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B9601-Y2菌株的基因组解析及部分功能验证

目录第1-7页
摘要第7-9页
ABSTRACT第9-12页
缩略词第12-13页
第一章 文献综述第13-63页
   ·生物防治的重要性和必要性第13页
   ·生物防治的可行性第13-14页
   ·植物病害的生物防治第14-42页
     ·植物病害生物防治微生物种类第15-21页
     ·芽孢杆菌在生物防治上的应用第21-39页
     ·芽孢杆菌在农业生产中应用所面临的问题以及解决途径第39-42页
   ·生防菌在植物根系的定殖以及监测技术第42-50页
     ·生防菌在植物根系的定殖第42-43页
     ·生防细菌定殖的监测方法第43-50页
   ·芽孢杆菌的转化方法第50-61页
     ·自然转化第50-60页
     ·原生质体转化第60页
     ·电击转化第60-61页
     ·原生质体电击转化第61页
     ·其他转化方式第61页
   ·本研究的内容、目的与意义第61-63页
第二章 解淀粉芽孢杆菌B9601-Y2的基因组测序及防病促生机制的解析第63-93页
   ·材料与方法第63-66页
     ·实验菌株和培养条件第63-64页
     ·菌株Y2基因组DNA的提取第64-65页
     ·鸟枪法基因组测序及全基因组注释第65-66页
     ·基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱分析鉴定Y2次生代谢产物中的脂肽类和聚酮类化合物第66页
   ·结果与分析第66-91页
     ·Y2菌株的全基因组概况第66-74页
     ·Y2的生存策略第74-78页
     ·Y2在作物上的定殖第78-80页
     ·Y2的拮抗防病机制第80-88页
     ·Y2的促生机制第88-91页
   ·讨论第91-93页
第三章 绿色荧光蛋白表达载体的构建及解淀粉芽孢杆菌B9601-Y2的转化第93-121页
   ·材料与方法第94-109页
     ·菌株和质粒第94页
     ·培养基、抗生素以及主要试剂第94-95页
     ·引物序列设计与合成第95-96页
     ·枯草芽孢杆菌168和解淀粉芽孢杆菌Y2基因组DNA的快速提取第96-97页
     ·大肠杆菌化学感受态细胞的制备及转化第97-98页
     ·大肠杆菌转化子质粒的小量提取第98-99页
     ·PCR或酶切产物的胶回收纯化以及产物纯化第99页
     ·载体的去磷酸化及回收第99-100页
     ·绿色荧光蛋白载体的构建第100-106页
     ·枯草芽孢杆菌168及野生枯草芽孢杆菌的自然转化第106-107页
     ·解淀粉芽孢杆菌FZB42的自然转化及质粒提取第107页
     ·解淀粉芽孢杆菌Y2的电转化感受态制备及转化第107-108页
     ·不同GFP质粒标记解淀粉芽孢杆菌Y2菌株的稳定性第108页
     ·不同GFP标记菌株与野生型Y2菌株的生长速率比较第108-109页
     ·不同GFP标记菌株与野生型Y2菌株的室内拮抗活性比较第109页
   ·结果与分析第109-116页
     ·pHT01-P_(amyE)GFP载体的构建第109-110页
     ·pHT01-P43GFP载体的构建第110-111页
     ·pHT01-P43GFPmut3a载体的构建第111-112页
     ·枯草芽孢杆菌168荧光标记菌的荧光表现第112页
     ·解淀粉芽孢杆菌FZB42荧光标记菌的荧光表现第112-113页
     ·解淀粉芽孢杆菌Y2的GFP标记第113-114页
     ·解淀粉芽孢杆菌Y2 GFP标记菌株的质粒稳定性第114-115页
     ·解淀粉芽孢杆菌Y2 GFP标记菌与野生型生长速率的比较第115-116页
     ·解淀粉芽孢杆菌Y2 GFP标记菌与野生型室内拮抗活性的比较第116页
   ·讨论第116-121页
第四章 解淀粉芽孢杆菌B9601-Y2在玉米上的定殖研究第121-129页
   ·材料与方法第121-124页
     ·供试菌株及培养条件第121页
     ·培养基、抗生素与主要试剂第121-122页
     ·供试植物及土壤第122页
     ·标记菌Y2-P43GFPmut3a在玉米根际以及根表等部位的定殖第122-124页
   ·结果与分析第124-127页
     ·Y2-P43GFPmut3a在玉米根际及根系等部位的回收监测第124-125页
     ·Y2-P43GFPmut3a在玉米根表及其它部位的定殖研究第125-127页
   ·讨论第127-129页
第五章 解淀粉芽孢杆菌B9601-Y2自然感受态诱导与形成第129-142页
   ·材料与方法第130-135页
     ·菌株和质粒第130页
     ·培养基、抗生素与主要试剂第130-131页
     ·ComK诱导表达载体pHT01-comK的构建第131-133页
     ·质粒pHT01-comK的电击转化第133-134页
     ·菌株Y2+pHT01-comK自然感受态的诱导及验证第134-135页
   ·结果与分析第135-139页
     ·ComK诱导型表达载体pHT01-comK的构建第135-136页
     ·携带诱导型质粒pHT01-comK的FZB42和Y2菌株的获取第136页
     ·菌株Y2+pHT01-comK在IPTG诱导下接受外源质粒DNA的转化研究第136-137页
     ·菌株Y2+pHT01-comK自然转化诱导条件的优化第137-139页
   ·讨论第139-142页
第六章 结论及展望第142-146页
   ·结论第142-144页
   ·展望第144-146页
参考文献第146-175页
攻读博士学位期间撰写的学术论文第175-176页
致谢第176页

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