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玉米根系低磷胁迫响应分子机理的初步研究

摘要第1-7页
Abstract第7-15页
1 文献综述第15-37页
   ·玉米耐低磷基因型的筛选研究现状第15-17页
     ·玉米耐低磷的筛选方法第15页
     ·玉米耐低磷的筛选指标第15页
     ·玉米耐低磷的筛选压力第15-16页
     ·玉米耐低磷种质资源筛选的研究现状第16-17页
   ·植物响应低磷胁迫适应性机制的研究进展第17-23页
     ·植物根系形态和结构的变化第17-18页
     ·植物根际微环境的变化第18页
     ·根际微生物形成菌根共生体第18页
     ·生化反应及代谢途径的变化第18-19页
     ·内源激素第19-20页
     ·分子水平上的适应性变化第20-23页
       ·与低磷胁迫相关基因的诱导表达第20-21页
       ·植物无机磷转运子的表达与调控第21-23页
         ·植物无机磷转运子的结构与功能第21-22页
         ·植物高亲和力磷转运子的组织特异性表达第22页
         ·植物高亲和力磷转运子的转录调控第22-23页
   ·基因差异表达分析的研究方法与进展第23-29页
     ·mRNA差异显示PCR第23-24页
     ·代表性差异分析第24页
     ·cDNA扩增片段长度多态性第24-25页
     ·抑制性差减杂交第25-26页
     ·基因表达连续性分析第26页
     ·基因芯片技术第26-29页
       ·基因芯片的原理第26-27页
       ·基因芯片在植物磷胁迫基因差异表达中的研究进展第27-29页
   ·植物MIRNA第29-35页
     ·植物miRNA简介第29页
     ·植物miRNA的产生、加工及靶基因识别第29-30页
     ·植物miRNA的功能第30-33页
       ·miRNA调控植物器官发育第30-31页
       ·miRNA调控植物生长素信号第31页
       ·miRNA与植物逆境胁迫响应第31-32页
       ·miRNA与植物低磷胁迫响应第32-33页
     ·植物miRNA的研究方法第33-35页
       ·直接克隆法第33页
       ·生物信息学预测法第33-34页
       ·miRNA芯片第34页
       ·深度测序第34-35页
   ·本研究的目的和意义第35-36页
   ·本研究的主要研究内容第36页
   ·实验技术路线第36-37页
2 材料与方法第37-54页
   ·玉米耐低磷自交系的筛选及根系分析第37-38页
     ·试验材料第37页
     ·试验设计第37-38页
     ·考察性状第38页
   ·玉米根系响应低磷胁迫的全基因组表达分析第38-39页
     ·试验材料第38页
     ·试验设计第38页
     ·芯片分析第38-39页
       ·总RNA提取、溶解与检测第39页
       ·芯片分析第39页
       ·芯片数据处理第39页
   ·候选基因的酶活分析及表达验证第39-42页
     ·试验材料第39页
     ·试验设计第39页
     ·含磷量及酶活分析第39页
     ·候选基因的荧光定量PCR分析第39-42页
       ·总RNA提取第39-40页
       ·逆转录合成cDNA第40页
       ·反转录产物的电泳检测第40页
       ·引物设计与合成第40页
       ·引物的特异性检测第40-41页
       ·产物的回收第41页
       ·标准品的制备和标准曲线的优化第41-42页
       ·实时荧光定量PCR(FQ-PCR)第42页
   ·低磷胁迫下玉米根系小分子RNA文库的构建及MIRNA克隆第42-54页
     ·实验材料第42页
     ·根系总RNA的提取第42页
     ·小分子RNA文库构建第42-44页
     ·miRNA的克隆第44-49页
       ·小分子RNA 5'去磷酸化处理第44页
       ·小分子RNA 3'接头的连接第44-45页
       ·小分子RNA 3'MAGNOTEX-SA的吸附第45页
       ·小分子RNA 5'末端磷酸化第45-46页
       ·小分子RNA的反转录第46页
       ·PCR扩增第46-47页
       ·PCR片段的纯化及切胶回收第47-48页
       ·PCR片段的连接第48-49页
       ·热激法转化第49页
       ·克隆的菌液PCR检测第49页
     ·小分子RNA序列分析第49-50页
     ·miRNA二级结构预测及前体分析第50页
     ·miRNA靶基因预测第50页
     ·miRNA的PCR检测第50-52页
     ·候选miRNA的荧光定量PCR检测第52-54页
3 结果与分析第54-102页
   ·20个玉米自交系的耐低磷筛选结果第54-55页
   ·极端家系在低磷胁迫下的根系变化第55-57页
   ·玉米根系响应低磷胁迫的全基因组表达分析第57-77页
     ·总RNA质量检测结果第57页
     ·差异表达基因第57-59页
     ·差异表达基因的功能分类第59-73页
       ·代谢相关基因第59页
       ·转录因子第59页
       ·转运蛋白相关基因第59-60页
       ·胁迫响应相关基因第60页
       ·信号转导相关基因第60页
       ·其他差异表达基因第60-73页
     ·候选基因的荧光定量PCR第73-75页
       ·荧光定量PCR的溶解曲线与标准曲线第73-74页
       ·荧光定量PCR结果第74-75页
     ·根系含磷量及相关酶活检测结果第75-77页
   ·小分子RNA文库的构建及MIRNA克隆第77-102页
     ·小分子RNA文库的构建第77页
     ·小分子RNA两端连接接头、逆转录PCR扩增结果第77页
     ·克隆挑选及培养第77-78页
     ·菌液PCR筛选结果第78-79页
     ·小分子RNA的测序结果第79-86页
     ·miRNA二级结构预测及前体序列分析第86-94页
     ·12个miRNA在植物中的保守性分析第94页
     ·靶基因预测第94-99页
     ·无机磷转运蛋白的同源性比对及miRNA结合位点分析第99-100页
     ·RT-PCR验证和实时荧光定量PCR分析第100-102页
4 讨论第102-122页
   ·178是一个优良的氮、磷高效型玉米自交系第102-103页
   ·根系可作为今后玉米磷高效种质改良的重要性状第103-104页
   ·基因芯片在本研究中的优势与不足第104-105页
   ·几类差异表达基因在低磷胁迫下的作用及可能的调控机制第105-115页
     ·无机磷转运因子第105-107页
     ·酸性磷酸酶第107页
     ·植酸酶第107-108页
     ·2-脱氧麦根酸合成酶第108-109页
     ·转录因子第109-110页
     ·活性氧与抗性基因第110-113页
     ·植物激素信号第113-115页
   ·几种MIRNA鉴定方法的利弊第115-116页
   ·MIRNA及靶基因在玉米根系响应低磷胁迫过程中的作用第116-120页
     ·Zm-miRNA1第116页
     ·Zm-miRNA2第116-117页
     ·miRNA399b和Zm-miRNA3第117-118页
     ·Zm-miRNA4第118页
     ·Zm-miRNA5第118-119页
     ·Zm-miRNA6第119页
     ·其他miRNA第119-120页
   ·MIRNA介导的玉米根系低磷胁迫响应的调控机制第120-121页
   ·本论文今后研究方向第121-122页
5 结论第122-125页
参考文献第125-143页
致谢第143-145页
附录Ⅰ:总RNA提取第145-146页
附录Ⅱ:基因芯片实验流程第146-153页
附录Ⅲ:CACL_2法制备大肠杆菌DH5A感受态第153-154页
附录Ⅳ:项目资助及论文发表第154-156页

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