核糖体管道作用蛋白质折叠机制的模拟研究
| 摘要 | 第4-5页 |
| Abstract | 第5页 |
| 1 绪论 | 第8-15页 |
| 1.1 前言 | 第8-9页 |
| 1.2 蛋白质结构 | 第9-10页 |
| 1.3 蛋白质结构的测定 | 第10-11页 |
| 1.4 蛋白质折叠问题 | 第11-13页 |
| 1.5 本文主要研究工作 | 第13-15页 |
| 2 分子动力学模拟方法简介 | 第15-22页 |
| 2.1 分子动力学基本原理 | 第15-17页 |
| 2.2 分子力场 | 第17-19页 |
| 2.3 边界条件 | 第19页 |
| 2.4 系综 | 第19-20页 |
| 2.5 分子动力学模拟的一般步骤 | 第20-22页 |
| 3 核糖体输出通道对蛋白质合成的调控作用 | 第22-29页 |
| 3.1 前言 | 第22-23页 |
| 3.2 肽链输出通道的几何特性 | 第23-24页 |
| 3.3 蛋白质在输出通道内的折叠 | 第24-25页 |
| 3.4 输出通道和新生肽链的相互作用机制 | 第25-29页 |
| 4 核糖体输出通道对蛋白质折叠的影响研究 | 第29-45页 |
| 4.1 前言 | 第29-30页 |
| 4.2 Amber 力场与溶剂模型匹配测试 | 第30-32页 |
| 4.3 不同类型蛋白在管道中的折叠研究 | 第32-43页 |
| 4.4 小结分析 | 第43-45页 |
| 5 无序蛋白分子动力学模拟研究 | 第45-57页 |
| 5.1 无序蛋白的特殊性质 | 第45-48页 |
| 5.2 无序蛋白分子动力学模拟研究 | 第48-52页 |
| 5.3 分子动力学模拟研究温度对无序蛋白的影响 | 第52-57页 |
| 6 总结和展望 | 第57-59页 |
| 致谢 | 第59-60页 |
| 参考文献 | 第60-65页 |
