致谢 | 第4-7页 |
摘要 | 第7-8页 |
1 文献综述 | 第8-14页 |
1.1 景观基因组学概论 | 第8-10页 |
1.1.1 景观基因组学的出现 | 第8页 |
1.1.2 景观基因组学概念 | 第8-10页 |
1.2 景观基因组学研究方法 | 第10-12页 |
1.2.1 景观基因组学中的采样策略 | 第10页 |
1.2.2 景观基因组学的分子标记 | 第10-12页 |
1.2.2.1 AFLP标记 | 第11页 |
1.2.2.2 SSR标记 | 第11页 |
1.2.2.3 SCoT分子标记 | 第11页 |
1.2.2.4 SNPs标记 | 第11-12页 |
1.2.3 研究范畴 | 第12页 |
1.2.3.1 空间环境变量对基因组差异的定量影响 | 第12页 |
1.2.3.2 揭示形成适应性遗传变异的环境因素 | 第12页 |
1.3 黄栌的研究概况 | 第12-14页 |
1.3.1 物种介绍 | 第12-13页 |
1.3.2 生态习性和分布 | 第13页 |
1.3.3 黄栌变种 | 第13页 |
1.3.4 黄栌研究进展 | 第13-14页 |
1.3.4.1 黄栌的药用价值研究 | 第13-14页 |
1.3.4.2 黄栌的繁殖技术研究 | 第14页 |
1.3.4.3 黄栌的病虫害研究 | 第14页 |
1.4 黄栌的分子生物学研究进展 | 第14页 |
2 引言 | 第14-15页 |
3 黄栌的景观基因组学研究 | 第15-21页 |
3.1 实验方法 | 第15-20页 |
3.1.1 采样方法 | 第15-17页 |
3.1.2 提取基因组DNA | 第17-18页 |
3.1.3 进行PCR扩增 | 第18页 |
3.1.4 琼脂糖凝胶电泳 | 第18-19页 |
3.1.5 数据分析 | 第19-20页 |
3.2 研究目的与意义 | 第20-21页 |
4 结果 | 第21-28页 |
4.1 遗传结构分析 | 第21-23页 |
4.2 RDA分析 | 第23-26页 |
4.3 异常值检测 | 第26页 |
4.4 环境相关分析 | 第26-28页 |
5 讨论与结论 | 第28-31页 |
5.1 讨论 | 第29-31页 |
5.1.1 空间种群遗传结构 | 第29-30页 |
5.1.2 环境因素驱动的适应性位点 | 第30-31页 |
5.2 结论 | 第31页 |
6 景观基因组学的前景和挑战 | 第31-33页 |
参考文献 | 第33-42页 |
附表 | 第42-80页 |
表S1 1131个基因的等位基因频率 | 第42-67页 |
表S2 从WorldClim数据库下载每个地区的环境变量 | 第67-68页 |
表S3 由FDIST2和BayeScan识别的离群位点 | 第68-72页 |
表S4 Pearson相关分析检测到离群位点与环境变量显著相关 | 第72-76页 |
表S5 用|z|值显示离群位点与环境变量相关性 | 第76-80页 |
Abstract | 第80-81页 |