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ZAR1和GDF9基因的克隆及其在新西兰白兔的差异表达研究

致谢第4-9页
摘要第9-11页
1 文献综述第11-23页
    1.1 ZAR1基因的研究进展及应用第11-14页
        1.1.1 ZAR1基因定位与结构第11-12页
        1.1.2 ZAR1基因的组织表达分布第12页
        1.1.3 ZAR1基因的功能研究第12-14页
            1.1.3.1 ZAR1基因对早期胚胎发育的作用第12-13页
            1.1.3.2 ZAR1基因对繁殖性状的影响第13页
            1.1.3.3 ZAR1基因甲基化与肿瘤的相互影响第13-14页
            1.1.3.4 ZAR1基因对基因转录的作用第14页
        1.1.4 展望第14页
    1.2 GDF9基因与ZAR1基因在繁殖方面的联系第14-15页
    1.3 GDF9基因的研究进展及应用第15-19页
        1.3.1 GDF9基因定位与结构第16页
        1.3.2 GDF9基因的组织表达分布第16-17页
        1.3.3 GDF9基因的功能研究第17-19页
            1.3.3.1 GDF9基因对卵泡发育的影响第17页
            1.3.3.2 GDF9基因对繁殖性状的影响第17-18页
            1.3.3.3 GDF9与BMP15的相互作用第18-19页
        1.3.4 小结第19页
    1.4 实时荧光定量PCR技术第19-23页
        1.4.1 实时荧光定量PCR原理第19-20页
        1.4.2 荧光标记方法的分类第20-21页
            1.4.2.1 非特异性的DNA结合染料法第20页
            1.4.2.2 特异性荧光定量PCR第20-21页
        1.4.3 实时荧光定量PCR技术的的定量方法第21页
        1.4.4 实时荧光定量PCR技术的应用第21-23页
            1.4.4.1 目标基因的检测或诊断第22页
            1.4.4.2 细胞因子的表达分析第22页
            1.4.4.3 基因突变分析及多态性研究第22页
            1.4.4.4 转基因动物的检测第22-23页
2 引言第23-24页
3 ZAR1基因的克隆、生物信息分析和在新西兰白兔的组织表达分析第24-47页
    3.1 实验材料第24-25页
        3.1.1 菌体和克隆载体第24页
        3.1.2 试验动物组织样第24页
        3.1.3 主要仪器和设备第24页
        3.1.4 主要试剂和溶液第24-25页
            3.1.4.1 药品、酶及试剂盒第24-25页
            3.1.4.2 缓冲液及主要试剂的配制第25页
    3.2 ZAR1序列的克隆和序列分析第25-31页
        3.2.1 PCR引物设计和合成第25-26页
        3.2.2 动物组织DNA的提取第26页
        3.2.3 动物组织总RNA的提取第26-27页
        3.2.4 反转录反应第27页
        3.2.5 反转录效果检测第27-28页
        3.2.6 普通PCR法扩增ZAR1基因序列第28页
        3.2.7 琼脂糖凝胶电泳第28-29页
        3.2.8 DNA的克隆及重组质粒的筛选和鉴定第29-31页
            3.2.8.1 PCR产物的纯化和检测第29页
            3.2.8.2 PCR目的片段的连接第29-30页
            3.2.8.3 感受态细胞的制备(采用Ca Cl2法制备感受态细胞)第30页
            3.2.8.4 连接产物的转化第30页
            3.2.8.5 蓝白斑筛选原理(α-互补法)第30-31页
            3.2.8.6 高纯度质粒小量制备第31页
            3.2.8.7 重组质粒的PCR鉴定第31页
            3.2.8.8 重组质粒的序列测定第31页
    3.3 ZAR1 m RNA组织表达谱第31-32页
        3.3.1 总RNA的提取和反转录反应(方法同 3.2.3 和 3.2.4)第31-32页
        3.3.2 RT-PCR第32页
        3.3.3 琼脂糖凝胶电泳第32页
    3.4 ZAR1 m RNA在新西兰白兔组织的实时荧光定量表达分析第32-33页
        3.4.1 RNA提取和c DNA合成(方法同 3.2.3 和 3.2.4)第32页
        3.4.2 PCR引物设计与扩增条件优化第32页
        3.4.3 实时荧光定量PCR的表达分析第32-33页
    3.5 结果第33-44页
        3.5.1 总RNA的提取结果第33页
        3.5.2 反转录反应中GAPDH内参引物的扩增第33-34页
        3.5.3 PCR法扩增ZAR1序列的结果第34-35页
