| 摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-10页 |
| 第1章 引言 | 第10-23页 |
| ·转录组测序的发展与应用 | 第10-16页 |
| ·转录组与转录组学 | 第10页 |
| ·测序技术的发展 | 第10-15页 |
| ·转录组测序的应用 | 第15-16页 |
| ·拟穴青蟹性腺发育相关基因研究进展 | 第16-20页 |
| ·拟穴青蟹简介 | 第16-17页 |
| ·性腺发育研究进展 | 第17-20页 |
| ·本研究的目的与意义 | 第20-22页 |
| ·本课题的研究内容与技术路线 | 第22-23页 |
| ·主要研究内容 | 第22页 |
| ·主要技术路线 | 第22-23页 |
| 第2章 基于 454 GS FLX高通量测序的拟穴青蟹的性腺转录组分析 | 第23-44页 |
| ·材料与方法 | 第23-25页 |
| ·实验材料 | 第23页 |
| ·主要仪器和试剂 | 第23页 |
| ·样品准备与高通量测序 | 第23页 |
| ·数据处理 | 第23-25页 |
| ·结果与分析 | 第25-37页 |
| ·EST序列分析及拼接组装 | 第25页 |
| ·Unigene序列功能注释 | 第25-29页 |
| ·基于Gene Ontology和KEGG分析的功能分类 | 第29-33页 |
| ·分子标记的鉴定 | 第33-34页 |
| ·差异表达基因和特异表达基因的分析 | 第34-37页 |
| ·讨论 | 第37-44页 |
| ·拟穴青蟹转录组数据的生物信息学分析 | 第37-38页 |
| ·性腺差异/特异表达基因的分析 | 第38-39页 |
| ·与性腺发育相关的通路 | 第39-44页 |
| 第3章 性腺发育相关基因的克隆和表达分析 | 第44-67页 |
| ·材料 | 第44-46页 |
| ·青蟹材料 | 第44页 |
| ·主要仪器和试剂 | 第44-45页 |
| ·引物 | 第45-46页 |
| ·实验方法 | 第46-51页 |
| ·总RNA的提取及基因组DNA的去除 | 第46页 |
| ·SMART-RACE技术获取基因cDNA全长 | 第46-48页 |
| ·割胶回收目的片段 | 第48页 |
| ·与载体连接 | 第48页 |
| ·转化 | 第48页 |
| ·单克隆检测 | 第48-49页 |
| ·生物信息学分析 | 第49页 |
| ·实时荧光定量PCR（real-time PCR）反应体系及条件 | 第49-50页 |
| ·石蜡切片 | 第50页 |
| ·HE染色 | 第50-51页 |
| ·结果与分析 | 第51-64页 |
| ·Sp-OTUB基因克隆与表达分析 | 第51-57页 |
| ·Sp-wds基因克隆与表达分析 | 第57-64页 |
| ·讨论 | 第64-67页 |
| ·OTUB | 第64-65页 |
| ·wds | 第65-67页 |
| 第4章 结论与展望 | 第67-68页 |
| ·结论 | 第67页 |
| ·展望 | 第67-68页 |
| 致谢 | 第68-69页 |
| 参考文献 | 第69-80页 |
| 附录 | 第80-87页 |
| 在学期间发表的学术论文和研究成果 | 第87页 |
