| 摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-10页 |
| 插图索引 | 第10-11页 |
| 附表索引 | 第11-12页 |
| 第1章 绪论 | 第12-17页 |
| ·项目来源 | 第12页 |
| ·研究背景和意义 | 第12-13页 |
| ·国内外研究现状与发展趋势 | 第13-15页 |
| ·生物信息处理 | 第13-14页 |
| ·生物序列的相似性分析研究概况 | 第14-15页 |
| ·本文的工作 | 第15-16页 |
| ·本文结构 | 第16-17页 |
| 第2章 生物序列相似性分析方法及进化树构建方法 | 第17-26页 |
| ·引言 | 第17页 |
| ·序列间相似性分析方法 | 第17-21页 |
| ·基于字符串的序列比对方法 | 第17-18页 |
| ·基于Lempel-Ziv算法的相似性分析方法 | 第18-19页 |
| ·基于不变量的图形化分析方法 | 第19-21页 |
| ·图形的特征不变量分析 | 第21-24页 |
| ·图形的特征矩阵 | 第21-22页 |
| ·常用的不变量 | 第22-24页 |
| ·构建系统进化树的常用方法 | 第24-25页 |
| ·小结 | 第25-26页 |
| 第3章 一种新的RNA二级结构可视化表示及其应用 | 第26-49页 |
| ·引言 | 第26-27页 |
| ·一种新的RNA二级结构的可视化表示——CZ曲线 | 第27-28页 |
| ·CZ曲线具有的性质 | 第28-31页 |
| ·12种RNA二级结构的相似性分析 | 第31-41页 |
| ·原始数据 | 第31-33页 |
| ·12种RNA二级结构的坐标映射图 | 第33-37页 |
| ·相似性分析算法 | 第37-38页 |
| ·实验结果分析 | 第38-41页 |
| ·基于可视化表示构建11种真实RNA二级结构的进化树 | 第41-47页 |
| ·基于层次聚类的进化树构建算法 | 第41-42页 |
| ·原始数据 | 第42页 |
| ·11个RNA二级结构的坐标映射图 | 第42-45页 |
| ·进化树构建与实验结果分析 | 第45-47页 |
| ·小结 | 第47-49页 |
| 第4章 基于LZ复杂度的RNA二级结构相似性分析 | 第49-54页 |
| ·引言 | 第49页 |
| ·一种新的RNA二级结构线性化表示 | 第49-51页 |
| ·相似性分析算法 | 第51-52页 |
| ·实验结果分析 | 第52-53页 |
| ·小结 | 第53-54页 |
| 结论 | 第54-56页 |
| 参考文献 | 第56-60页 |
| 致谢 | 第60-61页 |
| 附录A 攻读学位期间所发表的学术论文目录 | 第61页 |