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大丽轮枝菌侵染对茄子幼苗生理特性及基因表达的影响

致谢第6-7页
摘要第7-9页
Abstract第9-11页
第一章 文献综述第16-25页
    1.1 茄子黄萎病研究现状第16-18页
        1.1.1 茄子生产概况第16页
        1.1.2 茄子黄萎病第16-18页
    1.2 病原菌在植物组织中的侵染过程第18-20页
        1.2.1 病原菌在植物根部表面的附着定殖第18-19页
        1.2.2 病原菌的侵入第19页
        1.2.3 病原菌在寄主体内的扩展及症状形成第19-20页
    1.3 绿色荧光蛋白标记病原菌在植物病害研究中的应用第20页
    1.4 植物病害对植物生长和生理特性的影响第20-23页
        1.4.1 植物生长第20-21页
        1.4.2 叶绿素第21页
        1.4.3 可溶性糖、可溶性蛋白第21页
        1.4.4 丙二醛第21-22页
        1.4.5 植物防御酶第22-23页
    1.5 转录组学第23-24页
        1.5.1 转录组学研究技术第23页
        1.5.2 转录组学在病原菌侵染中的应用第23-24页
    1.6 研究的目的及意义第24-25页
第二章 大丽轮枝菌在茄子植株中扩展的时间进程第25-29页
    2.1 材料与方法第25-26页
        2.1.1 供试茄子品种及菌株第25页
        2.1.2 实验材料和试剂第25页
        2.1.3 主要仪器和设备第25页
        2.1.4 供试茄子的培育、菌液制备及接种第25-26页
        2.1.5 取样时间第26页
        2.1.6 石蜡切片的制备第26页
        2.1.7 切片观察第26页
    2.2 结果与分析第26-27页
    2.3 讨论第27-29页
第三章 利用GFP标记大丽轮枝菌第29-42页
    3.1 材料第29页
        3.1.1 植物材料、菌株和质粒第29页
        3.1.2 主要试剂第29页
        3.1.3 主要培养基以及溶液第29页
        3.1.4 主要仪器第29页
    3.2 方法第29-35页
        3.2.1 GFP真菌表达载体的构建第29-32页
        3.2.2 PEG介导的大丽轮枝菌原生质体遗传转化第32-33页
        3.2.3 转化子的筛选及鉴定第33-34页
        3.2.4 侵染过程研究第34-35页
    3.3 结果与分析第35-40页
        3.3.1 重组质粒pSilent-EGFP检测第35页
        3.3.2 转化子荧光镜检结果第35-36页
        3.3.3 转化子GFP的PCR检验第36-37页
        3.3.4 转化子的菌落形态第37页
        3.3.5 转化子的生长速度第37-38页
        3.3.6 转化子的致病力检测第38-39页
        3.3.7 转化子在茄子组织中的扩展第39-40页
    3.4 小结第40-42页
第四章 大丽轮枝菌侵染对茄子植株生长及生理特性的影响第42-55页
    4.1 材料和方法第42-46页
        4.1.1 供试茄子品种及菌株第42页
        4.1.2 试验材料和试剂第42页
        4.1.3 主要仪器和设备第42页
        4.1.4 茄子植株培育及接种菌液制备第42页
        4.1.5 接种方法及取样时间第42页
        4.1.6 茄子干鲜重、株高及茎粗的测定第42-43页
        4.1.7 叶绿素含量的测定第43页
        4.1.8 可溶性糖、可溶性蛋白含量的测定第43-44页
        4.1.9 丙二醛含量的测定第44页
        4.1.10 防御酶SOD、PPO和POD活性的测定第44-46页
        4.1.11 H_2O_2和O_(2-)的组织化学检测第46页
        4.1.12 茄子叶片中胼胝质的积累第46页
        4.1.13 数据分析第46页
    4.2 结果与分析第46-53页
        4.2.1 大丽轮枝菌侵染对茄子生长量的影响第46-47页
        4.2.2 大丽轮枝菌侵染对茄子幼苗叶片叶绿素含量的影响第47-48页
        4.2.3 大丽轮枝菌侵染对茄子幼苗叶片MDA含量的影响第48页
        4.2.4 大丽轮枝菌侵染对茄子幼苗叶片可溶性糖及可溶性蛋白含量的影响第48-50页
        4.2.5 大丽轮枝菌侵染对茄子幼苗叶片防御酶SOD、PPO和POD活性的影响第50-51页
        4.2.6 大丽轮枝菌侵染对茄子叶片过氧化氢、超氧阴离子的影响第51-52页
        4.2.7 大丽轮枝菌侵染对茄子叶片胼胝质积累的影响第52-53页
    4.3 讨论第53-55页
第五章 RNA-seq分析大丽轮枝菌侵染后茄子植株基因表达的差异第55-91页
    5.1 材料与方法第55-59页
        5.1.1 供试的茄子品种及菌株第55页
        5.1.2 试剂和仪器第55页
        5.1.3 茄子样品处理第55页
        5.1.4 茄子叶片总RNA的提取第55-56页
        5.1.5 RNA测序第56-57页
        5.1.6 数据分析第57-59页
    5.2 结果与分析第59-88页
        5.2.1 茄子叶片Total RNA的提取及检测第59页
        5.2.2 转录组测序质量评估第59-60页
        5.2.3 参考基因组比对分析第60-61页
        5.2.4 新转录本的预测结果第61-62页
        5.2.5 参考基因比对及基因表达个数统计第62页
        5.2.6 转录组差异表达基因统计第62-64页
        5.2.7 差异表达基因GO功能分析第64-75页
        5.2.8 差异表达基因KEGG功能分析第75-83页
        5.2.9 SOD、PPO、POD基因表达结果第83-84页
        5.2.10 胼胝质相关基因的表达第84-85页
        5.2.11 病原相关蛋白的表达第85页
        5.2.12 接种大丽轮枝菌后|log2FoldChange(V/C)|>10的差异表达基因第85-88页
    5.3 讨论第88-91页
第六章 总结与展望第91-92页
参考文献第92-99页
附录1: 试验使用的主要仪器和设备第99-100页
附件2: 试验用的培养基及相关溶液配方第100页

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