论文主要创新点 | 第1-8页 |
摘要 | 第8-10页 |
Abstract | 第10-13页 |
缩写符号 Abbreviations | 第13-15页 |
第一章 研究背景 | 第15-41页 |
·着丝粒研究进展 | 第15-36页 |
·着丝粒蛋白研究进展 | 第16-23页 |
·着丝粒DNA研究进展 | 第23-31页 |
·着丝粒的表观遗传研究进展 | 第31-33页 |
·着丝粒蛋白和DNA序列研究方法 | 第33-36页 |
·莲藕基因组研究进展 | 第36-39页 |
·莲藕分子标记研究进展 | 第37-38页 |
·莲藕基因组草图的构建 | 第38-39页 |
·本研究的目的和意义 | 第39-41页 |
第二章 NnCenH3基因的克隆与细胞核定位 | 第41-63页 |
引言 | 第41页 |
·实验材料 | 第41页 |
·实验方法 | 第41-53页 |
·莲藕总RNA提取 | 第41-42页 |
·NnCenH3克隆 | 第42-49页 |
·NnCenH3表达载体构建及原核表达 | 第49-50页 |
·NnCenH3多克隆抗体制备及验证 | 第50-52页 |
·NnCenH3免疫荧光检测 | 第52-53页 |
·实验结果 | 第53-60页 |
·莲藕叶片组织总RNA提取 | 第53页 |
·NnCenH3基因同源克隆 | 第53-56页 |
·NnCenH3基因体外表达 | 第56页 |
·NnCenH3抗体制备 | 第56-59页 |
·NnCenH3蛋白细胞核定位 | 第59-60页 |
·讨论 | 第60-63页 |
第三章 NnCenH3相关着丝粒DNA序列研究 | 第63-91页 |
引言 | 第63页 |
·实验材料 | 第63页 |
·实验方法 | 第63-70页 |
·莲藕基因组重复序列分析 | 第63页 |
·染色质免疫共沉淀(ChIP) | 第63-65页 |
·ChIP测序 | 第65-70页 |
·实验结果 | 第70-87页 |
·莲藕基因组重复序列分析 | 第70页 |
·NnCenH3相关序列在基因组上的精确分布 | 第70-74页 |
·NnCenH3核小体相关基因研究 | 第74-78页 |
·NnCenH3核小体相关重复序列研究 | 第78-87页 |
·讨论 | 第87-91页 |
·基因在NnCenH3核小体内以低密度低转录活性的形式存在 | 第87页 |
·Ty1/copia类型LTR反转录转座子是着丝粒重复序列的主要组成成分 | 第87-88页 |
·莲藕着丝粒重复序列在染色体上呈现多种分布模式 | 第88-91页 |
第四章 研究工作总结和展望 | 第91-92页 |
附录1 主要实验试剂、仪器及试剂配方 | 第92-98页 |
附录2 本研究所使用的引物 | 第98-103页 |
附录3 莲藕基因组重复序列组成 | 第103-115页 |
附录4 ChIPed reads、基因、反转录转座子在莲藕染色体上的分布 | 第115-121页 |
附录5 CBS相关基因转录组数据 | 第121-127页 |
附录6 NNU_16348、NNU_02585、NNU-07763和NNU_19813基因及其同源基因序列比对 | 第127-130页 |
参考文献 | 第130-145页 |
在读期间发表和待发表的论文 | 第145-146页 |
致谢 | 第146-147页 |