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牛樟芝MVA途径中基因克隆及转录组、代谢组研究

缩略词第1-11页
摘要第11-14页
Abstract第14-18页
第一章 引言第18-40页
   ·牛樟芝国内外研究现状第18-22页
     ·牛樟芝成分分析及控制第19-20页
     ·牛樟芝药理学研究第20-21页
     ·牛樟芝栽培条件的研究第21页
     ·牛樟芝分子生物学的研究第21-22页
   ·牛樟芝三萜类化合物研究进展第22-29页
     ·三萜结构类型及合成途径第22-24页
     ·MVA途径中关键酶的研究第24-26页
     ·牛樟芝三萜类化合物药理作用的研究第26-29页
     ·培养条件对牛樟芝三萜含量的影响第29页
   ·转录组学研究进展第29-33页
     ·转录组学基本定义第29页
     ·转录组学研究基本方法第29-32页
     ·转录组学在微生物研究中的应用第32-33页
   ·代谢组学研究进展第33-35页
     ·代谢组学基本定义第33页
     ·代谢组学研究基本方法第33-34页
     ·代谢组学在微生物研究中的应用第34-35页
   ·本研究内容及意义第35-40页
     ·研究内容第36-37页
     ·技术路线第37-39页
     ·研究目的及意义第39-40页
第二章 牛樟芝菌种鉴定及遗传转化体系的构建第40-64页
   ·材料与仪器第41-42页
     ·实验材料第41页
     ·实验试剂第41页
     ·实验仪器第41页
     ·培养基第41-42页
     ·主要试剂配制方法第42页
   ·方法第42-48页
     ·供试菌株分子生物学鉴定第42-44页
     ·供试菌株菌丝体三萜提取及含量测定第44-45页
     ·牛樟芝AC001生物学特性研究第45页
     ·牛樟芝遗传转化体系的建立第45-48页
     ·数据分析第48页
   ·结果与分析第48-62页
     ·供试菌株分子生物学鉴定第48-52页
     ·供试菌株菌丝体三萜含量测定第52-54页
     ·牛樟芝AC001生物学特性研究第54-57页
     ·牛樟芝遗传转化体系的建立及验证第57-62页
   ·讨论第62-63页
   ·小结第63-64页
第三章 响应面筛选牛樟芝菌丝体液体培养基的研究第64-88页
   ·材料与仪器第64-65页
     ·实验材料第64页
     ·实验试剂第64-65页
     ·实验仪器第65页
   ·方法第65-69页
     ·菌种制备及培养第65页
     ·响应面优化液体发酵生产牛樟芝菌丝体的研究第65-67页
     ·响应面优化液体发酵牛樟芝菌丝体三萜含量的研究第67-69页
     ·数据分析第69页
   ·结果与分析第69-85页
     ·响应面优化液体发酵生产牛樟芝菌丝体结果与分析第69-80页
     ·响应面优化牛樟芝液体发酵菌丝体三萜含量结果与分析第80-85页
   ·讨论第85-87页
   ·小结第87-88页
第四章 牛樟芝中甲羟戊酸焦磷酸脱羧酶基因、鲨烯环氧酶基因克隆及表达分析第88-115页
   ·材料与仪器第88-89页
     ·实验材料第88页
     ·实验试剂第88-89页
     ·实验仪器第89页
   ·方法第89-96页
     ·gDNA\RNA提取及cDNA合成第89页
     ·RACE扩增牛樟芝甲羟戊酸焦磷酸脱羧酶基因(mvd)第89-93页
     ·RACE扩增牛樟芝鲨烯环氧酶基因(se)第93-94页
     ·mvd和se生物信息学分析第94-95页
     ·不同培养阶段牛樟芝菌丝体和子实体三萜含量及mvd和se表达分析第95-96页
   ·结果与分析第96-113页
     ·牛樟芝mvd克隆及生物信息学分析第96-104页
     ·牛樟芝se克隆及生物信息学分析第104-111页
     ·不同培养阶段牛樟芝菌丝体和子实体三萜含量分析第111页
     ·不同培养阶段牛樟芝子实体与菌丝体mvd和se表达量分析第111-113页
   ·讨论第113-114页
   ·小结第114-115页
第五章 不同培养时间牛樟芝菌丝体和子实体转录组的研究第115-132页
   ·材料与仪器第115-116页
     ·实验材料第115页
     ·实验试剂第115页
     ·实验仪器第115-116页
   ·方法第116-118页
     ·样品RNA提取及检测第116页
     ·RNA文库构建第116页
     ·文库质量控制及建立第116页
     ·转录组功能注释及差异基因、代谢通路分析第116-117页
     ·管家基因筛选及验证第117-118页
     ·三萜合成途径中差异基因表达分析及验证第118页
   ·结果与分析第118-130页
     ·测序数据质量控制及组装第119页
     ·基因功能注释及差异基因分析第119-121页
     ·差异表达基因GO功能富集及KEGG注释分析第121-125页
     ·管家基因筛选及验证第125-128页
     ·三萜合成途径中差异基因表达分析及验证第128-130页
   ·讨论第130-131页
   ·小结第131-132页
第六章 不同培养时间牛樟芝菌丝体和子实体代谢组的研究第132-172页
   ·材料与仪器第132页
     ·实验材料第132页
     ·实验试剂第132页
     ·实验仪器第132页
   ·实验方法第132-134页
     ·实验方法第132-133页
     ·色谱条件第133页
     ·数据处理第133-134页
   ·结果与分析第134-162页
     ·主成分分析(PCA)第135-136页
     ·偏最小二乘法-判别分析(PLS-DA)第136-138页
     ·正交偏最小二乘法-判别分析(OPLS-DA)第138-139页
     ·各实验组差异代谢物的筛选和鉴定第139-162页
   ·讨论第162-171页
     ·代谢组差异生物标志物类别比较与分析第162-163页
     ·代谢组差异生物标志物比较与分析第163-165页
     ·代谢组与转录组数据整合分析第165-171页
   ·小结第171-172页
第七章 全文总结与展望第172-175页
   ·全文总结第172-173页
   ·创新点第173页
   ·本研究不足第173-174页
   ·展望第174-175页
参考文献第175-188页
附录第188-193页
相关成果第193-194页
致谢第194页

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