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四川松针散斑壳菌的种群结构及其遗传分析

摘要第1-6页
Abstract第6-13页
1 文献综述第13-32页
   ·松树及其分布第13-15页
   ·松树落针病及其病原第15-19页
     ·病害症状第15页
     ·病害分布及危害第15页
     ·松落针病病原及发病规律第15-19页
       ·病原菌的确定第15-16页
       ·散斑壳菌的生态习性及其致病性第16-18页
       ·松落针病发病规律及侵染循环第18-19页
   ·散斑壳属菌的分类第19-21页
     ·散斑壳属的分类地位及研究进展第19-20页
     ·松针上散斑壳的分类第20-21页
   ·分子生物学技术在植物病原真菌研究中的应用第21-29页
     ·遗传标记第21-22页
     ·PCR技术第22-23页
     ·限制性片段长度多态性(RFLP)第23页
     ·随机扩增多态性DNA技术(RAPD)第23-25页
     ·核酸序列分析第25-26页
     ·rRNA基因ITS区序列分析在真菌分类鉴定及系统学研究中的应用第26-29页
       ·真菌rRNA组成与结构第27页
       ·ITS区序列分析与真菌分类鉴定第27-28页
       ·引物与核糖体核酸序列分析的应用第28-29页
   ·分子生物学技术在松生散斑壳属真菌研究中的应用第29-30页
   ·四川松树落针病及其病原菌研究进展第30-31页
   ·本研究的目的、意义及拟解决的主要问题第31-32页
2 四川松树针叶上散斑壳菌的形态学分类与分离培养第32-44页
   ·样品的采集与整理第32页
   ·形态学鉴定第32-33页
     ·外部形态观察第32-33页
     ·制片及显微检查第33页
     ·描述及绘图第33页
   ·发病率的统计第33页
   ·培养性状的观察及记载第33页
     ·病原菌的分离培养第33页
     ·培养性状的观察第33页
   ·四川松树针叶上散斑壳菌种的形态描述及种的检索表第33-37页
     ·针叶树散斑壳第34页
     ·松针散斑壳第34页
     ·四川散斑壳第34-35页
     ·印度散斑壳第35页
     ·南方散斑壳第35-36页
     ·二郎山散斑壳第36页
     ·库曼散斑壳第36页
     ·分种检索表第36-37页
   ·四川松树林区松落针病发病情况及病原菌第37-39页
   ·培养性状的记述第39-43页
   ·人工培养条件下散斑壳菌无有性态产生第43-44页
3 四川松树散斑壳菌的RAPD分子标记及遗传多样性分析第44-59页
   ·供试菌株第44页
   ·仪器与试剂第44-45页
     ·主要试剂第44-45页
     ·仪器设备第45页
   ·菌丝体的培养与收集第45页
   ·DNA的提取及检测第45-46页
     ·DNA的提取第45-46页
     ·DNA的检测及定量第46页
   ·基因组DNA的PCR扩增第46-48页
     ·引物的筛选第46-47页
     ·RAPD反应体系的优化第47页
     ·反应条件的建立第47-48页
     ·反应产物的检测第48页
     ·数据处理第48页
   ·散斑壳菌的RAPD标记与遗传多样性分析第48-51页
     ·DNA的提取及引物的筛选第48-49页
     ·PCR反应条件的优化第49-51页
       ·dNTPs浓度对PCR的影响第49-50页
       ·Mg~(2+)浓度对PCR的影响第50页
       ·DNA模板的量对PCR的影响第50-51页
       ·Taq酶用量对PCR的影响第51页
       ·RAPD引物浓度对PCR的影响第51页
   ·散斑壳菌的RAPD结果分析第51-59页
     ·散斑壳RAPD分析的最佳反应条件第52页
     ·扩增图谱的特征第52页
     ·遗传相似性的系统聚类分析第52-59页
       ·24株散斑壳菌系统聚类分析第52-56页
       ·系统聚类与地理来源相关性分析第56-57页
       ·系统聚类与寄主的相关性分析第57-59页
4 四川松树散斑壳菌的rRNA基因ITS区的PCR、克隆和序列分析第59-74页
   ·试验菌株第59页
   ·药品和试剂第59页
     ·常规药品及试剂第59页
     ·培养基第59页
     ·分子生物学试剂第59页
   ·主要仪器设备第59-60页
   ·实验方法第60-63页
     ·散斑壳真菌细胞总DNA的提取第60页
       ·不同种散斑壳菌丝体的获得第60页
       ·散斑壳真菌细胞总DNA的提取第60页
     ·散斑壳属不同种rRNA基因ITS区的PCR扩增第60-61页
       ·扩增引物第60页
       ·PCR扩增反应体系第60-61页
       ·PCR扩增反应循环第61页
       ·PCR产物电泳检测第61页
     ·不同种散斑壳rRNA基因ITS区的PCR扩增片段的克隆第61-63页
       ·PCR扩增DNA片段的纯化和回收第61页
       ·JM109载体菌感受态细胞的制备第61-62页
       ·回收的DNA片段与pUCm-T载体的连接第62页
       ·重组质粒转入JM109感受态细胞第62页
       ·阳性克隆菌株的筛选和鉴定第62-63页
     ·克隆片段的DNA序列测定及分析第63页
       ·DNA序列的测定第63页
       ·DNA序列的分析第63页
   ·结果与分析第63-72页
     ·散斑壳属不同菌株rRNA基因ITS区序列第63-69页
     ·散斑壳属不同菌株rRNA基因ITS序列的系统发育分析第69-72页
   ·与不同散斑壳菌株的RAPD聚类结果的对比分析第72-74页
5 讨论与结论第74-77页
   ·四川松针散斑壳菌的种群结构复杂多样第74页
   ·改良氯化苄法、改良二次沉淀法是散斑壳菌总DNA的提取的有效方法第74页
   ·四川松树上散斑壳菌遗传多样性丰富第74-75页
   ·四川松针散斑壳属菌株rRNA基因ITS区序列分析第75-77页
6 主要参考文献第77-86页
附图1:四川松树上7种散斑壳菌子囊果外部形态第86-87页
附图2-5:23℃条件下各菌株在PDA培养基上菌落形状第87-91页
附录:已注册并被GenBank接受的四川松针上散斑壳菌rDNA的ITS区序列注册号第91-100页
已发表和待发表相关学术论文第100-101页
致谢第101页

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