miRNA多重调控模式的影响因素分析与算法研究
| 摘要 | 第1-4页 |
| Abstract | 第4-7页 |
| 第1章 引言 | 第7-19页 |
| ·miRNA 的发现与历史 | 第7-9页 |
| ·miRNA 的生物发生 | 第9-12页 |
| ·miRNA 的命名原则 | 第9-12页 |
| ·miRNA 的生物发生与作用机制 | 第12-14页 |
| ·miRNA 的生物发生 | 第12-13页 |
| ·miRNA 的作用机制 | 第13-14页 |
| ·miRNA 的靶点预测 | 第14-17页 |
| ·常见miRNA 靶点预测软件 | 第14-15页 |
| ·miRNA 主流靶点预测软件和算法及其应用 | 第15页 |
| ·Findtar | 第15-16页 |
| ·miRanda | 第16-17页 |
| ·microTar | 第17页 |
| ·miTarget | 第17页 |
| ·研究目的与意义 | 第17-19页 |
| 第2章 实验材料和方法 | 第19-32页 |
| ·实验材料 | 第19-21页 |
| ·microRNA 的获取 | 第19页 |
| ·UTR 表达载体的构建 | 第19-21页 |
| ·靶点软件整合 | 第21-22页 |
| ·候选靶点软件分析 | 第21页 |
| ·整合靶点软件copredict | 第21-22页 |
| ·有效靶点的筛选 | 第22-26页 |
| ·竞争性靶点筛选 | 第23页 |
| ·竞争规律 | 第23页 |
| ·靶点筛选 | 第23-24页 |
| ·Seed 介绍 | 第24-26页 |
| ·协同性靶点 | 第26-27页 |
| ·显著性因素分析 | 第27-30页 |
| ·Shuffle 方法阐述 | 第27-28页 |
| ·相关系数 | 第28-29页 |
| ·Wilcoxon 符号秩和检验方法 | 第29-30页 |
| ·因素显著性检验设计 | 第30-31页 |
| ·逐步回归 | 第31-32页 |
| 第3章 实验结果与讨论 | 第32-68页 |
| ·靶点预测程序copredict | 第32-36页 |
| ·靶点预测情况 | 第36-44页 |
| ·筛选竞争性靶点预测结果 | 第36-40页 |
| ·协同作用靶点预测结果 | 第40-44页 |
| ·靶点筛选结果 | 第44页 |
| ·因素分析 | 第44-62页 |
| ·有效靶点分析 | 第44-47页 |
| ·竞争作用靶点分析 | 第47-50页 |
| ·协同作用靶点分析 | 第50-53页 |
| ·UTR 长度分析 | 第53-55页 |
| ·靶点密度分析 | 第55-57页 |
| ·自由能分析 | 第57-60页 |
| ·打分分析 | 第60-62页 |
| ·靶点分 | 第62-65页 |
| ·靶点综合因素与抑制率间的关系 | 第65-66页 |
| ·综合调控关系 | 第66-68页 |
| 第4章 结论 | 第68-70页 |
| 参考文献 | 第70-74页 |
| 致谢 | 第74-75页 |
| 个人简历、在学期间发表的学术论文与研究成果 | 第75页 |