图形表示在DNA基因序列识别算法中的应用
| 摘要 | 第1-6页 |
| ABSTRACT | 第6-7页 |
| 目录 | 第7-9页 |
| 插图索引 | 第9-10页 |
| 附表索引 | 第10-11页 |
| 第1章 绪论 | 第11-17页 |
| ·研究目的 | 第11页 |
| ·本文的项目来源 | 第11页 |
| ·研究背景和意义 | 第11-13页 |
| ·国内外研究现状 | 第13-15页 |
| ·论文主要工作及结构安排 | 第15-17页 |
| 第2章 基因序列图形表示及其在基因识别中的应用 | 第17-30页 |
| ·真核生物基因结构 | 第17-18页 |
| ·DNA和基因 | 第17页 |
| ·真核生物基因结构和剪接 | 第17-18页 |
| ·基因序列图形表示 | 第18-21页 |
| ·G曲线和H曲线 | 第19页 |
| ·CGR图 | 第19页 |
| ·三种相似的二维曲线 | 第19-20页 |
| ·Z曲线 | 第20页 |
| ·其他曲线 | 第20-21页 |
| ·基于序列图形表示的基因识别方法 | 第21-28页 |
| ·基于图形表达的编码/非编码区识别 | 第22-24页 |
| ·基于图形表达的剪接位点识别 | 第24-26页 |
| ·基因识别中的判别方法 | 第26-28页 |
| ·小结 | 第28-30页 |
| 第3章 基于序列图形表达的人类短编码序列识别方法 | 第30-44页 |
| ·概述 | 第30页 |
| ·基于序列图形表示的特征提取方法 | 第30-32页 |
| ·DNA序列图形表示 | 第30-31页 |
| ·基于图形的特征提取 | 第31-32页 |
| ·数据集的选取 | 第32-36页 |
| ·正样本和负样本生成算法 | 第32-34页 |
| ·改进的自相似映射负样本生成算法 | 第34-36页 |
| ·基于支持向量机的基因识别 | 第36-38页 |
| ·支持向量机 | 第36-37页 |
| ·训练支持向量机模型 | 第37页 |
| ·识别结果检验标准 | 第37-38页 |
| ·结果与讨论 | 第38-43页 |
| ·实验结果 | 第38-41页 |
| ·与已有算法对比 | 第41-43页 |
| ·小结 | 第43-44页 |
| 第4章 基于图形表示的人类基因剪接受体位点识别 | 第44-54页 |
| ·概述 | 第44页 |
| ·数据集 | 第44-46页 |
| ·数据来源 | 第44-45页 |
| ·训练集和测试集的组成 | 第45-46页 |
| ·基于图形的剪接受体位点识别 | 第46-49页 |
| ·基于图形的初步特征提取 | 第46-47页 |
| ·特征选取及序列截取长度对识别准确率的影响 | 第47-48页 |
| ·基于图形的剪接受体位点特征提取 | 第48-49页 |
| ·结果与讨论 | 第49-52页 |
| ·识别结果检验标准Q~9 | 第49-50页 |
| ·实验结果 | 第50-51页 |
| ·与已有算法对比 | 第51-52页 |
| ·小结 | 第52-54页 |
| 结论 | 第54-56页 |
| 1.本文工作总结 | 第54页 |
| 2.进一步工作展望 | 第54-56页 |
| 参考文献 | 第56-62页 |
| 致谢 | 第62-63页 |
| 附录A (攻读硕士学位期间所发表的学术论文目录) | 第63页 |
