| 目录 | 第1-6页 |
| 摘要 | 第6-8页 |
| Abstract | 第8-10页 |
| 缩略词 | 第10-11页 |
| 第一章 综述 | 第11-24页 |
| ·青枯菌的基本概况 | 第11-15页 |
| ·青枯病的危害 | 第11-12页 |
| ·青枯病菌的形态及生存环境 | 第12页 |
| ·青枯病菌的分类 | 第12-14页 |
| ·青枯病菌的基因组结构 | 第14-15页 |
| ·青枯病菌的研究进展 | 第15-22页 |
| ·青枯病菌的致病过程和机制 | 第15-18页 |
| ·青枯病菌致病相关基因研究 | 第18-19页 |
| ·青枯病菌基因组学研究 | 第19-22页 |
| ·本研究目的意义和技术路线 | 第22-24页 |
| ·研究目的和意义 | 第22-23页 |
| ·技术路线 | 第23-24页 |
| 第二章 青枯菌小种 4 号 SD54 基因组测序与比较基因组学分析 | 第24-38页 |
| ·实验材料 | 第24-25页 |
| ·菌株 | 第24页 |
| ·试剂、仪器及生物信息学工具 | 第24-25页 |
| ·实验方法 | 第25-29页 |
| ·青枯菌全基因组测序、拼接和组装 | 第25-28页 |
| ·SD54 基因组功能注释 | 第28页 |
| ·SD54 比较基因组学分析 | 第28-29页 |
| ·结果与分析 | 第29-34页 |
| ·SD54 全基因组测序和序列组装 | 第29页 |
| ·SD54 基因组功能注释 | 第29-30页 |
| ·SD54 比较基因组学分析 | 第30-34页 |
| ·讨论 | 第34-38页 |
| ·基因组测序及基因功能注释 | 第34-35页 |
| ·SD54 致病相关基因的挖掘 | 第35-36页 |
| ·比较基因组学分析 | 第36-38页 |
| 第三章 青枯菌 hrpG 基因突变株的构建及其致病性分析 | 第38-58页 |
| ·实验材料 | 第38页 |
| ·菌株和载体 | 第38页 |
| ·培养基 | 第38页 |
| ·主要试剂 | 第38页 |
| ·实验方法 | 第38-48页 |
| ·SD54 特异基因组区段及特异基因的 PCR 验证 | 第38-40页 |
| ·SD54 中 hrpG 基因的克隆 | 第40-42页 |
| ·SD54 中 hrpG 基因敲除载体的构建 | 第42-47页 |
| ·重组质粒 pBR322-ΔhrpG- SacB 的转化及 hrpG 基因缺失突变株的筛选 | 第47-48页 |
| ·hrpG 基因缺失突变菌株和野生型菌株的致病性测定 | 第48页 |
| ·结果与分析 | 第48-55页 |
| ·SD54 特异基因组区段和特异基因的 PCR 验证 | 第48-51页 |
| ·SD54 中 hrpG 基因的克隆 | 第51页 |
| ·SD54 中 hrpG 基因敲除载体的构建 | 第51-54页 |
| ·重组质粒 pBR322-ΔhrpG- SacB 的转化及 hrpG 基因缺失突变株的筛选 | 第54页 |
| ·hrpG 基因缺失突变菌株和野生型菌株的致病性测定 | 第54-55页 |
| ·讨论 | 第55-58页 |
| 第四章 全文结论 | 第58-59页 |
| 后续工作展望 | 第59-60页 |
| 参考文献 | 第60-67页 |
| 附录 | 第67-81页 |
| 致谢 | 第81-83页 |
| 个人简历 | 第83页 |
