团头鲂池塘养殖系统菌群结构及组成多样性研究
| 摘要 | 第1-8页 |
| ABSTRACT | 第8-10页 |
| 第一章 文献综述 | 第10-22页 |
| 1 鱼类养殖池塘中菌群的作用 | 第10-11页 |
| 2 PCR-DGGE指纹技术 | 第11-16页 |
| ·PCR-DGGE技术的基本原理及优缺点 | 第12-14页 |
| ·PCR-DGGE技术的基本原理 | 第12页 |
| ·PCR-DGGE技术存在的优缺点 | 第12-14页 |
| ·PCR-DGGE的技术路线及技术优化 | 第14-15页 |
| ·PCR-DGGE的技术路线 | 第14页 |
| ·PCR-DGGE的技术优化 | 第14-15页 |
| ·DGGE指纹图谱的研究方法 | 第15-16页 |
| ·传统研究方法 | 第15页 |
| ·核酸分析技术 | 第15页 |
| ·基于PCR的衍生技术 | 第15-16页 |
| 3 PCR-DGGE在环境细菌方面的应用 | 第16-20页 |
| ·PCR-DGGE在水体细菌多样性中的应用 | 第16-18页 |
| ·PCR-DGGE在沉积物细菌多样性中的应用 | 第18-20页 |
| 4 本课题的研究内容及意义 | 第20-21页 |
| 5 本课题的技术路线 | 第21-22页 |
| 第二章 团头鲂养殖系统水体菌群结构及组成分析 | 第22-52页 |
| 1 实验材料及方法 | 第22-27页 |
| ·实验材料 | 第22-23页 |
| ·实验仪器 | 第22页 |
| ·实验试剂 | 第22-23页 |
| ·实验方法 | 第23-27页 |
| ·取样点描述 | 第23页 |
| ·样品采集 | 第23-24页 |
| ·水体中总DNA的提取 | 第24页 |
| ·16S rDNA V3可变区的PCR扩增 | 第24-25页 |
| ·变性梯度凝胶电泳 | 第25-26页 |
| ·DGGE图谱中优势条带的回收及测序 | 第26-27页 |
| 2 实验结果 | 第27-48页 |
| ·DNA提取结果 | 第27页 |
| ·V3区PCR扩增结果 | 第27-28页 |
| ·细菌群落的DGGE图谱分析 | 第28-35页 |
| ·DGGE条带序列测定及细菌群落系统发育分析 | 第35-48页 |
| 3 讨论 | 第48-52页 |
| ·菌群的基本结构特征分析 | 第48-49页 |
| ·菌群的多样性组成及分布特征分析 | 第49-52页 |
| 第三章 团头鲂养殖池塘底泥菌群结构及组成分析 | 第52-77页 |
| 1 实验材料与方法 | 第52-53页 |
| ·实验材料 | 第52页 |
| ·实验样品 | 第52页 |
| ·实验主要仪器及试剂 | 第52页 |
| ·实验方法 | 第52-53页 |
| ·底泥样品的采集及取样点描述 | 第52-53页 |
| ·底泥样品细菌基因组总DNA的提取 | 第53页 |
| ·细菌16SrDNA V3可变区的PCR扩增 | 第53页 |
| ·变性梯度凝胶电泳 | 第53页 |
| ·DGGE图谱中优势条带的回收及测序 | 第53页 |
| ·数据分析 | 第53页 |
| 2 实验结果 | 第53-73页 |
| ·DNA提取结果 | 第53-54页 |
| ·V3区扩增结果 | 第54页 |
| ·细菌群落的DGGE电泳结果 | 第54-60页 |
| ·16SrDNA基因序列及系统发育分析 | 第60-73页 |
| 3 讨论 | 第73-77页 |
| ·底泥样品DNA的提取与PCR扩增 | 第73-74页 |
| ·菌群基本结构特征分析 | 第74-75页 |
| ·菌群的多样性组成及分布特征分析 | 第75-77页 |
| 全文总结 | 第77-78页 |
| 参考文献 | 第78-86页 |
| 致谢 | 第86-87页 |
| 科研情况 | 第87页 |
