摘要 | 第3-4页 |
Abstract | 第4页 |
1 引言 | 第10-20页 |
1.1 探究问题的由来 | 第10页 |
1.2 内蒙古白绒山羊 | 第10页 |
1.3 皮肤毛囊概述 | 第10-12页 |
1.3.1 绒山羊毛被特点 | 第10-11页 |
1.3.2 皮肤和毛囊的基本结构 | 第11-12页 |
1.3.3 毛囊的周期性发育变化 | 第12页 |
1.4 miRNA在调控皮肤和毛囊发育中的作用 | 第12-18页 |
1.4.1 miRNA的结构与产生 | 第13-14页 |
1.4.2 miRNA的调节机制 | 第14-15页 |
1.4.3 在模式生物发育中的调控功能 | 第15-16页 |
1.4.4 miRNA与毛囊发生及周期发育 | 第16-17页 |
1.4.5 研究展望 | 第17-18页 |
1.5 高通量测序技术 | 第18-19页 |
1.6 本研究的目的与意义 | 第19-20页 |
1.6.1 本研究拟解决的问题 | 第19页 |
1.6.2 本研究的意义 | 第19-20页 |
2 材料与方法 | 第20-27页 |
2.1 试验材料 | 第20-21页 |
2.1.1 试验样品 | 第20页 |
2.1.2 主要试剂、仪器及技术服务 | 第20-21页 |
2.2 试验方法 | 第21-27页 |
2.2.1 样品RNA的提取 | 第21页 |
2.2.2 RNA质量检测 | 第21-22页 |
2.2.3 miRNA测序 | 第22-23页 |
2.2.4 小RNA的分类注释 | 第23-24页 |
2.2.5 保守miRNA的鉴定 | 第24页 |
2.2.6 预测新的miRNA | 第24-25页 |
2.2.7 新miRNA的靶基因预测及KEGG通路分析 | 第25页 |
2.2.8 对不同时期miRNA表达谱进行差异分析 | 第25-27页 |
3 结果分析 | 第27-50页 |
3.1 RNA提取检测结果 | 第27-28页 |
3.2 原始数据处理 | 第28-29页 |
3.3 小RNA的注释分类 | 第29-38页 |
3.3.1 小RNA公共及特有序列分析 | 第29-31页 |
3.3.2 基因组比对 | 第31-32页 |
3.3.3 重复序列比对 | 第32-33页 |
3.3.4 Rfam比对 | 第33-34页 |
3.3.5 Genbank比对 | 第34页 |
3.3.6 内含子、外显子比对 | 第34-36页 |
3.3.7 小RNA的注释结果 | 第36-38页 |
3.4 新miRNA的预测 | 第38-40页 |
3.4.1 预测得到的新miRNA | 第38页 |
3.4.2 候选miRNA首位碱基分布 | 第38-39页 |
3.4.3 候选miRNA的靶基因预测及KEGG分析 | 第39-40页 |
3.5 鉴定保守的miRNA | 第40-47页 |
3.5.1 保守miRNA的鉴定结果 | 第40-44页 |
3.5.2 保守miRNA的家族分析 | 第44-47页 |
3.6 保守miRNA的差异表达分析 | 第47-50页 |
4 讨论 | 第50-53页 |
4.1 与其他研究的比较说明 | 第50页 |
4.2 表达量较高的几个miRNA的重要作用的研究现状 | 第50-53页 |
5 结论 | 第53-54页 |
致谢 | 第54-55页 |
参考文献 | 第55-62页 |
附录 | 第62-69页 |
作者简介 | 第69页 |