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森林草莓短果突变体鉴定及差异表达基因分析

摘要第10-12页
Abstract第12-13页
缩略词第14-15页
第一章 文献综述第15-26页
    1.1 果形遗传研究进展第15-17页
        1.1.1 果形评价方法第15-16页
        1.1.2 果实形状的遗传分析第16页
        1.1.3 果形遗传相关基因研究第16-17页
    1.2 GA研究进展第17-22页
        1.2.1 GA的生物学功能第17-18页
        1.2.2 GA的生物合成途径第18-19页
        1.2.3 GA代谢循环中的关键酶基因第19-20页
        1.2.4 GA信号转导研究第20-21页
        1.2.5 GA矮化突变体的研究第21-22页
    1.3 转录组测序技术的发展与应用第22-24页
        1.3.1 转录组测序技术的发展第22-23页
        1.3.2 转录组测序技术在果树研究中的应用第23-24页
    1.4 细胞色素P450研究进展第24-25页
    1.5 本研究的目的意义第25-26页
第二章 草莓短果突变体的鉴定第26-38页
    2.1 材料与方法第26-29页
        2.1.1 植物材料第26页
        2.1.2 试验方法第26-29页
    2.2 结果与分析第29-35页
        2.2.1 表型鉴定第29-30页
        2.2.2 光合特性相关指标测定第30-31页
        2.2.3 花粉活力分析第31页
        2.2.4 组织细胞观察第31-32页
        2.2.5 遗传规律分析第32-33页
        2.2.6 内源赤霉素含量分析第33页
        2.2.7 外源赤霉素反应分析第33-35页
    2.3 讨论第35-37页
        2.3.1 草莓突变体果实变短的原因分析第35-36页
        2.3.2 草莓短果突变体的遗传分析第36-37页
    2.4 小结第37-38页
第三章 短果突变体和野生型基因差异表达分析第38-59页
    3.1 材料与方法第38-43页
        3.1.1 试验材料第38页
        3.1.2 主要试剂第38页
        3.1.3 样品中总RNA的提取第38-39页
        3.1.4 转录组的高通量测序第39-40页
        3.1.5 生物信息学分析第40-42页
        3.1.6 qRT-PCR验证第42-43页
    3.2 结果与分析第43-57页
        3.2.1 RNA质量第43页
        3.2.2 测序数据及其质量控制第43页
        3.2.3 转录组数据与参考基因组序列比对第43-44页
        3.2.4 差异表达分析第44-46页
        3.2.5 差异表达基因功能注释和富集分析第46-50页
        3.2.6 赤霉素合成相关基因分析第50-53页
        3.2.7 qRT-PCR对转录组数据的验证第53-57页
    3.3 讨论第57-58页
        3.3.1 转录组数据的可靠性分析第57页
        3.3.2 赤霉素合成途径相关差异表达基因分析第57-58页
    3.4 小结第58-59页
第四章 草莓CYP714C2基因的克隆与分析第59-83页
    4.1 材料与方法第59-69页
        4.1.1 植物材料第59页
        4.1.2 主要试剂第59页
        4.1.3 草莓果实DNA和RNA提取及检测第59-61页
        4.1.4 目的片段碱基序列分析第61页
        4.1.5 目的片段的PCR扩增第61-62页
        4.1.6 PCR特异片段的回收第62页
        4.1.7 PCR胶回收产物与载体的重组连接第62页
        4.1.8 重组质粒DNA转化大肠杆菌及测序第62-63页
        4.1.9 FvCYP714C2基因在草莓不同组织中的qRT-PCR表达分析第63页
        4.1.10 草莓FvCYP714C2基因植物过量表达载体的构建第63-65页
        4.1.11 草莓FvCYP714C2过量表达载体转化农杆菌第65-67页
        4.1.12 草莓FvCYP714C2基因拟南芥遗传转化第67-68页
        4.1.13 草莓FvCYP714C2转基因拟南芥株系的检测第68页
        4.1.14 草莓FvCYP714C2基因拟南芥过表达分析第68-69页
        4.1.15 草莓FvCYP714C2转基因拟南芥株系赤霉素含量测定第69页
        4.1.16 草莓FvCYP714C2转基因拟南芥株系的表型分析第69页
    4.2 结果与分析第69-80页
        4.2.1 核酸质量检测第69-71页
        4.2.2 草莓FvCYP714C2基因的克隆与序列分析第71-76页
        4.2.3 草莓FvCYP714C2在各个组织器官的表达分析第76页
        4.2.4 草莓FvCYP714C2基因植物过量表达载体的构建及遗传转化第76-78页
        4.2.5 草莓FvCYP714C2转基因拟南芥植株的PCR鉴定第78页
        4.2.6 草莓FvCYP714C2转基因拟南芥植株的qRT-PCR分析第78页
        4.2.7 草莓FvCYP714C2转基因拟南芥株系赤霉素含量分析第78-79页
        4.2.8 草莓FvCYP714C2转基因拟南芥株系表型分析第79-80页
    4.3 讨论第80-82页
        4.3.1 草莓FvCYP714C2基因的克隆与分析第80-81页
        4.3.2 草莓FvCYP714C2基因的表达第81页
        4.3.3 草莓FvCYP714C2基因的功能分析第81-82页
    4.4 小结第82-83页
第五章 全文结论及创新点第83-84页
    5.1 全文结论第83页
    5.2 创新点第83-84页
参考文献第84-95页
附录第95-100页
致谢第100-101页
攻读博士学位期间发表的论文第101页

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