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玉米胚囊转录组分析及胚囊—花粉管互作相关基因的初步鉴定

符号说明第1-9页
中文摘要第9-11页
英文摘要第11-13页
1 前言第13-34页
   ·植物雌配子体的结构和功能第13-16页
   ·植物雌雄配子体相互作用的研究进展第16-23页
     ·花粉管的吸引第16-19页
       ·孢子体介导的花粉管导向第16-17页
       ·配子体介导的花粉管导向第17-19页
     ·花粉管进入胚囊第19-21页
     ·雌雄配子的互作第21-22页
     ·花粉管的排斥和防止多精入卵第22-23页
   ·玉米双受精过程中的细胞动力学事件第23-24页
   ·植物雌配子体转录组学研究进展第24-31页
     ·基因芯片技术第24-27页
     ·高通量测序技术第27-29页
     ·植物雌配子体转录组学研究进展第29-31页
   ·本研究的目的意义第31-34页
2 实验材料与方法第34-39页
   ·植物材料的培养及收集方法第34-35页
     ·玉米材料及授粉第34页
     ·玉米胚囊的酶解与收集第34页
     ·酶及生化试剂第34-35页
     ·试剂配方第35页
   ·实验方法第35-36页
     ·RNA的提取第35-36页
     ·玉米花粉管生长的苯胺蓝染色与观察第36页
     ·玉米胚囊的LSCM观察第36页
   ·测序文库的构建和Illumina测序第36-37页
     ·测序文库的构建第36页
     ·Illumina测序第36-37页
     ·皮尔逊相关系数和Spearman秩等相关系数分析第37页
   ·GO分析第37页
   ·基因注释、分类、蛋白质相关参数预测、亚细胞定位和信号肽预测第37-38页
   ·玉米胚囊优势表达及授粉前后差异表达基因中编码富含半胱氨酸蛋白基因的预测第38-39页
3 结果与分析第39-79页
   ·玉米胚囊优势表达基因的鉴定和分析第39-63页
     ·玉米胚囊和珠心的Illumina测序分析第40-41页
     ·玉米胚囊和珠心测序结果重复性分析第41-42页
     ·玉米胚囊和珠心基因表达情况统计第42页
     ·玉米胚囊优势表达基因的鉴定第42-43页
     ·玉米胚囊优势表达基因的分析第43-60页
       ·玉米胚囊优势表达基因的功能分类第43-49页
       ·玉米胚囊优势表达基因的生物信息学分析第49-52页
         ·玉米胚囊优势表达基因的GO分析第49-52页
         ·玉米胚囊特异表达基因的GO分析第52页
       ·编码分泌蛋白的转录本在玉米胚囊优势表达转录本中的分布第52-58页
       ·编码类受体激酶的转录本在玉米胚囊优势表达转录本中的分布第58-60页
     ·玉米和拟南芥胚囊富集表达基因的比较第60-63页
       ·玉米和拟南芥胚囊富集表达基因中保守基因的鉴定第61-62页
       ·与拟南芥相比玉米胚囊中具有“特异性”基因的分析第62-63页
   ·授粉前后玉米胚囊差异表达基因的鉴定第63-79页
     ·授粉前后玉米胚囊的Illumina测序结果第64-65页
     ·授粉前后玉米胚囊测序结果的重复性分析第65-66页
     ·授粉前后玉米胚囊中基因表达情况统计第66页
     ·授粉前后玉米胚囊差异表达基因的鉴定第66-67页
     ·授粉前后玉米胚囊差异表达基因与前人工作的比较第67-68页
     ·授粉诱导表达转录本的分析第68-70页
     ·授粉前后玉米胚囊差异表达基因的GO分析第70-71页
     ·蛋白质磷酸化在胚囊-花粉管互作过程中的作用分析第71-73页
     ·玉米胚囊中的肌动蛋白-肌球蛋白运动系统第73-74页
     ·泛素-蛋白酶体途径在玉米胚囊-花粉管互作过程中的作用分析第74-75页
     ·编码富含半胱氨酸蛋白的转录本在授粉前后玉米胚囊差异表达转录本中的分布第75-79页
4 讨论第79-87页
   ·玉米胚囊高通量测序结果与前人玉米胚囊测序工作的比较第79-80页
   ·激素在玉米胚囊-花粉管互作过程中的作用第80-81页
   ·参与胚囊-花粉管互作的信号分子第81-87页
     ·CrRLK1-L、DUF26和LRR类受体激酶可能共同介导了玉米胚囊-花粉管互作的过程第81-84页
     ·具有“特异性”的CRPs可能在胚囊-花粉管互作过程中发挥重要作用第84-85页
     ·玉米胚囊-花粉管互作的模型第85-87页
5 结论第87-88页
参考文献第88-110页
附录第110-111页
致谢第111-112页
攻读学位期间发表论文情况第112页

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