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变铅青链霉菌DNA硫修饰的抗氧化功能探索

摘要第5-7页
Abstract第7-9页
符号说明(Abbreviations)第13-15页
第一章 文献综述第15-52页
    1.1 抗氧化系统第15-36页
        1.1.1 超氧阴离子的清除酶系第15-17页
        1.1.2 过氧化氢的清除酶系第17-20页
        1.1.3 有机过氧化物的清除酶系第20-21页
        1.1.4 抗氧化调控系统第21-27页
            1.1.4.1 OxyR调控系统第21-23页
            1.1.4.2 SoxRS调控系统第23-25页
            1.1.4.3 PerR调控系统第25-26页
            1.1.4.4 OhrR第26-27页
        1.1.5 超氧阴离子与过氧化氢对细胞的损伤第27-31页
        1.1.6 半胱氨酸残基的氧化第31-32页
        1.1.7 链霉菌的抗氧化系统第32-36页
    1.2 DNA 硫修饰研究历史第36-49页
        1.2.1 Dnd表型的发现第36-37页
        1.2.2 DNA降解机理的研究进展第37-39页
        1.2.3 负责Dnd表型的dnd基因簇的发现第39-41页
        1.2.4 DNA硫修饰的鉴定第41-42页
        1.2.5 DNA硫修饰结构的确定第42-43页
        1.2.6 DNA硫修饰的序列特异性第43-45页
        1.2.7 优先修饰位点和识别序列第45页
        1.2.8 DNA硫修饰的生理功能第45-47页
        1.2.9 基因组DNA硫修饰位点鉴定第47-48页
        1.2.10 Dnd蛋白的功能第48-49页
    1.3 本研究的内容和意义第49-52页
        1.3.1 本研究的内容第49-50页
        1.3.2 本研究的意义第50-52页
第二章 实验材料和方法第52-72页
    2.1 实验材料第52-59页
        2.1.1 实验菌株和质粒第52-54页
        2.1.2 引物第54-56页
        2.1.3 培养基和试剂第56-59页
    2.2 实验方法第59-72页
第三章 变铅青链霉菌DNA硫修饰的抗氧化功能探索第72-108页
    3.1 前言第72-73页
    3.2 结果与分析第73-106页
        3.2.1 氧化压力下变铅青链霉菌的存活率第73-78页
        3.2.2 DNA硫修饰位点对dnd基因簇转录的影响初探第78-83页
            3.2.2.1 鉴定dndB启动子附近DNA硫修饰位点第79-81页
            3.2.2.2 S9和S13对dnd基因簇转录的影响第81-83页
        3.2.3 野生型变铅青链霉菌1326 与其突变株HXY6 转录组差异分析第83-95页
            3.2.3.1 变铅青链霉菌1326与HXY6 转录组分析第84-90页
            3.2.3.2 过氧化物处理后过氧化物清除酶转录水平分析第90-95页
        3.2.4 探究变铅青链霉菌清除过氧化物的能力第95-101页
            3.2.4.1 各氧化剂浓度标准曲线的绘制第95-96页
            3.2.4.2 测定1326与HXY6对PAA清除能力第96-98页
            3.2.4.3 测定1326与HXY6 对过氧化氢清除能力第98-101页
        3.2.5 氧化剂对dnd基因簇转录的激活第101-106页
            3.2.5.1 dnd基因转录与生长期的关系第101-102页
            3.2.5.2 dnd基因转录对氧化剂处理的响应第102-103页
            3.2.5.3 响应diamide信号的调控蛋白第103-106页
    3.3 本章小结第106-108页
第四章 dndB启动子的调控元件第108-119页
    4.1 前言第108页
    4.2 结果与分析第108-117页
        4.2.1 鉴定dndA与 dndB转录起始位点第108-110页
        4.2.2 鉴定 dndB 调控序列第110-117页
    4.3 本章小结第117-119页
第五章 总结和展望第119-121页
    5.1 总结第119页
    5.2 创新点第119-120页
    5.3 课题展望第120-121页
附录第121-129页
    附表第121-129页
        表1 在突变株HXY6中转录上调的基因第121-126页
        表2 在突变株HXY6中转录下调的基因第126-129页
参考文献第129-144页
致谢第144-145页
攻读学位期间发表的学术论文目录第145页

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