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基于水仙BAC末端序列的SSR标记开发与应用

英文缩略词第8-10页
中文摘要第10-12页
ABSTRACT第12-13页
第一章 研究背景综述第14-22页
    1 水仙概述第14-15页
    2 SSR分子标记技术第15-18页
        2.1 SSR分子标记的定义和原理第15页
        2.2 SSR标记的优缺点第15-16页
        2.3 SSR分子标记在植物研究中的应用第16-18页
            2.3.1 植物种质资源的鉴定分析第16-17页
            2.3.2 植物亲缘关系及遗传多样性分析第17页
            2.3.3 构建植物遗传连锁图谱第17-18页
            2.3.4 SSR标记辅助育种第18页
    3 分子标记在水仙上的应用第18-19页
    4 开发SSR标记的途径第19-21页
    5 本研究的目的及意义第21页
    6 技术路线第21-22页
第二章 水仙BES-SSR标记的开发及位点分析第22-42页
    1 材料与方法第22-28页
        1.1 材料第22-23页
            1.1.1 植物材料及BESs第22-23页
            1.1.2 仪器设备第23页
        1.2 方法第23-28页
            1.2.1 水仙BES-SSR位点信息检索第23-24页
            1.2.2 水仙BES-SSR标记引物设计第24页
            1.2.3 水仙总DNA提取及检测第24-25页
            1.2.4 水仙BES-SSR-PCR体系的建立及优化第25-27页
                1.2.4.1 PCR反应体系的初步建立第25-26页
                1.2.4.2 PCR反应体系单因素梯度实验设计第26页
                1.2.4.3 PCR反应体系正交实验设计第26-27页
            1.2.5 水仙BES-SSR标记引物筛选第27-28页
    2 结果与分析第28-38页
        2.1 水仙BES-SSR出现频率及特点第28-29页
        2.2 水仙BES-SSR-PCR体系的建立及优化第29-31页
            2.2.1 DNA浓度单因素实验梯度分析第29-30页
            2.2.2 Taq酶量单因素实验梯度分析第30页
            2.2.3 dNTPs浓度单因素实验梯度分析第30-31页
            2.2.4 引物浓度单因素实验梯度分析第31页
        2.3 SSR-PCR反应体系正交实验结果分析第31-34页
            2.3.1 DNA模板对SSR-PCR体系的影响第32-33页
            2.3.2 dNTPs对SSR-PCR体系的影响第33页
            2.3.3 引物对SSR-PCR体系的影响第33-34页
            2.3.4 Taq酶对SSR-PCR体系的影响第34页
        2.4 最优PCR反应体系的验证分析第34-38页
        2.5 水仙BES-SSR标记引物的筛选分析第38页
    3 讨论第38-40页
        3.1 水仙BES-SSR分布特征第38页
        3.2 水仙BES-SSR反应体系的建立与优化第38-39页
        3.3 水仙BES-SSR标记引物的多态性分析第39-40页
    4 结论第40-42页
第三章 水仙BES-SSR标记重复性检测及验证分析第42-52页
    1 材料与方法第42-44页
        1.1 植物材料第42页
        1.2 仪器与试剂第42-43页
        1.3 实验方法第43-44页
            1.3.1 样品总DNA提取及检测第43页
            1.3.2 水仙BES-SSR-PCR扩增及产物检测第43页
            1.3.3 SSR-PCR扩增产物片段的回收与纯化第43页
            1.3.4 SSR-PCR产物目的基因与载体的连接第43页
            1.3.5 SSR-PCR连接产物的转化与测序第43-44页
            1.3.6 核心位点序列比对分析第44页
    2 结果与分析第44-49页
        2.1 水仙SSR标记引物重复性验证分析第44-45页
        2.2 水仙SSR标记核心位点比对分析第45-49页
            2.2.1 引物扩增结果分析第46页
            2.2.2 扩增产物DNA片段菌液验证第46-47页
            2.2.3 核心位点比对分析第47-49页
    3 讨论第49-52页
第四章 水仙BES-SSR在种质鉴定及遗传多样性分析上的应用第52-66页
    1 材料与方法第52-55页
        1.1 材料及引物第52-54页
        1.2 方法第54-55页
            1.2.1 水仙总DNA提取及检测第54页
            1.2.2 SSR-PCR扩增及程序第54页
            1.2.3 扩增产物检测分析第54页
            1.2.4 数据统计与分析第54-55页
    2 结果与分析第55-63页
        2.1 水仙材料总DNA检测分析第55页
        2.2 SSR标记扩增结果分析第55-56页
        2.3 SSR标记引物多态性分析第56-57页
        2.4 水仙BES-SSR聚类分析第57-62页
        2.5 水仙遗传多样性分析第62-63页
    3 讨论第63-64页
    4 结论第64-66页
第五章 水仙BES-SSR标记在近缘属君子兰植物上的通用性分析第66-76页
    1 材料与方法第66-68页
        1.1 材料及处理第66-67页
        1.2 方法第67-68页
            1.2.1 君子兰总DNA提取及检测第67页
            1.2.2 SSR-PCR扩增体系及程序第67-68页
            1.2.3 SSR-PCR扩增产物检测第68页
            1.2.4 数据统计与分析第68页
    2 结果与分析第68-73页
        2.1 君子兰样品总DNA检测分析第68页
        2.2 SSR引物筛选扩增及通用性分析第68-71页
        2.3 水仙BES-SSR标记引物对君子兰的多态性分析第71页
        2.4 21份供试君子兰样品间的遗传相似性分析及聚类分析第71-73页
    3 讨论第73-75页
        3.1 水仙BES-SSR标记引物对君子兰的通用性分析第73-74页
        3.2 水仙BES-SSR标记引物对君子兰的多态性分析第74页
        3.3 21份君子兰样品间的遗传多样性分析第74-75页
    4 结论第75-76页
第六章 总结及展望第76-78页
参考文献第78-86页
附录Ⅰ 水仙BES-SSR核心位点及其侧翼序列信息第86-94页
附录Ⅱ 各引物对36份水仙材料的扩增结果第94-102页
附录Ⅲ 各引物对21份君子兰品种的扩增结果第102-110页
在读期间学术研究第110-112页
致谢第112页

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