| 摘要 | 第1-4页 |
| Abstract | 第4-7页 |
| 第一章 绪论 | 第7-13页 |
| ·引言 | 第7-9页 |
| ·生物信息学研究内容及现状 | 第9-11页 |
| ·本文所做的工作 | 第11-13页 |
| 第二章 生物序列比对 | 第13-27页 |
| ·序列比对概述 | 第13-17页 |
| ·多序列比对问题 | 第14页 |
| ·空位罚分 | 第14-15页 |
| ·替代矩阵 | 第15-16页 |
| ·序列比对结果的评判标准 | 第16-17页 |
| ·序列比对算法 | 第17-24页 |
| ·全局和局部比对 | 第17页 |
| ·双序列比对 | 第17-20页 |
| ·多序列比对 | 第20-24页 |
| ·本章小结 | 第24-27页 |
| 第三章 基于最大权值路径算法的全局DNA多序列比对方法 | 第27-41页 |
| ·图论基础知识 | 第27-28页 |
| ·基于最大权值路径算法的全局DNA多序列比对方法 | 第28-39页 |
| ·算法的引入 | 第28-29页 |
| ·算法的描述 | 第29-34页 |
| ·构造de bruijn图 | 第30-31页 |
| ·转化图 | 第31-33页 |
| ·从图中提取调和序列 | 第33-34页 |
| ·两两比对 | 第34页 |
| ·算法分析 | 第34-35页 |
| ·实验结果及性能分析 | 第35-39页 |
| ·实验结果 | 第35-38页 |
| ·性能分析 | 第38-39页 |
| ·本章小结 | 第39-41页 |
| 第四章 基于最大权值路径算法的局部DNA多序列比对方法 | 第41-49页 |
| ·算法的引入 | 第41-44页 |
| ·declumping算法 | 第41-43页 |
| ·泊松估计 | 第43-44页 |
| ·算法描述 | 第44-46页 |
| ·两两之间的局部比对 | 第45页 |
| ·declump de Bruijn图 | 第45-46页 |
| ·算法分析 | 第46页 |
| ·实验结果及性能分析 | 第46-48页 |
| ·实验结果 | 第46-47页 |
| ·性能分析 | 第47-48页 |
| ·本章小结 | 第48-49页 |
| 第五章 结论与展望 | 第49-51页 |
| 致谢 | 第51-53页 |
| 参考文献 | 第53-57页 |
| 研究成果 | 第57页 |