植物内含子进化模式研究
| 摘要 | 第1-9页 |
| Abstract | 第9-11页 |
| 1 前言 | 第11-13页 |
| 2 文献综述 | 第13-22页 |
| ·内含子的概念、类型及特点 | 第13-14页 |
| ·内含子进化的时间问题 | 第14-16页 |
| ·内含子丢失是否是进化的主导? | 第16-17页 |
| ·内含子丢失和获得的机制 | 第17-19页 |
| ·内含子丢失的机制 | 第17-18页 |
| ·内含子获得的机制 | 第18-19页 |
| ·关于内含子起源的两个紧密联系系统 | 第19页 |
| ·内含子进化的动力 | 第19-20页 |
| ·一种新的解释:不同的重组率 | 第20页 |
| ·植物内含子进化研究及其特点 | 第20-22页 |
| 3 材料与方法 | 第22-28页 |
| ·序列和注释来源 | 第22页 |
| ·相关内含子信息的整理及内含子矩阵获得 | 第22-23页 |
| ·确定同源序列 | 第23页 |
| ·直系同源基因确定 | 第23页 |
| ·拟南芥和水稻旁系同源基因确定 | 第23页 |
| ·多序列联配 | 第23-24页 |
| ·内含子获得/丢失分析算法 | 第24-26页 |
| ·区段重复与串联重复基因的内含子获得/丢失分析 | 第26-27页 |
| ·表达数据获得和分析 | 第27-28页 |
| 4 结果与分析 | 第28-39页 |
| ·植物内含子基本特征 | 第28-31页 |
| ·植物10物种直系同源基因间内含子进化结果 | 第31-34页 |
| ·不同科属内内含子进化分析 | 第34-35页 |
| ·拟南芥区段重复基因及串联重复基因内含子进化 | 第35-36页 |
| ·水稻和拟南芥旁系同源基因间内含子进化结果 | 第36页 |
| ·基因表达与内含子长度和基因内含子密度 | 第36-37页 |
| ·新近获得内含子的来源 | 第37-39页 |
| 5 讨论 | 第39-50页 |
| ·植物内含子的特点 | 第39页 |
| ·重大进化历史事件对内含子的影响 | 第39-40页 |
| ·内含子在植物进化过程中的演变 | 第40-42页 |
| ·影响植物内含子进化的因素 | 第42-44页 |
| ·重复基因的影响 | 第42页 |
| ·选择压对内含子进化的影响 | 第42页 |
| ·基因表达对内含子的影响 | 第42-43页 |
| ·内含子丢失和获得的机制 | 第43-44页 |
| ·新获得植物内含子的来源 | 第44-46页 |
| ·植物内含子研究的实际意义和应用 | 第46-48页 |
| ·将来的工作 | 第48-50页 |
| 6 结语 | 第50-51页 |
| 参考文献 | 第51-58页 |
| 附录 | 第58-65页 |
| 致谢 | 第65页 |
