鲽形目分类检索及分子生物学应用模式研究
| 摘要 | 第1-6页 |
| ABSTRACT | 第6-15页 |
| 第一章 文献综述 | 第15-44页 |
| 0 引言 | 第15-16页 |
| 1 分类学信息及其标准化研究进展 | 第16-24页 |
| ·生物分类学信息 | 第16-18页 |
| ·分类学与系统学 | 第16-17页 |
| ·各种生物分类学信息之间的关系 | 第17页 |
| ·分类学与分类学信息范畴 | 第17-18页 |
| ·CBD 从全球应用角度重新发现分类学价值 | 第18-20页 |
| ·面向解决分类学障碍重振学科发展 | 第18页 |
| ·CBD 现阶段的重要分类学产出 | 第18-20页 |
| ·分类学信息的标准化 | 第20-24页 |
| ·国际化标准 | 第20-21页 |
| ·CHM 和GTI 分类学信息标准化所遵循的原则 | 第21-23页 |
| ·我国的国家标准和其他标准 | 第23-24页 |
| 2 鲽形目分类学信息化工具研究进展 | 第24-41页 |
| ·鲽形目分类学信息的历史发展阶段 | 第25-27页 |
| ·纸质化信息记载发展时期 | 第25-26页 |
| ·数字化信息记载发展时期 | 第26-27页 |
| ·鲽形目分类学数据库及工具 | 第27-40页 |
| ·物种名录 | 第27-28页 |
| ·分类阶元系统 | 第28-30页 |
| ·分类检索表 | 第30页 |
| ·分子鉴定系统和DNA 条码 | 第30-32页 |
| ·分子标记数据库 | 第32-35页 |
| ·分子系统分析软件 | 第35-37页 |
| ·分类学参考文献 | 第37页 |
| ·生物学基本信息数据库 | 第37-40页 |
| ·鲽形目分类学信息研究中存在的问题 | 第40-41页 |
| 3 拟解决的问题、研究方法及主要研究内容 | 第41-44页 |
| ·拟解决的问题 | 第41-42页 |
| ·研究方法 | 第42-43页 |
| ·主要研究内容 | 第43-44页 |
| 第二章 鲽形目分类学信息体系构建 | 第44-75页 |
| 0 引言 | 第44-45页 |
| 1 确定数据标准 | 第45-49页 |
| ·材料 | 第45页 |
| ·对鲽形目分类学数据适用的标准化原则的分析 | 第45-48页 |
| ·元数据属性及功能的界定 | 第45页 |
| ·GTI 标准化的分类学产出模式分析 | 第45-48页 |
| ·结果与讨论 | 第48-49页 |
| 2 数据源特征 | 第49-52页 |
| ·材料 | 第49页 |
| ·数据源分析与甄选 | 第49-51页 |
| ·结果与讨论 | 第51-52页 |
| 3 源数据的规范化处理 | 第52-55页 |
| ·材料 | 第52页 |
| ·系统数据集 | 第52页 |
| ·样本数据采集 | 第52页 |
| ·源数据分析与规范化设计 | 第52页 |
| ·结果与讨论 | 第52-55页 |
| 4 构建PTIAS 系统数据体系 | 第55-71页 |
| ·材料 | 第55页 |
| ·分析与设计 | 第55-71页 |
| ·系统数据体系模块设计 | 第55页 |
| ·系统基本元数据模块之间的关系 | 第55-56页 |
| ·模块元数据通用结构 | 第56-57页 |
| ·系统元数据模块主要内容 | 第57-70页 |
| ·系统数据库的构建 | 第70-71页 |
| ·结果与讨论 | 第71页 |
| 5 序列信息与传统分类学信息的弥合 | 第71-73页 |
| ·材料 | 第71页 |
| ·分类学数据的弥合需求分析 | 第71-73页 |
| ·数据弥合方向与范围 | 第71-72页 |
| ·数据弥合方法 | 第72-73页 |
| ·结果与讨论 | 第73页 |
| 6 本章小结 | 第73-75页 |
| 第三章 鲽形目分类信息分析系统的构建与实现 | 第75-125页 |
| 0 引言 | 第75页 |
| 1 开发与运行环境 | 第75-76页 |
| ·开发环境 | 第76页 |
| ·运行环境 | 第76页 |
| ·参考源码 | 第76页 |
| 2 系统核心组件与功能框架 | 第76-79页 |
| ·材料 | 第76页 |
| ·设计与方法 | 第76-78页 |
| ·结果与分析 | 第78-79页 |
| 3 系统模块的设计与功能实现 | 第79-119页 |
| ·命名与名录模块 | 第79-82页 |
