| 摘要 | 第1-14页 |
| Abstract | 第14-19页 |
| 第一章 文献综述 | 第19-41页 |
| ·全球玉米种质资源的收集、鉴定与利用 | 第19-23页 |
| ·玉米种质资源的收集与扩增 | 第19-20页 |
| ·玉米种质资源的耐旱性鉴定和评价 | 第20-22页 |
| ·玉米核心种质库的构建及在基因发掘方面的利用 | 第22-23页 |
| ·玉米种质的遗传多样性与杂种优势群 | 第23-28页 |
| ·玉米自交系的遗传多样性 | 第23-25页 |
| ·杂种优势群与杂种优势模式 | 第25-26页 |
| ·利用分子标记划分杂种优势群 | 第26-28页 |
| ·新一代的分子标记—SNP及其单倍型 | 第28-31页 |
| ·SNP标记的特点和检测方法 | 第28-29页 |
| ·高通量SNP基因型鉴定平台 | 第29-30页 |
| ·SNP单倍型与连锁不平衡 | 第30-31页 |
| ·分子标记连锁图谱的构建及偏分离分析 | 第31-33页 |
| ·分子标记连锁图谱的构建 | 第31-32页 |
| ·分子标记偏分离分析 | 第32页 |
| ·染色体遗传重组的变异 | 第32-33页 |
| ·QTL作图及玉米耐旱相关性状的QTL研究 | 第33-40页 |
| ·玉米的耐旱性改良 | 第33-34页 |
| ·QTL的连锁作图和连锁不平衡作图 | 第34-37页 |
| ·QTL的连锁—连锁不平衡联合作图 | 第37-38页 |
| ·选择性基因型鉴定和建池DNA分析 | 第38-39页 |
| ·玉米耐旱相关性状的QTL定位与分子标记辅助选择 | 第39-40页 |
| ·本研究的目的和意义 | 第40-41页 |
| 第二章 利用全基因组SNP标记进行不同类型玉米种质分子特征分析 | 第41-72页 |
| ·材料与方法 | 第41-46页 |
| ·供试材料 | 第41-42页 |
| ·DNA的提取 | 第42-43页 |
| ·SNP基因型分析 | 第43-44页 |
| ·遗传多样性分析 | 第44-45页 |
| ·基于遗传距离的聚类分析 | 第45页 |
| ·群体结构分析 | 第45-46页 |
| ·群体间等位基因频率的比较 | 第46页 |
| ·结果与分析 | 第46-62页 |
| ·SNP标记的分子特征和玉米自交系遗传多样性 | 第46-50页 |
| ·770个自交系的遗传结构及种质类群划分 | 第50-54页 |
| ·种质类群间的遗传距离及等位基因差异 | 第54-62页 |
| ·讨论 | 第62-72页 |
| ·SNP芯片在遗传多样性分析中的利用 | 第62-65页 |
| ·比较SSR和SNP标记在多样性和遗传分析中的应用 | 第65-67页 |
| ·驯化和育种过程对遗传多样性和种质类群划分的影响 | 第67-70页 |
| ·SNP标记辅助的种质资源评价 | 第70-72页 |
| 第三章 玉米核心自交系基因内与基因间的遗传多样性及标记间的LD分析 | 第72-84页 |
| ·材料与方法 | 第73-74页 |
| ·供试材料 | 第73页 |
| ·DNA的提取与SNP基因型分析 | 第73-74页 |
| ·单倍型的构建 | 第74页 |
| ·遗传多样性分析 | 第74页 |
| ·SNP标记间LD分析 | 第74页 |
| ·结果与分析 | 第74-81页 |
| ·SNP和SNP单倍型特征分析 | 第74-75页 |
| ·不同类型SNP标记及单倍型的遗传多样性比较 | 第75-76页 |
| ·SNP标记间的LD分析 | 第76-79页 |
| ·SNP标记间的LD衰减 | 第79-81页 |
| ·讨论 | 第81-84页 |
| ·基因组不同区域的遗传多样性及单倍型分析 | 第81页 |
| ·遗传标记间的LD及其影响因素 | 第81-82页 |
| ·LD与单倍型分析 | 第82-83页 |
| ·LD与性状的关联分析 | 第83-84页 |
| 第四章 两种水分处理下玉米耐旱性评价和多个选择指标的比较 | 第84-101页 |
| ·材料与方法 | 第84-87页 |
| ·供试材料 | 第84-85页 |
| ·田间实验和耐旱相关性状调查 | 第85-87页 |
| ·数据分析 | 第87页 |
| ·结果与分析 | 第87-97页 |
| ·方差分析所揭示的遗传变异 | 第87-91页 |
| ·不同生长阶段NDVI的比较 | 第91页 |
| ·耐旱相关性状的遗传率分析 | 第91-92页 |
| ·耐旱相关性状的遗传相关分析 | 第92-95页 |
| ·耐旱相关性状的主成分分析 | 第95页 |
| ·选择指数与玉米耐旱性 | 第95-96页 |
| ·玉米耐旱种质资源的产量表现 | 第96-97页 |
| ·讨论 | 第97-101页 |
| ·耐旱性的次级性状及其相对重要性 | 第97-98页 |