        3.5.4 ZAR1序列阳性克隆的筛选和鉴定第35-36页
        3.5.5 ZAR1基因PCR产物的测序结果第36-37页
        3.5.6 新西兰白兔 ZAR1 基因 CDS 序列的生物信息学分析第37-40页
            3.5.6.1 新西兰白兔ZAR1蛋白进化树的构建第37页
            3.5.6.2 新西兰白兔ZAR1基因甲基化预测第37-38页
            3.5.6.3 新西兰白兔ZAR1蛋白的氨基酸理化性质分析第38页
            3.5.6.4 新西兰白兔ZAR1蛋白的疏水区分析第38-39页
            3.5.6.5 新西兰白兔ZAR1蛋白的二级结构分析第39-40页
            3.5.6.6 新西兰白兔ZAR1蛋白磷酸化位点预测第40页
        3.5.7 ZAR1 m RNA组织表达谱第40页
        3.5.8 ZAR1 m RNA在新西兰白兔组织的实时荧光定量表达分析第40-44页
            3.5.8.1 荧光定量PCR扩增曲线和溶解曲线第40-41页
            3.5.8.2 相同繁殖性状不同组织中ZAR1基因m RNA水平的差异比较第41-43页
            3.5.8.3 不同繁殖性状在同一组织中ZAR1基因m RNA水平的差异比较第43-44页
    3.6 讨论第44-45页
    3.7 小结第45-47页
4 GDF9基因克隆、生物信息分析和在新西兰白兔的组织表达分析第47-68页
    4.1 实验材料(同 3.1)第47页
    4.2 GDF9序列的克隆和序列分析第47-48页
        4.2.1 PCR引物设计和合成第47页
        4.2.2 动物组织DNA的提取(同 3.2.2)第47页
        4.2.3 动物组织总RNA的提取(同 3.2.3)第47页
        4.2.4 反转录反应(同 3.2.4)第47页
        4.2.5 反转录效果检测(同 3.2.5)第47页
        4.2.6 普通PCR法扩增GDF9基因序列第47-48页
        4.2.7 琼脂糖凝胶电泳(同 3.2.7)第48页
        4.2.8 DNA的克隆及重组质粒的筛选和鉴定(同 3.2.8)第48页
    4.3 GDF9 m RNA组织表达谱(方法同 3.3)第48页
    4.4 GDF9 m RNA在新西兰白兔组织的实时荧光定量表达分析第48-49页
        4.4.1 RNA提取和c DNA合成(方法同 3.2.3 和 3.2.4)第48页
        4.4.2 PCR引物设计与扩增条件优化第48页
        4.4.3 实时荧光定量PCR的表达分析第48-49页
    4.5 结果第49-64页
        4.5.1 总RNA的提取结果(同 3.5.1)第49页
        4.5.2 反转录反应中GAPDH内参引物的扩增(同 3.5.2)第49页
        4.5.3 PCR法扩增GDF9序列的结果第49-50页
        4.5.4 GDF9序列阳性克隆的筛选和鉴定第50-51页
        4.5.5 GDF9基因PCR产物的测序结果第51-53页
        4.5.6 新西兰白兔GDF9基因CDS序列的生物信息学分析第53-56页
            4.5.6.1 新西兰白兔GDF9蛋白进化树的构建第53页
            4.5.6.2 新西兰白兔GDF9基因启动子区的预测第53页
            4.5.6.3 新西兰白兔GDF9基因启动子区甲基化预测第53-54页
            4.5.6.4 新西兰白兔GDF9蛋白的的氨基酸理化性质分析第54页
            4.5.6.5 新西兰白兔GDF9蛋白的疏水区分析第54-55页
            4.5.6.6 新西兰白兔GDF9蛋白的二级结构分析第55-56页
            4.5.6.7 新西兰白兔GDF9蛋白磷酸化位点预测第56页
        4.5.7 GDF9 m RNA 组织表达谱第56-57页
        4.5.8 GDF9 m RNA在新西兰白兔组织的实时荧光定量表达分析第57-60页
            4.5.8.1 荧光定量PCR扩增曲线和溶解曲线第57页
            4.5.8.2 相同繁殖性状不同组织中GDF9基因m RNA水平的差异比较第57-59页
            4.5.8.3 不同繁殖性状在同一组织中GDF9基因m RNA水平的差异比较第59-60页
        4.5.9 GDF9基因和ZAR1基因在新西兰白兔不同组织中的表达研究比较第60-64页
            4.5.9.1 GDF9和ZAR1基因在低产新西兰白兔不同组织中的差异比较第60-62页
            4.5.9.2 GDF9和ZAR1基因在高产新西兰白兔不同组织中的差异比较第62-64页
    4.6 讨论第64-66页
    4.7 小结第66-68页
5. 结论第68-69页
6.创新点及下一步工作进展第69-70页
参考文献第70-76页
ABSTRACT第76-78页

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