| 摘要 | 第1-9页 |
| ABSTRACT | 第9-11页 |
| 第一章 文献综述 | 第11-29页 |
| ·常见的分子标记 | 第11-16页 |
| ·RFLP分子标记 | 第11-12页 |
| ·RAPD分子标记 | 第12页 |
| ·AFLP标记 | 第12-13页 |
| ·SSR标记 | 第13-14页 |
| ·ISSR标记 | 第14页 |
| ·反转录转座子分子标记 | 第14-15页 |
| ·SNP标记 | 第15-16页 |
| ·单核苷酸多态性标记的开发 | 第16-18页 |
| ·EST-SNP开发 | 第17页 |
| ·扩增子重测序开发SNP | 第17-18页 |
| ·从全基因组序列中开发SNP | 第18页 |
| ·利用第二代测序技术开发SNP | 第18页 |
| ·SNP检测方法的研究进展 | 第18-22页 |
| ·限制性片段长度多态性法 | 第18-19页 |
| ·基于限制性内切酶酶切技术的SNP鉴定技术 | 第19页 |
| ·单链构象多态性法 | 第19-20页 |
| ·等位基因特异性PCR | 第20-21页 |
| ·DNA测序法 | 第21页 |
| ·高分辨熔解曲线分析 | 第21-22页 |
| ·基因芯片技术检测 | 第22页 |
| ·SNP在分子生物学中的应用 | 第22-25页 |
| ·遗传多样性分析 | 第22-23页 |
| ·系统进化分析 | 第23页 |
| ·构建遗传图谱 | 第23-24页 |
| ·生物性状分析 | 第24页 |
| ·建立DNA指纹图谱 | 第24-25页 |
| ·基因定位与功能分析 | 第25页 |
| ·SNP在枇杷种质资源和育种研究中的意义 | 第25-29页 |
| 第二章 引言 | 第29-31页 |
| ·研究的目的与意义 | 第29-30页 |
| ·研究方法与内容 | 第30页 |
| ·研究路线图 | 第30-31页 |
| 第三章 实验材料与方法 | 第31-39页 |
| ·材料 | 第31-32页 |
| ·供试材料 | 第31页 |
| ·主要仪器 | 第31页 |
| ·主要试剂 | 第31-32页 |
| ·方法 | 第32-37页 |
| ·核酸提取及检测 | 第32-34页 |
| ·引物设计 | 第34页 |
| ·PCR体系和反应的程序 | 第34页 |
| ·PCR扩增产物的凝胶回收与纯化 | 第34-35页 |
| ·PCR纯化产物的连接与转化 | 第35-36页 |
| ·转录组测序 | 第36-37页 |
| ·数据统计分析 | 第37-39页 |
| ·核苷酸序列比对 | 第37页 |
| ·SNP位点分析 | 第37页 |
| ·聚类分析 | 第37-38页 |
| ·转录组测序信息分析 | 第38-39页 |
| 第四章 结果与分析 | 第39-73页 |
| ·DNA的提取结果 | 第39-40页 |
| ·总RNA的提取与检测 | 第40-41页 |
| ·PCR扩增产物的凝胶回收及纯化 | 第41页 |
| ·PCR纯化产物的连接、转化与鉴定 | 第41-42页 |
| ·测序结果比对及分析 | 第42-64页 |
| ·基于CCoAoMT基因的SNP分析 | 第42-44页 |
| ·基于DXS基因的SNP分析 | 第44-49页 |
| ·基于HSP70基因的SNP分析 | 第49-51页 |
| ·基于IDI基因的SNP分析 | 第51-54页 |
| ·基于S6PDH基因的SNP分析 | 第54-57页 |
| ·基于matK基因的SNP分析 | 第57-58页 |
| ·基于squalene epoxidase2基因的SNP分析 | 第58-64页 |
| ·基于SNP聚类分析 | 第64-66页 |
| ·基于转录组测序的SNP分析 | 第66-73页 |
| ·产量统计 | 第66页 |
| ·组装质量统计 | 第66-67页 |
| ·SNP分布分析 | 第67-68页 |
| ·SNP位点的几种类型 | 第68-73页 |
| 第五章 讨论 | 第73-79页 |
| ·变异位点研究 | 第73-74页 |
| ·SNP突变频率 | 第74页 |
| ·缺失位点研究 | 第74页 |
| ·SNP突变类型 | 第74-75页 |
| ·SNP位点多样性 | 第75-76页 |
| ·稀有SNP研究 | 第76-77页 |
| ·单倍型研究 | 第77页 |
| ·转录组测序结果分析 | 第77-78页 |
| ·有待进一步解决的问题 | 第78-79页 |
| 第六章 结论 | 第79-81页 |
| 参考文献 | 第81-91页 |
| 缩略语表 | 第91-93页 |
| 致谢 | 第93-95页 |
| 在学期间发表的论文 | 第95页 |