| 摘要 | 第10-12页 |
| ABSTRACT | 第12-14页 |
| LIST OF ABBREVIATIONS | 第15-17页 |
| LIST OF TABLES | 第17-18页 |
| LIST OF FIGURES | 第18-19页 |
| CHAPTER 1 INTRODUCTION | 第19-21页 |
| CHAPTER 2 REVIEW OF LITERATURE | 第21-51页 |
| 1. AVERMECTINS | 第21-22页 |
| 2. ABAMECTIN | 第22-23页 |
| 3. GENERAL PROPERTIES | 第23页 |
| 4. PHYSICAL/CHEMICAL PROPERTIES | 第23-24页 |
| 5. MODE OF ACTION | 第24-26页 |
| 6. METABOLISM | 第26-27页 |
| 7. TOXICITY | 第27-28页 |
| 8. ENVIRONMENTAL FATE | 第28-41页 |
| 8.1. Concentrations and persistence in environmental compartments | 第28-32页 |
| 8.2. Impacts on terrestrial fauna | 第32-36页 |
| 8.2.1. Lethal impacts | 第32-33页 |
| 8.2.2. Sublethal impacts | 第33-36页 |
| 8.3. Impacts on aquatic fauna | 第36-41页 |
| 8.3.1. Impacts on target aquatic animals | 第37-38页 |
| 8.3.2. Impacts on non-target marine organisms | 第38-39页 |
| 8.3.3. Impacts on non-target freshwater organisms | 第39-41页 |
| 9. BIODEGRADATION/BIOREMEDIATION | 第41-44页 |
| References | 第44-51页 |
| CHAPTER 3 ISOLATION AND CHARACTERIZATION OF BACTERIAL STRAIN GB-01 | 第51-78页 |
| Abstract | 第51页 |
| 1. INTRODUCTION | 第51-53页 |
| 2. MATERIALS AND METHODS | 第53-64页 |
| 2.1 Chemicals | 第53页 |
| 2.2 Culture media | 第53-54页 |
| 2.2.1 Washing and sterilization of glassware | 第53页 |
| 2.2.2 Medium preparation | 第53-54页 |
| 2.3. Enrichment of the abamectin-degrading consortium | 第54-55页 |
| 2.4 Isolation of pure culture | 第55-57页 |
| 2.5 Maintenance of bacterial culture | 第57页 |
| 2.6 Identification and characterization of strain GB-01 | 第57-60页 |
| 2.6.1 Morphological characterization | 第57-59页 |
| 2.6.1.1 Transmission electron microscopy | 第57-58页 |
| 2.6.1.2 Smear preparation and Gram staining | 第58-59页 |
| 2.6.1.3 Cultural characterization | 第59页 |
| 2.6.2 Physiological and biochemical characterization | 第59-60页 |
| 2.6.2.1 Fermentation of sugars | 第59页 |
| 2.6.2.2 Methyl red and Voges Praskaeur test | 第59页 |
| 2.6.2.3 Indole test | 第59页 |
| 2.6.2.4 Citrate utilization test | 第59-60页 |
| 2.6.2.5 Nitrate reduction test | 第60页 |
| 2.6.2.6 Catalase test | 第60页 |
| 2.6.2.7 Liquefication of gelatin | 第60页 |
| 2.7 Biodegradation assay of abamectin by strain GB-01 | 第60-63页 |
| 2.7.1 Inoculum preparation | 第60-61页 |
| 2.7.2 Construction of reactors | 第61页 |
| 2.7.3 Effects of Temperature | 第61-62页 |
| 2.7.4 Effects of pH | 第62页 |
| 2.7.5 Effects of initial concentration | 第62-63页 |
| 2.7.6 Biodegradation kinetics | 第63页 |
| 2.8 Analytical techniques | 第63-64页 |
| 2.8.1 Extraction of abamectin for HPLC | 第63页 |
| 2.8.2 High pressure liquid chromatography (HPLC) | 第63-64页 |
| 2.8.3 Calibration of HPLC instrument | 第64页 |
| 3. RESULTS AND DISCUSSION | 第64-72页 |
| 3.1 Degradability of abamectin through enrichment culture | 第64-65页 |
| 3.2 Isolation and characterization of the strain GB-01 | 第65-68页 |
| 3.3 Biodegradation of abamectin by strain GB-01 in cell culture | 第68-69页 |
| 3.4 Degradation at different temperatures | 第69-70页 |
| 3.5 Degradation at different pH | 第70-71页 |
| 3.6 Degradation at different initial concentrations of abamectin | 第71-72页 |
| 4. CONCLUSION | 第72-74页 |
| References | 第74-78页 |
| CHAPTER 4 TAXONOMIC ANALYSIS OF STRAIN GB-01 | 第78-126页 |
| Abstract | 第78页 |
| 1. INTRODUCTION | 第78-86页 |
| 1.1 History and structure of the Burkholderia genus | 第78-81页 |
| 1.2 Natural diversity and potential application of Burkholderia cepacia complex species | 第81-83页 |
