用最短路径传递共表达预测拟南芥基因功能
| 摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-11页 |
| 第一章 绪论 | 第11-15页 |
| ·选题背景和选题意义 | 第11-12页 |
| ·研究现状 | 第12-13页 |
| ·研究内容 | 第13页 |
| ·论文结构 | 第13-15页 |
| 第二章 研究背景 | 第15-23页 |
| ·基因芯片技术 | 第15-16页 |
| ·基因芯片技术简介 | 第15页 |
| ·基因芯片技术在拟南芥研究中的应用 | 第15-16页 |
| ·数据挖掘技术 | 第16-19页 |
| ·数据挖掘技术简介 | 第16-18页 |
| ·数据挖掘技术在生物信息中的应用 | 第18页 |
| ·常用的用于生物信息处理的数据挖掘工具 | 第18-19页 |
| ·基因功能预测的常用方法 | 第19-22页 |
| ·层次聚类法 | 第19-20页 |
| ·K-均值聚类算法 | 第20-21页 |
| ·自组织映射图 | 第21-22页 |
| ·本章小结 | 第22-23页 |
| 第三章 拟南芥数据库 | 第23-27页 |
| ·拟南芥数据库 | 第23-25页 |
| ·花药表达基因数据 | 第23-24页 |
| ·拟南芥基因共表达数据 | 第24-25页 |
| ·GO 数据库 | 第25-26页 |
| ·本章小结 | 第26-27页 |
| 第四章 基于最短路径的基因功能预测 | 第27-36页 |
| ·算法思想基础 | 第27-28页 |
| ·传递共表达 | 第27页 |
| ·基于最短路径的基因表达数据分析 | 第27-28页 |
| ·用最短路径预测拟南芥基因功能 | 第28-30页 |
| ·图的构建 | 第28-29页 |
| ·最短路径算法 | 第29-30页 |
| ·实验结果 | 第30-35页 |
| ·实验步骤 | 第30-32页 |
| ·实验结果及结果验证 | 第32-34页 |
| ·实验结果分析 | 第34-35页 |
| ·本章小结 | 第35-36页 |
| 第五章 最短路径方法的分析 | 第36-43页 |
| ·最大团分析代谢通路下的基因表达数据 | 第36-38页 |
| ·最大团算法的基本定义 | 第36页 |
| ·最大团算法的数学描述 | 第36-37页 |
| ·最大团算法的应用 | 第37-38页 |
| ·K-均值聚类法分析代谢通路下的基因表达数据 | 第38-39页 |
| ·实验方法验证 | 第39-42页 |
| ·以基因语义相似性的度量来比较不同的实验方法 | 第39-42页 |
| ·实验方法比较分析 | 第42页 |
| ·本章小结 | 第42-43页 |
| 第六章 总结和展望 | 第43-44页 |
| ·总结 | 第43页 |
| ·展望 | 第43-44页 |
| 致谢 | 第44-45页 |
| 参考文献 | 第45-49页 |
| 附录 | 第49-51页 |
| 硕士期间发表的论文 | 第51页 |
