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氧化亚铁硫杆菌密度感应系统功能研究

目录第1-8页
图表目录第8-10页
缩略词表第10-11页
中文摘要第11-13页
Abstract第13-15页
第一部分 文献综述第15-30页
 1 细菌密度感应系统研究进展第15-23页
   ·密度感应系统的发现和提出第15-16页
   ·密度感应系统的种类第16页
   ·革兰氏阴性细菌QS系统的调控机制第16-18页
   ·革兰氏阴性细菌QS系统信号分子种类及合成途径第18-19页
   ·氧化亚铁硫杆菌的QS系统第19-21页
   ·革兰氏阴性细菌QS系统功能性研究及应用前景第21-22页
   ·QS系统功能性研究信号干扰第22-23页
 2 氧化亚铁硫杆菌的金属离子耐受性第23-26页
 3 氧化亚铁硫杆菌吸附性第26-27页
 4 课题的提出第27-30页
第二部分 氧化亚铁硫杆菌QS信号分子的检测第30-42页
 1 材料和方法第30-36页
   ·实验菌株第30-31页
   ·实验所需材料、关键仪器第31-32页
     ·关键试剂第31-32页
     ·关键仪器第32页
   ·培养基第32-33页
     ·9K 液体培养基第32页
     ·ISP(Iron-salts-purified agar)固体培养基第32-33页
     ·LB液体培养基第33页
     ·YEB液体培养基第33页
     ·AB固体和半固体基本培养基第33页
   ·实验方法第33-36页
     ·A.ferrooxidans的培养及纯化第33页
     ·指示细菌C.violaceum CV026的培养及纯化第33-34页
     ·指示细菌C.violaceum CV026指示平板的制作第34页
     ·指示细菌A.tumefaciens NTL4的培养及纯化第34页
     ·指示细菌A tumefaciens NTL4(pZLR4)指示平板的制作第34-35页
     ·氧化亚铁硫杆菌培养液中AHL信号分子的萃取第35页
     ·指示平板检测氧化亚铁硫杆菌萃取液中AHL信号分子第35页
     ·高效液相色谱及质谱检测氧化亚铁硫杆菌萃取液中AHL信号分子第35-36页
 2. 结果与分析第36-40页
   ·指示平板验证实验第36页
   ·指示平板检测A.ferrooxidans提取液中AHL分子第36-37页
   ·高效液相色谱质谱对A.ferrooxidans提取液中AHL分子的定性与相对定量第37-40页
 3. 讨论第40-42页
第三部分 氧化亚铁硫杆菌QS系统的抑制第42-58页
 1 材料和方法第42-47页
   ·实验菌株第42页
   ·实验所需材料、关键仪器第42-43页
     ·关键试剂第42-43页
     ·培养基第43页
     ·试剂盒第43页
     ·关键仪器第43页
   ·实验方法第43-47页
     ·QS抑制剂处理对于氧化亚铁硫杆菌AHL分子产生的影响第43-44页
     ·QS抑制剂处理前后A.ferrooxidans ATCC23270 afeI和afeR基因的相对表达变化第44-46页
     ·QS抑制剂处理对于氧化亚铁硫杆菌培养基Fe2+氧化速率的影响第46页
     ·QS抑制剂处理对于氧化亚铁硫杆菌培养基pH变化的影响第46页
     ·TEM观察QS处理前后细菌形态第46-47页
 2. 结果与分析第47-55页
   ·指示平板检测FUR对于A.ferrooxidans AHL信号分子产生的影响第47-48页
   ·高效液相色谱质谱对A.ferrooxidans提取液中AHL分子的定性与相对定量第48-49页
   ·A.ferrooxidans ATCC23270 QS相关基因扩增引物的设计第49页
   ·引物质量评估第49-50页
   ·标准曲线和熔解曲线第50-52页
   ·A.ferrooxidans ATCC23270 afeI和afeR基因定量表达第52页
   ·FUR化合物对A.ferrooxidans的Fe~(2+)氧化活性的影响第52-54页
   ·FUR化合物对A.ferrooxidans的培养液pH变化的影响第54页
   ·TEM观察FUR处理后A.ferrooxidans的细胞形态第54-55页
 3. 讨论第55-58页
第四部分 QS抑制剂对氧化亚铁硫杆菌多种重金属离子耐受性的影响第58-71页
 1 材料和方法第58-61页
   ·实验菌株第58页
