基于隐马尔可夫模型的EST序列聚类研究
| 摘要 | 第1-5页 |
| ABSTRACT | 第5-10页 |
| 第一章 绪论 | 第10-28页 |
| ·研究背景 | 第10-11页 |
| ·EST序列介绍 | 第11-21页 |
| ·EST序列的产生 | 第11-13页 |
| ·EST序列的特点 | 第13页 |
| ·EST序列特征 | 第13-14页 |
| ·EST序列的处理流程 | 第14-16页 |
| ·EST序列的预处理 | 第16-17页 |
| ·EST序列的研究现状 | 第17-20页 |
| ·EST数据资源 | 第20-21页 |
| ·EST聚类研究 | 第21-24页 |
| ·EST聚类分类 | 第21-22页 |
| ·EST聚类算法 | 第22-23页 |
| ·EST序列聚类研究现状 | 第23-24页 |
| ·本文的研究意义 | 第24-26页 |
| ·本文的结构 | 第26-28页 |
| 第二章 隐马尔可夫模型(HMM)介绍 | 第28-36页 |
| ·隐马尔可夫模型的定义 | 第28-29页 |
| ·模型的三个关键问题 | 第29-33页 |
| ·隐马尔可夫模型在聚类中的应用 | 第33-34页 |
| ·隐马尔可夫模型在生物学中的应用 | 第34-35页 |
| ·小结 | 第35-36页 |
| 第三章 基于隐马尔可夫模型的EST聚类 | 第36-52页 |
| ·总体框架设计 | 第36-37页 |
| ·特征值的提取及特征向量的确定 | 第37-40页 |
| ·基于模型的聚类 | 第40-41页 |
| ·基于特征向量的隐马尔可夫模型聚类 | 第41-51页 |
| ·EST特征值的选取和特征向量的相似性度量方法 | 第41-43页 |
| ·K-均值聚类 | 第43-44页 |
| ·建立隐马尔可夫模型需要解决的几个问题 | 第44-46页 |
| ·隐马尔可夫模型的建立 | 第46-48页 |
| ·基于HMM的序列比对 | 第48-51页 |
| ·小结 | 第51-52页 |
| 第四章 实验及结果分析 | 第52-63页 |
| ·数据准备及处理 | 第52-53页 |
| ·K-均值聚类 | 第53-55页 |
| ·隐马尔可夫模型的训练 | 第55-57页 |
| ·数据测试及聚类评估 | 第57-61页 |
| ·与其他方法的比较 | 第61-62页 |
| ·小结 | 第62-63页 |
| 第五章 总结与展望 | 第63-65页 |
| ·全文总结 | 第63页 |
| ·不足与改进建议 | 第63-65页 |
| 附录 1 缩略词 | 第65-66页 |
| 附录 2 EST网络资源 | 第66-67页 |
| 参考文献 | 第67-71页 |
| 致谢 | 第71页 |
