| 摘要 | 第1-9页 |
| ABSTRACT | 第9-17页 |
| 第一章 文献综述 | 第17-55页 |
| ·苹果树腐烂病的研究概述 | 第17-32页 |
| ·中国苹果产业的发展和现状 | 第17页 |
| ·苹果树腐烂病的发生和危害 | 第17-19页 |
| ·苹果树腐烂病的病原学研究 | 第19-24页 |
| ·苹果树腐烂病的侵染循环 | 第24-27页 |
| ·苹果树腐烂病的流行规律研究 | 第27-29页 |
| ·寄主植物的抗病性鉴定 | 第29页 |
| ·苹果树腐烂病菌的防治 | 第29-32页 |
| ·黑腐皮壳属（Valsa）的分类地位和分类中存在的问题 | 第32-33页 |
| ·真菌分类研究的概况 | 第33-37页 |
| ·核糖体转录间隔区（rDNA-ITS）在真菌分类中的应用 | 第34-35页 |
| ·延伸因子 1α基因（EF-1α）在真菌分类中的应用 | 第35-36页 |
| ·β-微管蛋白基因（β-tubulin）在真菌分类中的应用 | 第36-37页 |
| ·多基因联合分析法在真菌分类中的应用 | 第37页 |
| ·病原菌检测技术的发展 | 第37-45页 |
| ·传统检测方法在病原菌检测上的应用 | 第37-38页 |
| ·生化技术在病原菌检测上的应用 | 第38-39页 |
| ·核酸技术在病原菌检测上的应用 | 第39-45页 |
| ·群体遗传多样性研究 | 第45-53页 |
| ·群体遗传学的概念 | 第45页 |
| ·植物病原真菌群体遗传学的内容和意义 | 第45-46页 |
| ·群体遗传多样性标记的方法 | 第46-53页 |
| ·本研究的目的和意义 | 第53-55页 |
| 第二章 苹果树腐烂病菌 rDNA-ITS,EF-1α和β-tubulin 基因的序列分析 | 第55-108页 |
| ·前言 | 第55页 |
| ·材料和方法 | 第55-63页 |
| ·供试菌株 | 第55-58页 |
| ·病原菌单菌丝体的获得 | 第58页 |
| ·病原菌营养体的培养和收集 | 第58页 |
| ·菌丝体基因组总 DNA 的提取 | 第58-59页 |
| ·苹果树腐烂病菌 rDNA-ITS, EF-1α和β-tubulin 基因的 PCR 扩增 | 第59-61页 |
| ·PCR 扩增产物的回收和纯化 | 第61页 |
| ·PCR 产物的核苷酸序列测定 | 第61-62页 |
| ·基因序列比对和系统发育树的构建 | 第62-63页 |
| ·结果与分析 | 第63-104页 |
| ·苹果树腐烂病菌总量 DNA 的提取 | 第63-64页 |
| ·苹果树腐烂病菌 rDNA-ITS，EF-1α和β-tubulin 基因的 PCR 扩增 | 第64-65页 |
| ·rDNA-ITS 基因数据集分析 | 第65-67页 |
| ·EF1α基因数据集分析 | 第67-69页 |
| ·β-tubulin 基因数据集分析 | 第69-71页 |
| ·联合基因序列数据集的 Partition Homogeneity 检测 | 第71页 |
| ·rDNA-ITS，EF1α和β-tubulin 联合基因数据集分析 | 第71-74页 |
| ·苹果树腐烂病及其近缘属种系统发育树的构建 | 第74-97页 |
| ·不同寄主来源的 Valsa ceratosperma 与其近缘种的比较 | 第97-104页 |
| ·结论与讨论 | 第104-108页 |
| 第三章 苹果树腐烂病菌早期快速分子检测体系的建立 | 第108-134页 |
| ·前言 | 第108页 |
| ·材料和方法 | 第108-112页 |
| ·供试菌株及其 DNA 的提取 | 第108页 |
| ·特异性引物的设计 | 第108页 |
| ·PCR 扩增体系的建立 | 第108-109页 |
| ·特异性引物的特异性检测 | 第109页 |
| ·特异性引物的灵敏度检测 | 第109-110页 |
| ·种特异性引物对腐烂病菌营养体 DNA 的检测 | 第110页 |
| ·有明显症状和无明显症状的样品的采集 | 第110页 |
| ·植物组织中病菌 DNA 的提取 | 第110-111页 |