   ·实验所需材料、关键仪器第58-59页
     ·关键试剂第58-59页
     ·培养基第59页
     ·关键仪器第59页
   ·实验方法第59-61页
     ·各种金属溶液储液配制第59页
     ·Cu~(2+),Ni~(2+)对于A.ferrooxidans菌Fe~(2+)氧化能力的影响第59-60页
     ·Cu~(2+),Ni~(2+)对于A.ferrooxidans菌培养基pH变化的影响第60页
     ·QS抑制剂处理对于A.ferrooxidans菌重金属离子耐受性的影响第60-61页
 2. 结果与分析第61-68页
   ·Cu~(2+),Ni~(2+)对于A.ferrooxidans菌氧化Fe~(2+)能力的影响第61-62页
   ·Cu~(2+),Ni~(2+)对于A.ferrooxidans菌培养基pH变化的影响第62页
   ·FUR对A.ferrooxidans Cu~(2+),Ni~(2+)耐受性的影响第62-64页
   ·FUR对氧化亚铁硫杆菌七种重金属离子耐受性的影响第64-66页
   ·4-NPO对氧化亚铁硫杆菌七种重金属离子耐受性的影响第66-68页
 3. 讨论第68-71页
第五部分 QS系统参与调控氧化亚铁硫杆菌铜离子耐受性的分子机制研究第71-81页
 1 材料和方法第71-73页
   ·实验菌株第71页
   ·实验所需材料、关键仪器第71-72页
     ·关键试剂第71页
     ·培养基第71页
     ·试剂盒第71-72页
     ·关键仪器第72页
   ·实验方法第72-73页
     ·FUR处理后A.ferrooxidans ATCC23270 Cu~(2+)MIC测定第72页
     ·引物设计第72页
     ·afe0329,afe0454基因的扩增第72-73页
     ·标准曲线和熔解曲线第73页
     ·QS抑制剂处理后对QS基因及copABCD基因的相对表达的影响第73页
 2. 结果与分析第73-78页
   ·Cu~(2+)对A.ferrooxidans的最低抑制浓度测定第73-74页
   ·afe0329和afe0454基因引物的设计第74页
   ·引物质量评估第74-75页
   ·标准曲线和熔解曲线第75-76页
   ·FUR和Cu~(2+)对afeI、afeR、afe0329和afe0454基因相对表达的影响第76-78页
 3. 讨论第78-81页
第六部分 QS系统参与调控氧化亚铁硫杆菌-镍黄铁矿吸附作用第81-92页
 1 材料和方法第81-83页
   ·实验菌株第81页
   ·实验所需材料、关键仪器第81-82页
     ·关键试剂第81页
     ·培养基第81-82页
     ·关键仪器第82页
   ·实验方法第82-83页
     ·镍黄铁矿预处理第82页
     ·吸附实验第82页
     ·傅里叶变换红外光谱法检测(FT-IR)检测A.ferrooxidan表面活性基团第82-83页
     ·扫描电镜第83页
 2. 结果与分析第83-89页
   ·QS系统对A.ferrooxidans早期吸附镍黄铁矿的影响第83-85页
   ·FT-IR分析第85-86页
   ·SEM分析第86-89页
 3. 讨论第89-92页
第七部分 氧化亚铁硫杆菌QS系统对镍黄铁矿金属溶出作用的影响机制初探第92-104页
 1 材料和方法第92-94页
   ·实验菌株第92页
   ·实验所需材料、关键仪器第92-93页
     ·培养基和关键试剂第92页
     ·关键仪器第92-93页
   ·实验方法第93-94页
     ·镍硫铁矿成分分析第93页
     ·A.ferrooxidans QS系统对镍黄铁金属溶出过程中ph变化第93页
     ·A.ferrooxidans QS系统对镍黄铁Ni~(2+)、Cu~(2+)金属溶出过程的影响第93-94页
     ·SEM及EDAX能谱分析溶出后的镍黄铁矿第94页
 2. 结果与分析第94-101页
   ·镍硫铁矿成分分析结果第94-95页
   ·镍硫铁矿溶出过程中pH变化第95-97页
   ·镍硫铁矿溶出过程中Ni、Cu浓度变化第97-99页
   ·镍硫铁矿溶出过程表面形态和成分变化第99-101页
 3. 讨论第101-104页
第八部分 结论第104-106页
参考文献第106-117页
研究生期间已发表或拟发表的研究成果第117-118页
致谢第118页

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