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黄色粘球菌生物被膜中胞外DNA的整合机制与生物学功能

摘要第11-14页
Abstract第14-16页
符号说明及缩略词第17-18页
第一章 文献综述第18-38页
    1.1 细菌生物被膜概述第18-19页
    1.2 细菌胞外基质第19-20页
    1.3 细菌生物被膜中的胞外多糖第20-22页
    1.4 胞外DNA概述第22-32页
        1.4.1 胞外DNA在自然界中的分布第22-23页
        1.4.2 胞外DNA的发现过程第23-24页
        1.4.3 胞外DNA的来源第24-26页
        1.4.4 胞外DNA的作用第26-32页
    1.5 细菌胞外基质中大分子的相互作用第32-34页
        1.5.1 EPS-蛋白质相互作用第32页
        1.5.2 DNA-蛋白质相互作用第32-33页
        1.5.3 EPS-DNA相互作用第33-34页
    1.6 本论文研究思路及内容第34-38页
第二章 eDNA与EPS相互作用的确认和化学本质第38-55页
    2.1 实验材料第38-41页
        2.1.1 菌株第38页
        2.1.2 培养基第38页
        2.1.3 实验试剂及试剂盒第38-40页
        2.1.4 仪器耗材第40-41页
    2.2 实验方法第41-44页
        2.2.1 黄色粘球菌不可溶性胞外多糖的提取第41-42页
        2.2.2 黄色粘球菌可溶性胞外多糖的提取第42页
        2.2.3 透射电镜观察EPS和DNA第42-43页
        2.2.4 光散射实验第43页
        2.2.5 染料替代实验第43-44页
        2.2.6 红外光谱实验第44页
        2.2.7 圆二色谱实验第44页
        2.2.8 样品制备和共聚焦激光扫描显微镜第44页
    2.3 实验结果和分析第44-53页
        2.3.1 CLSM结果及分析第44-46页
        2.3.2 透射电镜实验结果第46-47页
        2.3.3 光散射实验结果第47-50页
        2.3.4 染料替代实验结果第50-51页
        2.3.5 红外光谱实验结果第51-53页
        2.3.6 圆二色谱实验结果第53页
    2.4 本章小结第53-55页
第三章 eDNA-EPS的相互作用所赋予整合型ECM的相关生物学功能和特性第55-68页
    3.1 实验材料第55-56页
        3.1.1 菌株第55页
        3.1.2 培养基第55-56页
        3.1.3 实验试剂及试剂盒第56页
        3.1.4 仪器耗材第56页
    3.2 实验方法第56-60页
        3.2.1 DNA酶降解实验第56-57页
        3.2.2 粘度测定实验第57-58页
        3.2.3 生物被膜抗生素抗性实验第58-59页
        3.2.4 生物被膜表面活性剂耐受性实验第59页
        3.2.5 M.xanthus社会性发育能力分析第59页
        3.2.6 M.xanthus捕食能力分析第59-60页
        3.2.7 DNA营养供给实验第60页
    3.3 实验结果和分析第60-67页
        3.3.1 DNA、EPS及DNA-EPS复合物粘度探究实验第60-62页
        3.3.2 EPS保护DNA不受DNase降解第62-63页
        3.3.3 eDNA缺陷对M.xanthus生物被膜抗逆性影响的探究第63-64页
        3.3.4 eDNA作为M.xanthus的营养物质第64-65页
        3.3.5 eDNA缺陷对M.xanthus子实体发育及捕食影响的探究第65-67页
    3.4 本章小结第67-68页
第四章 M.xanthus eDNA来源的探究第68-80页
    4.1 实验材料第68-69页
        4.1.1 菌株第68页
        4.1.2 培养基第68-69页
        4.1.3 实验试剂及试剂盒第69页
        4.1.4 仪器耗材第69页
    4.2 实验方法第69-74页
        4.2.1 M.xanthus生长曲线及eDNA含量曲线的绘制第69页
        4.2.2 eDNA含量的测定第69-70页
        4.2.3 DK1622基因组以及胞外DNA的提取第70页
        4.2.4 PCR验证第70-72页
        4.2.5 β-半乳糖苷酶活性的测定第72-73页
        4.2.6 M.xanthus释放到上清液中eDNA含量的测定第73页
        4.2.7 CLSM中染色信号的定量第73-74页
    4.3 实验结果和分析第74-79页
        4.3.1 液体培养条件下M.xanthus eDNA含量随其生长的变化趋势第74-75页
        4.3.2 生物被膜培养条件下M.xanthus eDNA含量随其生长的变化趋势第75-77页
        4.3.3 eDNA来自于M.xanthus主动分泌方式的探究第77-78页
        4.3.4 M.xanthus eDNA与M.xanthus基因组相似性分析第78-79页
    4.4 本章小结第79-80页
总结与展望第80-83页
参考文献第83-92页
致谢第92-93页
学位论文评阅及答辩情况表第93页

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