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苏云金芽胞杆菌转录调控因子CodY的调控研究

摘要第1-10页
ABSTRACT第10-12页
缩略语表第12-13页
1 前言第13-30页
   ·苏云金芽胞杆菌第13-20页
     ·苏云金芽胞杆菌简介第13-14页
     ·苏云金芽胞杆菌杀虫晶体蛋白研究第14-19页
       ·杀虫晶体蛋白的结构和功能第14-15页
       ·基因的分类定位第15-16页
       ·杀虫晶体蛋白的表达与调控第16-19页
       ·杀虫机制第19页
     ·苏云金芽胞杆菌的应用第19-20页
   ·全局性调控因子CodY第20-26页
     ·芽胞杆菌中的全局性调控因子第20-21页
       ·CcpA第20页
       ·TnrA第20-21页
     ·CodY的研究进展第21-26页
       ·CodY的结构第21-22页
       ·CodY的效应分子第22-23页
       ·CodY的结合热点及作用机制第23-24页
       ·CodY的功能研究第24-26页
   ·转录调控因子寻找靶基因的研究方法第26-28页
     ·转录调控因子靶基因的研究第26-27页
     ·转录调控因子靶基因的验证第27-28页
       ·DnaseI足迹第27页
       ·EMSA第27页
       ·SPR第27-28页
       ·酵母单杂交第28页
       ·细菌单杂交第28页
   ·本研究背景及研究目的第28-30页
2 材料与方法第30-43页
   ·实验材料第30-32页
     ·菌株、质粒及引物第30-32页
     ·培养基的配制方法及成分第32页
     ·抗生素及其使用浓度第32页
   ·常用试剂和仪器第32-35页
     ·常用试剂第32-33页
     ·常用缓冲液和溶液第33-35页
       ·质粒总DNA抽提及感受态制备所需试剂第33页
       ·蛋白表达纯化及蛋白含量的测定相关试剂第33-34页
       ·SDS-PAGE所需试剂第34页
       ·细菌单杂交筛选培养基所需试剂第34-35页
     ·常用仪器第35页
   ·实验方法第35-43页
     ·核酸的抽提第35-37页
       ·大肠杆菌质粒的抽提第35-36页
       ·苏云金芽胞杆菌总DNA的抽提第36-37页
       ·苏云金芽胞杆菌总RNA的抽提第37页
     ·体外分子克隆实验操作第37-39页
       ·PCR扩增第37-38页
       ·连接体系第38页
       ·大肠杆菌感受态细胞的制备及转化第38-39页
     ·实时荧光定量PCR第39-40页
       ·RNA样品中DNA的消化第39页
       ·RNA反转录第39页
       ·Real Time PCR反应第39-40页
     ·蛋白表达纯化及浓度测定第40-41页
       ·蛋白表达纯化第40页
       ·SDS-PAGE第40页
       ·蛋白透析第40页
       ·蛋白浓度测定第40-41页
     ·PHB含量的测定第41-42页
     ·EMSA实验第42-43页
3 结果与分析第43-69页
   ·比较蛋白质组学研究CodY的结果分析第43-63页
     ·codY突变株表型分析第43-46页
       ·BMB171cry1Ac和BMB171codY-cry1Ac的生长表型差异第43-45页
       ·BMB171cry1Ac和BMB171codY-cry1Ac的SDS-PAGE分析第45页
       ·BMB171cry1Ac和BMB171codY-cry1Ac的PHB含量分析第45-46页
     ·MALDI-TOF-MS/MS结果分析及验证第46-50页
       ·MALDI-TOF-MS/MS鉴定结果分类及差异表达分析第46-48页
       ·部分基因转录水平的荧光定量PCR的验证第48-50页
     ·CodY直接调控基因的分析验证及差异蛋白基因功能分析第50-63页
       ·CodY直接调控基因的分析验证第50-58页
       ·差异蛋白的功能分析第58-63页
     ·小结第63页
   ·CodY体外靶基因的筛选结果分析第63-69页
     ·CodY靶基因共同序列保守性分析第64页
     ·靶基因的功能分析第64-68页
       ·寡肽转运蛋白OppA第65-66页
       ·双组份信号转导LytSR和VanSR第66-67页
       ·重组酶RecA第67页
       ·其他功能蛋白分析第67-68页
     ·小结第68-69页
4. 总结与展望第69-71页
参考文献第71-80页
致谢第80页

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