| ·Nested-PCR 检测体系的正确性的验证 | 第111页 |
| ·人工接种枝条的带菌情况的巢式 PCR 检测 | 第111-112页 |
| ·巢氏 PCR 扩增产物序列的测定 | 第112页 |
| ·巢氏 PCR 检测体系的应用 | 第112页 |
| ·苹果树不同组织带菌率的比较 | 第112页 |
| ·结果 | 第112-130页 |
| ·特异性引物的设计 | 第112-113页 |
| ·PCR 扩增体系的建立 | 第113-116页 |
| ·种特异性引物的特异性检测 | 第116-118页 |
| ·种特异性引物的灵敏度检测 | 第118-120页 |
| ·苹果树腐烂病菌营养体 DNA 的检测 | 第120页 |
| ·植物组织中病原菌 DNA 的提取 | 第120页 |
| ·Nested-PCR 检测体系的正确性的验证 | 第120-121页 |
| ·人工接种枝条的带菌情况的巢式 PCR 检测 | 第121-122页 |
| ·巢氏 PCR 扩增最终产物序列的测定 | 第122-126页 |
| ·巢式 PCR 检测体系的应用 | 第126-130页 |
| ·结论与讨论 | 第130-134页 |
| ·巢式 PCR 分子检测体系的建立 | 第130页 |
| ·植物组织中病原菌 DNA 的提取 | 第130-131页 |
| ·种特异性引物的特异性和灵敏性 | 第131页 |
| ·苹果树腐烂病菌共侵染现象的发现 | 第131-132页 |
| ·巢式 PCR 检测结果与传统分离检测结果的比对 | 第132页 |
| ·苹果树腐烂病菌优势种群转化的可能性 | 第132-133页 |
| ·病原菌在不同组织中的分布特征 | 第133-134页 |
| 第四章 中国苹果树腐烂病菌种群遗传特性的 ISSR 分析 | 第134-160页 |
| ·前言 | 第134页 |
| ·材料和方法 | 第134-141页 |
| ·苹果树腐烂病标样的采集 | 第134页 |
| ·供试菌株的分离培养 | 第134-139页 |
| ·供试菌株单菌丝分离物的获得 | 第139页 |
| ·供试分离株菌丝营养体的获得 | 第139页 |
| ·供试分离株菌 DNA 的提取 | 第139页 |
| ·供试引物 | 第139页 |
| ·苹果树腐烂病菌 ISSR-PCR 最佳反应体系的建立 | 第139-140页 |
| ·苹果树腐烂病菌的 ISSR-PCR 扩增 | 第140页 |
| ·V. mali 两个变种 V.mali var. mali 和 V. mali var. pyri 的 ISSR-PCR 扩增 | 第140-141页 |
| ·ISSR-PCR 扩增产物的电泳检测 | 第141页 |
| ·ISSR-PCR 扩增结果的数据处理与统计分析 | 第141页 |
| ·结果 | 第141-157页 |
| ·苹果树腐烂病菌 ISSR-PCR 最佳体系的建立 | 第141-145页 |
| ·陕西省苹果树腐烂病菌的遗传多样性 | 第145-146页 |
| ·陕西省苹果树腐烂病菌群体遗传多样性水平 | 第146-147页 |
| ·陕西省苹果树腐烂病菌群体遗传结构与分化 | 第147-148页 |
| ·陕西省苹果树腐烂病菌的聚类分析 | 第148-149页 |
| ·中国不同地区苹果树腐烂病菌的遗传多样性分析 | 第149-152页 |
| ·中国苹果树腐烂病菌不同地理区域种群的群体遗传分析 | 第152-153页 |
| ·中国苹果树腐烂病菌不同地理区域种群的群体遗传结构与分化 | 第153-154页 |
| ·中国苹果树腐烂病菌的聚类分析 | 第154-155页 |
| ·V. mali 两个变种 V.mali var. mali 和 V. mali var. pyri 的 ISSR-PCR 扩增· | 第155-157页 |
| ·结论与讨论 | 第157-160页 |
| 参考文献 | 第160-171页 |
| 致谢 | 第171-172页 |
| 作者简介 | 第172-173页 |
| 附录一 实验中常用的试剂及配方 | 第173-174页 |
| 附录二 论文中用到的英文缩写 | 第174-175页 |
| 附录三 黑腐皮壳属及相关属检索表 | 第175页 |
