| 摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-9页 |
| 第1章 绪论 | 第9-18页 |
| ·引言 | 第9-10页 |
| ·水平基因转移的概念 | 第10-11页 |
| ·水平基因转移的机制 | 第11-14页 |
| ·原核生物中的水平基因转移 | 第11-13页 |
| ·真核生物中的水平基因转移 | 第13-14页 |
| ·水平基因转移的研究意义 | 第14-15页 |
| ·加快基因组进化速度 | 第14-15页 |
| ·促进生物进化 | 第15页 |
| ·促进物种趋同进化 | 第15页 |
| ·水平基因转移的研究内容 | 第15-17页 |
| ·本文的研究内容和章节安排 | 第17-18页 |
| 第2章 预测水平转移基因的研究方法 | 第18-28页 |
| ·系统发育方法（Phylogenetic approaches） | 第18-21页 |
| ·参数方法（Parametric approaches） | 第21-28页 |
| ·常用的特征 | 第22-28页 |
| 第3章 多特征结合用于水平转移基因的预测 | 第28-36页 |
| ·基础知识 | 第29-32页 |
| ·支持向量机（Support vector machine, SVM） | 第29-31页 |
| ·遗传算法（Genetic algorithm, GA） | 第31-32页 |
| ·SMOTE（Synthetic minority over-sampling technique）算法 | 第32页 |
| ·实验方案设计 | 第32-35页 |
| ·组成特征提取 | 第33页 |
| ·模型选择 | 第33-34页 |
| ·特征选择 | 第34页 |
| ·SMOTE用于分类不平衡问题 | 第34-35页 |
| ·总结 | 第35-36页 |
| 第4章 实验结果与讨论 | 第36-48页 |
| ·实验条件 | 第36-37页 |
| ·数据集 | 第36页 |
| ·评价标准 | 第36-37页 |
| ·结果与讨论 | 第37-46页 |
| ·特征选择结果 | 第37-39页 |
| ·分类不平衡学习结果 | 第39页 |
| ·与多阈值方法的比较 | 第39-46页 |
| ·结论 | 第46-48页 |
| 第5章 总结与展望 | 第48-50页 |
| ·论文工作总结 | 第48-49页 |
| ·论文工作展望 | 第49-50页 |
| 参考文献 | 第50-57页 |
| 致谢 | 第57-58页 |
| 攻读硕士学位期间发表的学术论文及科研成果 | 第58页 |
