| 摘要 | 第9-11页 |
| ABSTRACT | 第11-14页 |
| 第1章 绪论 | 第15-21页 |
| 1.1 海洋中磷的形态 | 第15页 |
| 1.1.1 水体中磷的形态 | 第15页 |
| 1.1.2 海洋沉积物中磷的形态 | 第15页 |
| 1.2 解磷微生物的作用机制 | 第15-16页 |
| 1.2.1 无机磷微生物的主要作用机制 | 第16页 |
| 有机酸 | 第16页 |
| 氢质子 | 第16页 |
| 1.2.2 有机磷微生物的主要作用机制 | 第16页 |
| 1.3 长江口及其邻近海域营养化现状研究 | 第16-17页 |
| 1.4 解磷微生物的分子生物学研究 | 第17-18页 |
| 1.4.1 无机磷微生物分子生物学研究现状 | 第17-18页 |
| 1.4.2 有机磷微生物分子生物学研究现状 | 第18页 |
| 碱性磷酸酶 | 第18页 |
| 酸性磷酸酶 | 第18页 |
| 植酸酶 | 第18页 |
| 1.5 碱性磷酸酶编码基因表达的环境因素 | 第18-19页 |
| 1.5.1 pH | 第19页 |
| 1.5.2 DO浓度 | 第19页 |
| 1.5.3 盐度 | 第19页 |
| 1.5.4 其他环境因素 | 第19页 |
| 1.6 本课题的立题依据及主要研究内容 | 第19-21页 |
| 第2章 基于高通量测序的长江口表层沉积物微生物多样性研究 | 第21-31页 |
| 2.1 材料与方法 | 第21-22页 |
| 2.1.1 样品采集 | 第21-22页 |
| 2.1.2 磷浓度测定 | 第22页 |
| 2.1.3 高通量测序数据分析 | 第22页 |
| 2.2 结果与讨论 | 第22-29页 |
| 2.2.1 理化指标分析 | 第22-23页 |
| 2.2.2 测序结果及序列深度验证 | 第23页 |
| 2.2.3 α多样性分析 | 第23-24页 |
| 2.2.4 群落结构 | 第24-27页 |
| 门水平细菌 | 第24-25页 |
| 纲水平细菌 | 第25-26页 |
| 属水平细菌 | 第26-27页 |
| 2.2.5 β多样性分析 | 第27页 |
| 2.2.6 长江口微生物物种与环境因子的冗余分析 | 第27-29页 |
| 2.3 讨论 | 第29-31页 |
| 第3章 基于高通量测序的长江口表层沉积物解磷菌碱性磷酸酶基因多样性研究 | 第31-41页 |
| 3.1 材料与方法 | 第31-32页 |
| 3.1.1 样品采集 | 第31页 |
| 3.1.2 磷浓度测定 | 第31页 |
| 3.1.3 高通量测序数据分析 | 第31-32页 |
| 3.2 结果与讨论 | 第32-36页 |
| 3.2.1 理化指标分析 | 第32-33页 |
| 3.2.2 测序结果及序列深度验证 | 第33页 |
| 3.2.3 α多样性分析 | 第33-34页 |
| 3.2.4 解磷菌碱性磷酸酶基因群落结构 | 第34-36页 |
| 门水平细菌 | 第34-35页 |
| 纲水平细菌 | 第35-36页 |
| 属水平细菌 | 第36页 |
| 3.3 β多样性分析 | 第36-37页 |
| 3.4 phoD基因多样性与环境因子的相关性分析 | 第37-39页 |
| 3.5 讨论 | 第39-41页 |
| 第4章 长江口表层沉积物中可培养有机解磷菌多样性特征 | 第41-53页 |
| 4.1 实验材料 | 第41-44页 |
| 4.1.1 样品的采集和保存 | 第41页 |
| 4.1.2 主要设备仪器 | 第41-42页 |
| 4.1.3 主要试剂 | 第42-43页 |
| 4.1.4 培养基和常用溶液的配制 | 第43-44页 |
| 4.2 方法 | 第44-45页 |
| 4.2.1 样品的处理 | 第44页 |
| 4.2.2 有机解磷菌的筛选 | 第44页 |
| 4.2.3 16S rRNA基因扩增 | 第44-45页 |
| 4.2.4 16S rRNA基因序列分析 | 第45页 |
| 4.2.5 系统发育学分析 | 第45页 |
| 4.2.6 有机解磷菌的解磷能力测定 | 第45页 |
| 4.3 结果 | 第45-51页 |
| 4.3.1 有机解磷菌的筛选 | 第45-46页 |
| 4.3.2 有机解磷菌基因扩增结果 | 第46页 |
| 4.3.3 有机解磷菌的16S基因序列分析 | 第46-48页 |
| 4.3.4 有机解磷菌的系统发育分析 | 第48-49页 |
| 4.3.5 有机磷细菌的种群分布 | 第49-50页 |
| 4.3.6 有机解磷菌解磷能力的测定 | 第50-51页 |
| 4.4 结论 | 第51-53页 |
| 第5章 温度对解磷菌碱性磷酸酶(phoD)基因表达的影响 | 第53-59页 |
| 5.1 材料与方法 | 第53-55页 |
| 5.1.1 菌株来源 | 第53页 |
| 5.1.2 引物设计 | 第53-54页 |
| 5.1.3 培养基和常用溶液的配制 | 第54页 |
| 5.1.4 不同培养温度下培养解磷菌 | 第54页 |
| 5.1.5 样品采集 | 第54页 |
| 5.1.6 总RNA提取与检测 | 第54页 |
| 5.1.7 cDNA第一条链的合成 | 第54-55页 |
| 5.1.8 荧光定量PCR反应体系与条件 | 第55页 |
| 5.1.9 引物特异性检验 | 第55页 |
| 5.1.10 数据处理 | 第55页 |
| 5.2 结果 | 第55-58页 |
| 5.2.1 解磷菌生长曲线的建立 | 第55-56页 |
| 5.2.2 解磷菌菌总RNA质量检测 | 第56页 |
| 5.2.3 荧光定量PCR引物的特异性检验 | 第56-57页 |
| 5.2.4 荧光定量PCR结果 | 第57-58页 |
| 5.3 讨论 | 第58-59页 |
| 结论与展望 | 第59-61页 |
| 参考文献 | 第61-71页 |
| 致谢 | 第71-73页 |
| 在学期间主要科研成果 | 第73页 |
