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地方猪遗传多样性的微卫星DNA标记检测与评估方法研究

摘要第1-10页
ABSTRACT第10-12页
1 文献综述第12-37页
   ·引言第12-13页
   ·地方猪品种资源及遗传多样性研究第13-22页
     ·我国具有丰富的猪品种资源第13-14页
     ·地方猪品种遗传多样性研究现状第14-20页
     ·地方猪品种保护动态及紧迫性第20-22页
   ·分子标记检测遗传多样性的数据分析方法第22-28页
     ·(0,1)编码的DNA片段数据处理第22-23页
     ·基因频率数据处理第23-26页
     ·个体基因型数据处理第26页
     ·mtDNA单倍型数据处理第26-27页
     ·核苷酸序列数据处理第27-28页
   ·微卫星DNA标记及其应用第28-37页
     ·微卫星DNA结构及遗传特性第28-31页
     ·微卫星DNA标记应用于遗传多样性评估第31-33页
     ·微卫星DNA标记应用于构建遗传连锁图谱、定位QTL及标记辅助选择第33-35页
     ·微卫星DNA标记应用于杂种优势预测第35-36页
     ·微卫星DNA标记应用于个体识别和品种归属鉴定第36-37页
2 研究目的和意义第37-39页
3 材料与方法第39-57页
   ·样品采集第39-40页
   ·主要仪器、试剂及溶液配制第40-43页
     ·主要仪器第40页
     ·主要试剂第40-41页
     ·主要溶液配制第41-43页
   ·猪基因组DNA的提取与检测第43-44页
     ·全血裂解法提取猪基因组DNA第43页
     ·从耳组织提取猪基因组DNA第43-44页
     ·猪基因组DNA检测第44页
   ·微卫星DNA多态检测第44-54页
     ·微卫星DNA扩增第44-51页
     ·琼脂糖凝胶电泳检测第51页
     ·聚丙烯酰胺凝胶电泳和银染检测第51-52页
     ·ABI373型全自动DNA测序仪检测第52-53页
     ·ABI310型全自动DNA测序仪检测第53-54页
   ·PCR产物回收与克隆第54-56页
     ·目的片段的重扩增与富集第54页
     ·目的片段的回收第54页
     ·目的片段的克隆第54-56页
   ·数据统计分析第56-57页
     ·群体内遗传变异分析第56页
     ·群体间遗传关系分析第56页
     ·品种归属判定及标记判定能力分析第56-57页
4 结果第57-74页
   ·微卫星DNA多态检测结果第57页
   ·PCR产物测序与序列比对第57-59页
   ·太湖猪类群内遗传变异与类群间遗传关系第59-63页
     ·微卫星DNA座位遗传变异与Hardy-Weinberg平衡检验第59页
     ·太湖猪、姜曲海猪和东串猪群体内遗传变异第59-61页
     ·太湖猪、姜曲海猪和东串猪群体间遗传关系第61-63页
   ·中国部分猪品种与欧洲猪品种间遗传关系第63-64页
   ·小型猪品种内遗传变异与品种间遗传关系第64-69页
     ·微卫星DNA座位遗传变异与Hardy-Weinberg平衡检验第64页
     ·小型猪品种内遗传变异第64-66页
     ·小型猪品种间遗传关系第66-69页
   ·奥克兰猪品种内遗传变异与及其起源第69-72页
     ·微卫星DNA座位遗传变异与Hardy-Weinberg平衡检验第69页
     ·奥克兰猪品种内遗传变异第69页
     ·奥克兰猪与其它猪品种间遗传关系第69-72页
   ·品种归属判定及微卫星DNA标记判定能力第72-74页
5 讨论第74-88页
   ·微卫星DNA判型的准确性第74页
   ·太湖猪类群内遗传变异与类群间遗传关系第74-78页
     ·微卫星DNA座位遗传变异与Hardy-Weinberg平衡检验第74-76页
     ·太湖猪、姜曲海猪和东串猪群体内遗传变异第76-77页
     ·太湖猪、姜曲海猪和东串猪群体间遗传关系第77-78页
   ·中国部分猪品种与欧洲猪品种间遗传关系第78-79页
   ·小型猪品种内遗传变异与品种间遗传关系第79-82页
     ·微卫星DNA座位遗传变异与Hardy-Weinberg平衡检验第79-80页
     ·小型猪品种内遗传变异第80页
     ·小型猪品种间遗传关系第80-82页
   ·奥克兰猪群体遗传变异及其起源第82-83页
     ·微卫星DNA座位遗传变异与Hardy-Weinberg平衡检验第82页
     ·奥克兰猪品种内遗传变异与其它猪品种间遗传关系第82-83页
   ·微卫星DNA标记应用于猪品种归属判定第83-84页
   ·微卫星DNA标记应用于品种保护的可能性第84-85页
   ·微卫星DNA标记应用于遗传多样性评估中的一些问题第85-87页
     ·品种的抽样方式和样本含量第85页
     ·微卫星DNA标记的数目第85-86页
     ·微卫星DNA多态检测方式的比较第86页
     ·微卫星DNA多态检测中的“影子带”第86-87页
   ·关于进一步的工作第87-88页
6 结语第88-90页
参考文献第90-102页
致谢第102-104页
附录Ⅰ 微卫星DNA多态检测图像第104-108页
附求Ⅱ PCR产物测序结果第108-112页
附录Ⅲ 本研究常用的一些网址第112-113页
附录Ⅳ 在读期间发表文章第113页

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