蛋白质亚细胞定位的序列编码及预测方法研究
| 摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-10页 |
| 插图索引 | 第10-11页 |
| 附表索引 | 第11-12页 |
| 第1章 绪论 | 第12-19页 |
| ·引言 | 第12-13页 |
| ·研究背景及意义 | 第13-14页 |
| ·国内外研究现状 | 第14-17页 |
| ·论文主要内容及结构安排 | 第17-19页 |
| ·主要研究内容 | 第17-18页 |
| ·论文结构安排 | 第18-19页 |
| 第2章 蛋白亚细胞定位预测的生物信息学方法 | 第19-36页 |
| ·蛋白亚细胞定位的生物学基础 | 第19-23页 |
| ·蛋白质简介 | 第19-20页 |
| ·生命中心法则 | 第20-21页 |
| ·细胞的基本构成 | 第21-23页 |
| ·数据集的建立 | 第23-24页 |
| ·蛋白质序列编码方法 | 第24-28页 |
| ·基于氨基酸组成的方法 | 第24页 |
| ·基于残基物理化学特性的编码 | 第24-27页 |
| ·基于功能域的序列编码 | 第27页 |
| ·基于GO注释的序列编码 | 第27-28页 |
| ·预测算法 | 第28-33页 |
| ·支持向量机 | 第28-31页 |
| ·离散增量 | 第31-32页 |
| ·多分类器组合 | 第32-33页 |
| ·预测性能评估 | 第33-35页 |
| ·小结 | 第35-36页 |
| 第3章 基于局部位置分布信息的序列编码方法 | 第36-47页 |
| ·引言 | 第36-37页 |
| ·数据集 | 第37-38页 |
| ·蛋白质序列编码 | 第38-40页 |
| ·特征提取 | 第38-39页 |
| ·距离频率 | 第39-40页 |
| ·实验与分析 | 第40-46页 |
| ·各类氨基酸的距离频率分析 | 第41页 |
| ·分段数目对预测结果的影响 | 第41-43页 |
| ·预测结果的分析与比较 | 第43-46页 |
| ·小结 | 第46-47页 |
| 第4章 基于多分类器组合的蛋白亚细胞定位预测方法 | 第47-57页 |
| ·引言 | 第47-48页 |
| ·材料与方法 | 第48-52页 |
| ·数据集 | 第48-49页 |
| ·蛋白质序列表示 | 第49-50页 |
| ·预测方法 | 第50-52页 |
| ·性能评估 | 第52页 |
| ·结果与讨论 | 第52-56页 |
| ·权重因子(weight factor)的选择 | 第52-53页 |
| ·序列编码方法的分析比较 | 第53-54页 |
| ·预测方法的分析比较 | 第54-56页 |
| ·小结 | 第56-57页 |
| 结论 | 第57-59页 |
| 参考文献 | 第59-64页 |
| 致谢 | 第64-65页 |
| 附录A 攻读学位期间所发表的学术论文及所参加项目 | 第65页 |
