| 摘要 | 第7-9页 |
| ABSTRACT | 第9-11页 |
| 主要符号对照表 | 第12-17页 |
| 第一章 文献综述 | 第17-36页 |
| 1.1 长链非编码RNA在畜禽重要经济性状中的研究进展 | 第17-25页 |
| 1.1.1 LncRNA的作用机制 | 第17-20页 |
| 1.1.2 LncRNA在畜禽经济性状研究中的进展 | 第20-25页 |
| 1.2 乳腺发育与泌乳调控研究进展 | 第25-32页 |
| 1.2.1 乳腺发育与泌乳 | 第25页 |
| 1.2.2 影响奶牛乳腺发育与泌乳的因素 | 第25-28页 |
| 1.2.3 调控奶牛乳腺发育、泌乳的信号通路 | 第28-30页 |
| 1.2.4 奶牛乳腺发育、泌乳与非编码RNA | 第30-32页 |
| 1.3 细胞增殖相关基因的研究进展 | 第32-35页 |
| 1.3.1 CCN家族基因 | 第32-33页 |
| 1.3.2 CDK家族基因 | 第33-34页 |
| 1.3.3 CDKN1A和CDKN1B | 第34-35页 |
| 1.4 本研究的目的意义 | 第35-36页 |
| 第二章 奶牛乳腺差异表达lncRNA及差异表达基因的筛选与鉴定 | 第36-63页 |
| 2.1 前言 | 第36-37页 |
| 2.2 材料与方法 | 第37-42页 |
| 2.2.1 主要仪器和试剂 | 第37-38页 |
| 2.2.2 试验动物和样品采集 | 第38页 |
| 2.2.3 奶牛乳腺组织总RNA提取、质量控制以及RNA文库构建 | 第38-39页 |
| 2.2.4 RNA测序、转录组拼接及基因表达水平定量 | 第39-40页 |
| 2.2.5 已注释和未注释lncRNA的鉴定 | 第40页 |
| 2.2.6 LncRNA靶基因、互作miRNA的预测 | 第40页 |
| 2.2.7 差异表达基因、差异表达lncRNA潜在靶基因的功能富集分析 | 第40页 |
| 2.2.8 定量反转录PCR验证测序数据 | 第40-42页 |
| 2.2.9 数据统计与分析 | 第42页 |
| 2.3 结果与分析 | 第42-61页 |
| 2.3.1 奶牛乳腺组织测序数据概述 | 第42页 |
| 2.3.2 奶牛乳腺组织差异表达基因的功能富集分析 | 第42-52页 |
| 2.3.3 差异表达lncRNA及其潜在互作miRNA | 第52-56页 |
| 2.3.4 奶牛乳腺组织差异表达lncRNA及其潜在靶基因 | 第56-58页 |
| 2.3.5 奶牛乳腺组织差异表达lncRNA及其潜在靶基因互作构建 | 第58-59页 |
| 2.3.6 蛋白质互作网络 | 第59-60页 |
| 2.3.7 测序结果验证 | 第60-61页 |
| 2.4 讨论 | 第61-62页 |
| 2.4.1 LncRNA调控奶牛乳腺发育和泌乳相关基因的表达 | 第61-62页 |
| 2.4.2 LncRNA吸附miRNA调控基因的表达 | 第62页 |
| 2.5 小结 | 第62-63页 |
| 第三章 差异表达lncRNA在奶牛乳腺上皮细胞中的功能研究 | 第63-83页 |
| 3.1 前言 | 第63页 |
| 3.2 材料与方法 | 第63-69页 |
| 3.2.1 试验材料 | 第63-64页 |
| 3.2.2 试验方法 | 第64-69页 |
| 3.3 结果与分析 | 第69-80页 |
| 3.3.1 4个lncRNA的细胞定位 | 第69-70页 |
| 3.3.2 siRNA的干扰效率 | 第70-71页 |
| 3.3.3 干扰表达lncRNA对BMECs活力的影响 | 第71-72页 |
| 3.3.4 EdU试验检测干扰表达lncRNA对BMECs增殖的影响 | 第72-77页 |
| 3.3.5 MTT法检测干扰表达lncRNA对BEMCs活力的影响 | 第77-78页 |
| 3.3.6 干扰相关lncRNA影响细胞增殖相关基因的表达 | 第78-80页 |
| 3.4 讨论 | 第80-82页 |
| 3.5 小结 | 第82-83页 |
| 第四章 差异表达lncRNA与miR-221间的互作研究 | 第83-91页 |
| 4.1 前言 | 第83页 |
| 4.2 材料与方法 | 第83-87页 |
| 4.2.1 试验材料 | 第83-84页 |
| 4.2.2 试验方法 | 第84-86页 |
| 4.2.3 数据统计与分析 | 第86-87页 |
| 4.3 结果与分析 | 第87-88页 |
| 4.3.1 干扰表达或过表达miR-221对4个lncRNA表达量的影响 | 第87页 |
| 4.3.2 miR-221 与TCONS_00015196、TCONS_00087966的互作研究 | 第87-88页 |
| 4.3.3 干扰表达或过表达miR-221 对ErbB3表达量的影响 | 第88页 |
| 4.4 讨论 | 第88-90页 |
| 4.4.1 LncRNA与miR-221之间的互作关系 | 第88-90页 |
| 4.4.2 miR-221对ErbB3表达量的影响 | 第90页 |
| 4.5 小结 | 第90-91页 |
| 结论 | 第91页 |
| 创新点 | 第91页 |
| 后续研究 | 第91-92页 |
| 参考文献 | 第92-110页 |
| 附录 | 第110-144页 |
| 致谢 | 第144-145页 |
| 个人简介 | 第145页 |