| ·材料 | 第79页 |
| ·设计与方法 | 第79-80页 |
| ·结果与讨论 | 第80-82页 |
| ·分类阶元系统模块 | 第82-85页 |
| ·材料 | 第82页 |
| ·设计与方法 | 第82-83页 |
| ·模块界面结构组成及功能实现 | 第83-84页 |
| ·结果与讨论 | 第84-85页 |
| ·分类检索表模块 | 第85-90页 |
| ·材料 | 第85页 |
| ·设计与方法 | 第85-86页 |
| ·模块界面结构组成及功能实现 | 第86-88页 |
| ·结果与讨论 | 第88-90页 |
| ·DNA 条码模块 | 第90-93页 |
| ·材料 | 第90页 |
| ·设计与方法 | 第90页 |
| ·模块界面结构组成和功能实现 | 第90-93页 |
| ·结果与分析 | 第93页 |
| ·分子标记模块 | 第93-98页 |
| ·材料 | 第93页 |
| ·设计与方法 | 第93-95页 |
| ·模块界面结构组成和功能实现 | 第95-97页 |
| ·结果与分析 | 第97-98页 |
| ·分子系统分析软件模块 | 第98-105页 |
| ·材料 | 第98-99页 |
| ·设计与方法 | 第99-105页 |
| ·Blast 组件 | 第99-102页 |
| ·Clustal W 组件 | 第102-103页 |
| ·Phylip 程序包组件 | 第103-104页 |
| ·Treeview X 调用 | 第104-105页 |
| ·结果与分析 | 第105页 |
| ·生物学基本信息模块 | 第105-107页 |
| ·材料 | 第105页 |
| ·设计与方法 | 第105页 |
| ·模块界面结构组成及功能实现 | 第105-106页 |
| ·结果与分析 | 第106-107页 |
| ·参考文献模块 | 第107-110页 |
| ·材料 | 第107页 |
| ·设计方法、界面结构组成和功能实现 | 第107-109页 |
| ·结果与分析 | 第109-110页 |
| ·支序回溯系统模块 | 第110-112页 |
| ·材料 | 第110页 |
| ·设计方法、界面结构组成和功能实现 | 第110-111页 |
| ·结果与分析 | 第111-112页 |
| ·数据处理模块 | 第112-115页 |
| ·材料 | 第112页 |
| ·设计与方法 | 第112-114页 |
| ·结果与分析 | 第114-115页 |
| ·文件与数据管理模块 | 第115-117页 |
| ·材料 | 第115页 |
| ·设计方法、界面结构组成和功能实现 | 第115-117页 |
| ·结果与分析 | 第117页 |
| ·通用组合查询模块 | 第117-119页 |
| ·材料 | 第117页 |
| ·设计方法、界面结构组成和功能实现 | 第117-119页 |
| ·结果与分析 | 第119页 |
| 4 模块组合与系统构建 | 第119-125页 |
| ·材料 | 第119页 |
| ·设计与方法 | 第119-121页 |
| ·系统组件 | 第119页 |
| ·数据的系统集成与关联 | 第119-121页 |
| ·系统界面结构组成与功能实现 | 第121-122页 |
| ·结果与讨论 | 第122-125页 |
| ·编码要点 | 第122-123页 |
| ·系统主要技术特点 | 第123-125页 |
| 第四章 结论与展望 | 第125-131页 |
| 1 总结 | 第125-128页 |
| ·建立了鲽形目分类学信息元数据体系 | 第125页 |
| ·建立了GTI 分类学数据源采集模式 | 第125-126页 |
| ·开发了12 个分类学功能模块 | 第126-127页 |
| ·实现了不同阶元组合的信息关联 | 第127页 |
| ·探索建立了数字化支序回溯系统 | 第127-128页 |
| ·建立了特定阶元分类学信息分析软件的开发模式 | 第128页 |
| 2 讨论与未来工作 | 第128-131页 |
| ·讨论 | 第128-130页 |
| ·专业知识 | 第128-129页 |
| ·研究范围与探索重点 | 第129页 |
| ·可持续开发与应用 | 第129页 |
| ·版权与语言障碍 | 第129-130页 |
| ·后期工作 | 第130-131页 |
| 参考文献 | 第131-142页 |
| 著作权、论文及相关成果 | 第142-143页 |
| 致谢 | 第143页 |
