| 摘要 | 第3-4页 |
| abstract | 第4-5页 |
| 缩略语表 | 第10-11页 |
| 1 引言 | 第11-15页 |
| 1.1 马属动物简介 | 第11页 |
| 1.2 蒙古马运动性能 | 第11-12页 |
| 1.3 纯血马运动性能 | 第12页 |
| 1.4 马运动基因研究进展 | 第12-14页 |
| 1.5 转录组测序及Miseq测序技术 | 第14-15页 |
| 1.5.1 转录组 | 第14页 |
| 1.5.2 转录组测序技术 | 第14页 |
| 1.5.3 Miseq测序平台 | 第14页 |
| 1.5.4 转录组测序在马运动学领域的应用 | 第14-15页 |
| 2 试验主要内容、目的及意义 | 第15-17页 |
| 2.1 试验目的和意义 | 第15页 |
| 2.2 试验主要内容与技术路线 | 第15-17页 |
| 3 蒙古马短期高负荷运动前后转录组文库构建及测序分析 | 第17-45页 |
| 3.1 试验材料 | 第17-18页 |
| 3.1.1 试验样本 | 第17页 |
| 3.1.2 实验试剂耗材 | 第17页 |
| 3.1.3 实验仪器设备 | 第17-18页 |
| 3.1.4 试验主要数据库和分析软件 | 第18页 |
| 3.2 试验方法 | 第18-22页 |
| 3.2.1 肌肉总RNA的提取 | 第18-19页 |
| 3.2.2 检测总RNA的完整性 | 第19页 |
| 3.2.3 骨骼肌总RNA反转录合成cDNA | 第19-20页 |
| 3.2.4 实时荧光定量PCR反应体系 | 第20页 |
| 3.2.5 转录组高通量测序文库制备 | 第20-21页 |
| 3.2.6 测序数据质量控制及序列比对 | 第21页 |
| 3.2.7 基因差异表达分析 | 第21-22页 |
| 3.2.8 差异基因的功能分析 | 第22页 |
| 3.2.9 SNP统计与可变剪切分析 | 第22页 |
| 3.3 结果与分析 | 第22-45页 |
| 3.3.1 RNA质量检测与原始数据整理、过滤及质量评估 | 第22-25页 |
| 3.3.2 与参考基因组比对 | 第25-26页 |
| 3.3.3 SNP与可变剪切分析 | 第26-30页 |
| 3.3.4 差异表达序列的筛选 | 第30-33页 |
| 3.3.5 相关性分析 | 第33页 |
| 3.3.6 编码蛋白的差异表达分析 | 第33-34页 |
| 3.3.7 蒙古马短期高负荷运动前后差异表达基因的实时定量检测 | 第34-37页 |
| 3.3.8 差异基因的GeneOntology功能富集分析 | 第37-39页 |
| 3.3.9 差异基因KEGGPathway及KO富集分析 | 第39-45页 |
| 4 讨论 | 第45-47页 |
| 5 结论 | 第47-48页 |
| 致谢 | 第48-49页 |
| 参考文献 | 第49-53页 |
| 作者简介 | 第53页 |
