-71页 |
| 参考文献 | 第71-79页 |
| 致谢 | 第79-81页 |
| 攻读硕士学位期间研究成果 | 第81页 |
