| 致谢 | 第5-7页 |
| 摘要 | 第7-9页 |
| Abstract | 第9-11页 |
| 1 文献综述 | 第15-38页 |
| 1.1 画眉研究概况 | 第15-23页 |
| 1.1.1 画眉的生物学特征 | 第15-17页 |
| 1.1.2 噪鹛属分类学和起源的争论 | 第17-18页 |
| 1.1.3 亚种分化 | 第18-20页 |
| 1.1.4 基因渗透 | 第20-21页 |
| 1.1.5 声音研究 | 第21-23页 |
| 1.2 高通量测序背景下鸟类BAC文库的重要性 | 第23-30页 |
| 1.2.1 测序技术的发展 | 第23-25页 |
| 1.2.2 鸟类基因组的重要性、测序及不足 | 第25-27页 |
| 1.2.3 高效的反-4D文库 | 第27-30页 |
| 1.3 防御素基因研究概况 | 第30-38页 |
| 1.3.1 防御素基因分类、结构、功能 | 第30-32页 |
| 1.3.2 防御素的进化与组织表达 | 第32-34页 |
| 1.3.3 鸟类防御素的研究 | 第34-38页 |
| 2 本论文的立项依据、目的和研究内容 | 第38-40页 |
| 3 画眉Reverse-4D文库的构建 | 第40-56页 |
| 3.1 材料 | 第40-41页 |
| 3.1.1 样品来源 | 第40页 |
| 3.1.2 BAC载体和电转感受态细胞 | 第40-41页 |
| 3.1.3 主要仪器设备、试剂和耗材 | 第41页 |
| 3.2 方法和步骤 | 第41-49页 |
| 3.2.1 高分子量DNA的制备 | 第41-47页 |
| 3.2.2 DNA连接和转化 | 第47-48页 |
| 3.2.3 Reverse-4D BAC文库的超级库和亚库构建过程 | 第48-49页 |
| 3.3 BAC库的结果与讨论 | 第49-56页 |
| 3.3.1 结果 | 第49-50页 |
| 3.3.2 讨论 | 第50-56页 |
| 4 画眉防御素物理图谱的构建 | 第56-81页 |
| 4.1 材料 | 第56-57页 |
| 4.1.1 材料来源 | 第56页 |
| 4.1.2 引物设计 | 第56-57页 |
| 4.1.3 主要仪器设备、试剂和耗材 | 第57页 |
| 4.2 方法和步骤 | 第57-62页 |
| 4.2.1 基因组DNA的提取 | 第57-58页 |
| 4.2.2 引物的验证 | 第58-59页 |
| 4.2.3 筛库和最小叠连群的构建 | 第59-60页 |
| 4.2.4 画眉防御素基因注释 | 第60-61页 |
| 4.2.5 画眉防御素基因的进化分析 | 第61-62页 |
| 4.2.6 鸟类防御素基因分化时间估计 | 第62页 |
| 4.3 结果与讨论 | 第62-81页 |
| 4.3.1 叠连群的构建 | 第62-65页 |
| 4.3.2 防御素基因系统发生分析和进化分析 | 第65-68页 |
| 4.3.3 物种间防御素基因结构比较 | 第68-72页 |
| 4.3.4 复制驱动力和复制时间估计 | 第72-75页 |
| 4.3.5 重复元件与复制机制 | 第75-81页 |
| 5 画眉防御素基因的染色体定位 | 第81-89页 |
| 5.1 材料 | 第81-82页 |
| 5.1.1 材料来源 | 第81页 |
| 5.1.2 主要仪器设备 | 第81页 |
| 5.1.3 主要试剂及耗材 | 第81-82页 |
| 5.2 方法和步骤 | 第82-85页 |
| 5.2.1 探针质粒的提取 | 第82-83页 |
| 5.2.2 中期染色体的准备 | 第83-84页 |
| 5.2.3 标记探针 | 第84页 |
| 5.2.4 FISH杂交过程 | 第84-85页 |
| 5.2.5 FISH结果统计 | 第85页 |
| 5.3 结果和讨论 | 第85-89页 |
| 5.3.1 结果 | 第85-87页 |
| 5.3.2 讨论 | 第87-89页 |
| 6 画眉防御素基因的表达分析 | 第89-96页 |
| 6.1 材料 | 第89-90页 |
| 6.1.1 样品来源 | 第89页 |
| 6.1.2 引物及其设计 | 第89-90页 |
| 6.1.3 主要仪器设备、试剂及耗材 | 第90页 |
| 6.2 方法和步骤 | 第90-93页 |
| 6.2.1 总RNA提取 | 第90-91页 |
| 6.2.2 cDNA的合成 | 第91页 |
| 6.2.3 PCR检测其表达情况 | 第91-93页 |
| 6.3 结果与讨论 | 第93-96页 |
| 7 主要结论、创新点及展望 | 第96-98页 |
| 7.1 主要结论 | 第96-97页 |
| 7.2 创新点 | 第97页 |
| 7.3 展望 | 第97-98页 |
| 8 附图 | 第98-100页 |
| 9 参考文献 | 第100-111页 |
| 10 攻读博士学位期间的科研成果 | 第111页 |