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内蒙古绒山羊皮肤毛囊周期生长发育相关miRNA鉴定

摘要第3-4页
Abstract第4页
1 引言第10-20页
    1.1 探究问题的由来第10页
    1.2 内蒙古白绒山羊第10页
    1.3 皮肤毛囊概述第10-12页
        1.3.1 绒山羊毛被特点第10-11页
        1.3.2 皮肤和毛囊的基本结构第11-12页
        1.3.3 毛囊的周期性发育变化第12页
    1.4 miRNA在调控皮肤和毛囊发育中的作用第12-18页
        1.4.1 miRNA的结构与产生第13-14页
        1.4.2 miRNA的调节机制第14-15页
        1.4.3 在模式生物发育中的调控功能第15-16页
        1.4.4 miRNA与毛囊发生及周期发育第16-17页
        1.4.5 研究展望第17-18页
    1.5 高通量测序技术第18-19页
    1.6 本研究的目的与意义第19-20页
        1.6.1 本研究拟解决的问题第19页
        1.6.2 本研究的意义第19-20页
2 材料与方法第20-27页
    2.1 试验材料第20-21页
        2.1.1 试验样品第20页
        2.1.2 主要试剂、仪器及技术服务第20-21页
    2.2 试验方法第21-27页
        2.2.1 样品RNA的提取第21页
        2.2.2 RNA质量检测第21-22页
        2.2.3 miRNA测序第22-23页
        2.2.4 小RNA的分类注释第23-24页
        2.2.5 保守miRNA的鉴定第24页
        2.2.6 预测新的miRNA第24-25页
        2.2.7 新miRNA的靶基因预测及KEGG通路分析第25页
        2.2.8 对不同时期miRNA表达谱进行差异分析第25-27页
3 结果分析第27-50页
    3.1 RNA提取检测结果第27-28页
    3.2 原始数据处理第28-29页
    3.3 小RNA的注释分类第29-38页
        3.3.1 小RNA公共及特有序列分析第29-31页
        3.3.2 基因组比对第31-32页
        3.3.3 重复序列比对第32-33页
        3.3.4 Rfam比对第33-34页
        3.3.5 Genbank比对第34页
        3.3.6 内含子、外显子比对第34-36页
        3.3.7 小RNA的注释结果第36-38页
    3.4 新miRNA的预测第38-40页
        3.4.1 预测得到的新miRNA第38页
        3.4.2 候选miRNA首位碱基分布第38-39页
        3.4.3 候选miRNA的靶基因预测及KEGG分析第39-40页
    3.5 鉴定保守的miRNA第40-47页
        3.5.1 保守miRNA的鉴定结果第40-44页
        3.5.2 保守miRNA的家族分析第44-47页
    3.6 保守miRNA的差异表达分析第47-50页
4 讨论第50-53页
    4.1 与其他研究的比较说明第50页
    4.2 表达量较高的几个miRNA的重要作用的研究现状第50-53页
5 结论第53-54页
致谢第54-55页
参考文献第55-62页
附录第62-69页
作者简介第69页

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