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水稻GRAS转录因子家族的系统分析与功能研究

中文摘要第3-5页
英文摘要第5-6页
第一章、文献综述第10-20页
    1.1 GRAS转录因子基本结构第10-12页
    1.2 GRAS家族基因的功能第12-18页
        1.2.1 GRAS基因在赤霉素通路中的作用第12-13页
        1.2.2 GRAS基因在光信号转导通路中的角色第13-14页
        1.2.3 GRAS基因家族与植物根的发育第14-16页
        1.2.4 GRAS基因参与分生组织的发育第16-17页
        1.2.5 其他第17-18页
    1.3 本研究的背景、目的和意义第18-20页
第二章、GRAS基因家族的进化分析第20-34页
    2.1 引言第20页
    2.2 实验材料与方法第20-23页
        2.2.1 GRAS基因家族的构成分析第20-21页
            2.2.1.1 水稻中的GRAS基因家族第20-21页
            2.2.1.2 拟南芥中的GRAS基因家族第21页
            2.2.1.3 构建系统进化树第21页
        2.2.2 GRAS家族的多态性分析第21-23页
            2.2.2.1 水稻与拟南芥的生态型第21页
            2.2.2.2 从样品序列获取不同生态型的GRAS家族基因第21-22页
            2.2.2.3 分离结构域第22页
            2.2.2.4 群体遗传学指标计算第22-23页
    2.3 实验结果与分析第23-32页
        2.3.1 GRAS基因的分布第23-24页
        2.3.2 GRAS结构域的保守第24-25页
        2.3.3 水稻和拟南芥中GRAS的分化第25-28页
        2.3.4 水稻中GRAS基因家族的多态性第28-32页
            2.3.4.1 栽培稻与野生稻第29-30页
            2.3.4.2 粳稻与籼稻第30-32页
    2.4 讨论第32页
    2.5 小结第32-34页
第三章、GRAS基因突变体的构建与分析第34-54页
    3.1 引言第34-35页
    3.2 实验材料与方法第35-44页
        3.2.1 GRAS基因突变体的构建第35-41页
            3.2.1.1 spacer设计第35页
            3.2.1.2 质粒合成第35-37页
                3.2.1.2.1 spacer合成第35-36页
                3.2.1.2.2 退火反应第36页
                3.2.1.2.3 退火产物的磷酸化第36页
                3.2.1.2.4 sgRNA质粒的酶切第36页
                3.2.1.2.5 连接反应第36-37页
                3.2.1.2.6 电转连接产物第37页
            3.2.1.3 农杆菌制备第37-38页
                3.2.1.3.1 感受态的制备第37-38页
                3.2.1.3.2 转化第38页
            3.2.1.4 农杆菌介导的水稻遗传转化第38-41页
                3.2.1.4.1 试剂准备第38-40页
                3.2.1.4.2 胚性愈伤的诱导第40页
                3.2.1.4.3 愈伤组织的继代第40页
                3.2.1.4.4 愈伤组织的预培养第40页
                3.2.1.4.5 农杆菌的侵染第40-41页
                3.2.1.4.6 抗性愈伤组织的筛选第41页
                3.2.1.4.7 分化第41页
                3.2.1.4.8 生根与炼苗移栽第41页
        3.2.2 GRAS敲除突变体的基因型鉴定第41-43页
            3.2.2.1 TPS法快速提取植物组织DNA第41-42页
            3.2.2.2 PCR反应第42-43页
        3.2.3 SCr-like23突变体的半定量RT-PCR第43-44页
        3.2.4 OsSCR-Like23基因的基因芯片数据分析第44页
    3.3 结果与分析第44-51页
        3.3.1 GRAS突变体植株的获得第44-47页
            3.3.1.1 制取侵染用农杆菌第44页
            3.3.1.2 获得愈伤组织第44-45页
            3.3.1.3 转基因苗的培育第45页
            3.3.1.4 敲除结果鉴定第45-46页
            3.3.1.5 表型鉴定第46-47页
        3.3.2 OsSCR-Like23敲除突变体的初步分析第47-51页
            3.3.2.1 SCR亚家族的构成第47-49页
            3.3.2.2 OsSCR-Like23基因在不同组织器官的表达模式第49-50页
            3.3.2.3 scr-like23的基因鉴定第50页
            3.3.2.4 可变剪切的表达情况第50-51页
    3.4 讨论第51-53页
    3.5 小结第53-54页
总结第54-55页
参考文献第55-60页
致谢第60-61页
附录第61-66页

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