| ·NDVI(生物量)可作为评价耐旱性的可靠指标 | 第98-99页 |
| ·营养生长和生殖生长阶段的耐旱性筛选 | 第99-100页 |
| ·耐旱选择进展给我们的启示 | 第100-101页 |
| 第五章 SNP标记连锁图谱的构建及偏分离分析 | 第101-120页 |
| ·材料与方法 | 第101-104页 |
| ·供试材料 | 第101-102页 |
| ·DNA的提取和SNP基因型分析 | 第102页 |
| ·分子标记连锁图谱的构建 | 第102-103页 |
| ·整合连锁图谱的构建 | 第103页 |
| ·SNP、SSR和核心标记物理位置的确定 | 第103-104页 |
| ·偏分离的检测 | 第104页 |
| ·遗传重组变异的检测 | 第104页 |
| ·结果与分析 | 第104-115页 |
| ·SNP标记信息 | 第104-105页 |
| ·连锁图谱和整合连锁图谱的构建 | 第105-107页 |
| ·偏分离分析 | 第107-110页 |
| ·遗传重组及遗传距离与物理距离的比率 | 第110-115页 |
| ·讨论 | 第115-120页 |
| ·整合连锁图谱及其在遗传育种中的应用 | 第115-116页 |
| ·与偏分离相关联的染色体区域 | 第116-118页 |
| ·染色体遗传重组的变异 | 第118-120页 |
| 第六章 两种水分处理下玉米株高及不同时期NDVI的QTL分析 | 第120-142页 |
| ·材料与方法 | 第121-124页 |
| ·供试材料 | 第121页 |
| ·田间试验与性状调查 | 第121页 |
| ·SNP基因型鉴定 | 第121-123页 |
| ·数据分析 | 第123页 |
| ·连锁作图 | 第123页 |
| ·LD作图 | 第123-124页 |
| ·结果与分析 | 第124-137页 |
| ·SNP和SNP单倍型的基本统计分析 | 第124-126页 |
| ·利用连锁作图进行NDVI与株高QTL的检测 | 第126-130页 |
| ·利用LD作图进行NDVI与株高QTL的检测 | 第130-135页 |
| ·单标记和单倍型LD作图结果的比较 | 第135页 |
| ·连锁作图和LD作图结果的比较 | 第135-136页 |
| ·NDVI与株高QTL的比较分析 | 第136-137页 |
| ·讨论 | 第137-142页 |
| ·基于SNP标记全基因组扫描的LD分析 | 第137-138页 |
| ·LD作图时群体结构分析的必要性 | 第138-139页 |
| ·新耐旱指标—NDVI的QTL定位分析 | 第139-140页 |
| ·相关性状的QTL分析 | 第140页 |
| ·本研究结果与同类研究的比较 | 第140-142页 |
| 第七章 利用连锁—连锁不平衡的联合作图提高QTL分析的效率:以散粉—吐丝间隔期为例 | 第142-172页 |
| ·材料与方法 | 第143-145页 |
| ·供试材料 | 第143页 |
| ·田间试验与性状调查 | 第143页 |
| ·数据分析 | 第143-144页 |
| ·遗传结构的分析 | 第144页 |
| ·连锁作图与LD作图 | 第144页 |
| ·连锁—连锁不平衡的联合作图 | 第144-145页 |
| ·整合QTL图谱的构建 | 第145页 |
| ·结果与分析 | 第145-166页 |
| ·525份玉米自交系中SNP和SNP单倍型的遗传多样性 | 第145-147页 |
| ·群体结构分析 | 第147-148页 |
| ·连锁作图所鉴定的ASI QTL | 第148-152页 |
| ·基于LD的ASI QTL分析 | 第152-156页 |
| ·基于连锁—连锁不平衡整合作图的QTL分析 | 第156-161页 |
| ·连锁作图、LD作图和连锁-LD整合作图的比较 | 第161页 |
| ·关联SNP所揭示的候选基因 | 第161-166页 |
| ·讨论 | 第166-172页 |
| ·选择性基因型分析的效率 | 第166页 |
| ·群体大小对QTL作图的影响 | 第166-167页 |
| ·等位基因数目和等位基因频率对LD作图的影响 | 第167-168页 |
| ·连锁—连锁不平衡联合作图提高了QTL作图的效率 | 第168-169页 |
| ·玉米耐旱QTL的研究 | 第169-170页 |
| ·育种应用 | 第170-172页 |
| 参考文献 | 第172-190页 |
| 附录 | 第190-228页 |
| 附录1 供试材料名称、来源及表型特征 | 第190-217页 |
| 附录2 用3个RIL群体所构建的整合遗传连锁图谱 | 第217-228页 |
| 致谢 | 第228-230页 |
| 攻读博士学位期间发表的学术论文 | 第230-231页 |
