基于概率统计粒子群算法的生物多序列比对研究
| 摘要 | 第1-6页 |
| ABSTRACT | 第6-12页 |
| 第1章 绪论 | 第12-18页 |
| ·引言 | 第12-13页 |
| ·背景和意义 | 第13-14页 |
| ·国内外研究现状 | 第14-16页 |
| ·本文的主要工作及结构 | 第16-18页 |
| 第2章 生物多序列比对基础 | 第18-27页 |
| ·基本概念 | 第18-20页 |
| ·空位罚分 | 第20-21页 |
| ·相似性替换矩阵 | 第21-22页 |
| ·目标函数 | 第22-24页 |
| ·基准比对数据库 | 第24-25页 |
| ·序列比对的分类 | 第25-26页 |
| ·本章小结 | 第26-27页 |
| 第3章 基于概率统计的粒子群算法 | 第27-39页 |
| ·基本粒子群算法 | 第27-30页 |
| ·PSO 算法模型 | 第27-29页 |
| ·标准PSO 算法的局限性 | 第29页 |
| ·PSO 算法的改进 | 第29-30页 |
| ·PPSO 算法 | 第30-38页 |
| ·算法设计 | 第31-33页 |
| ·算法描述 | 第33-35页 |
| ·仿真验证 | 第35-38页 |
| ·本章小结 | 第38-39页 |
| 第4章 基于概率统计粒子群的多序列比对算法 | 第39-55页 |
| ·MSA 问题描述 | 第39-40页 |
| ·MSA 问题和粒子群的映射关系 | 第40-41页 |
| ·PPSO_MSA 算法 | 第41-50页 |
| ·候选解编码方式 | 第41-43页 |
| ·个体极值和全局极值 | 第43页 |
| ·概率分布模型 | 第43-44页 |
| ·候选解迭代方式 | 第44-45页 |
| ·收敛标准 | 第45-46页 |
| ·变异操作 | 第46-47页 |
| ·种群初始化 | 第47页 |
| ·算法描述 | 第47-50页 |
| ·仿真验证 | 第50-53页 |
| ·实验环境和参数设置 | 第50页 |
| ·实验数据与分析 | 第50-53页 |
| ·本章小结 | 第53-55页 |
| 第5章 一种多序列比对软件的设计与实现 | 第55-64页 |
| ·系统目标与功能 | 第56页 |
| ·系统流程 | 第56-57页 |
| ·系统实现 | 第57-60页 |
| ·序列文件模块 | 第58-59页 |
| ·比对算法模块 | 第59-60页 |
| ·输出模块 | 第60页 |
| ·日志模块 | 第60页 |
| ·实例 | 第60-63页 |
| ·本章小结 | 第63-64页 |
| 结论 | 第64-66页 |
| 参考文献 | 第66-71页 |
| 攻读硕士学位期间承担的科研任务与主要成果 | 第71-72页 |
| 致谢 | 第72-73页 |
| 作者简介 | 第73页 |