| 1.3 Identification and Classification of Bcc | 第83-84页 |
| 1.4 Research aim | 第84-86页 |
| 2. MATERIALS AND METHODS | 第86-96页 |
| 2.1 Bacterial strain and culture conditions | 第86页 |
| 2.2 Genomic DNA extraction | 第86-87页 |
| 2.3 DNA quantification and purity check | 第87页 |
| 2.4 Polymerase chain reaction (PCR) | 第87-88页 |
| 2.5 Agarose gel electrophoresis | 第88页 |
| 2.6 DNA (PCR product) purification from agarose gel | 第88-90页 |
| 2.7 Cloning of PCR product | 第90页 |
| 2.8 Transformation of E. coli | 第90-91页 |
| 2.9 Plasmid purification from E. coli | 第91-92页 |
| 2.10 Restriction endonuclease digestion | 第92页 |
| 2.11 Cycle sequencing of DNA | 第92页 |
| 2.12 Molecular sequence analysis | 第92-93页 |
| 2.13 Biochemical and substrate utilization test | 第93-95页 |
| 2.13.1 API 20 NE | 第93页 |
| 2.13.2 ID 32 GN | 第93-94页 |
| 2.13.3 API 50 CH | 第94页 |
| 2.13.4 Biolog GN2 MicroPlate | 第94-95页 |
| 2.14 Whole cell fatty acid profiling | 第95页 |
| 2.15 Whole genome G+C mol% determination | 第95页 |
| 2.16 Whole genome DNA-DNA hybridization | 第95-96页 |
| 3. RESULTS AND DISCUSSION | 第96-116页 |
| 3.1 Biochemical and substrate utilization characteristics of strain GB-01 | 第96-104页 |
| 3.2 Whole cell fatty acid profile of strain GB-01 | 第104-106页 |
| 3.3 G+C mol% of Strain GB-01 | 第106-108页 |
| 3.4 Phylogenetic analysis of 16S rRNA gene | 第108-111页 |
| 3.5 Amplification of recA gene fragments from strain GB-01 | 第111-113页 |
| 3.6 Phylogenetic analysis of recA gene | 第113-115页 |
| 3.7 Whole genome DNA-DNA hybridization | 第115-116页 |
| 4. CONCLUSION | 第116-117页 |
| References | 第117-126页 |
| CHAPTER 5 BIODEGRADATION PATHWAY OF ABAMECTIN BY STRAIN GB-01 | 第126-145页 |
| Abstract | 第126页 |
| 1. INTRODUCTION | 第126-133页 |
| 1.1 High performance liquid chromatography (HPLC) | 第127-128页 |
| 1.2 Mass spectrometry | 第128-131页 |
| 1.2.1 Triple quadrupole mass spectrometry | 第129-131页 |
| 1.3 Electrospray Ionization (ESI) | 第131-133页 |
| 2. MATERIALS AND METHODS | 第133-135页 |
| 2.1 Chemicals, bacterium and culture media | 第133-134页 |
| 2.2 Instrumentation | 第134页 |
| 2.3 Biodegradation experimental system | 第134-135页 |
| 2.4 Sample preparation | 第135页 |
| 3. RESULTS AND DISCUSSION | 第135-141页 |
| 3.1 Degradation products | 第135-138页 |
| 3.2 Structural elucidation of the metabolites | 第138-141页 |
| 4. CONCLUSION | 第141-142页 |
| References | 第142-145页 |
| CHAPTER 6 EVALUATION OF BIOREMEDIATION POTENTIAL OF STRAIN GB-01 IN SOIL MICROCOSMS | 第145-163页 |
| Abstract | 第145页 |
| 1. INTRODUCTION | 第145-147页 |
| 2. MATERIALS AND METHODS | 第147-151页 |
| 2.1 Chemicals, organism and culture conditions | 第147页 |
| 2.2 Effect of different factors on the growth of strain GB-01 | 第147-148页 |
| 2.3 Induction studies | 第148页 |
| 2.4 Preparation of the inoculum and soil microcosms | 第148-150页 |
| 2.5 Study of different factors affecting the abamectin degradation in soil microcosms | 第150-151页 |
| 2.6 Extraction and HPLC analysis | 第151页 |
| 2.7 Reproducibility | 第151页 |
| 3. RESULTS AND DISCUSSION | 第151-158页 |
| 3.1 Growth characterization of strain GB-01 for inoculum preparation | 第152页 |
| 3.2 Effects of substrate concentration | 第152-154页 |
| 3.3 Effects of pH and temperature | 第154-156页 |
| 3.4 Effects of inoculum size, inoculation frequency and flooded conditions | 第156-158页 |
| 4. CONCLUSION | 第158-159页 |
| References | 第159-163页 |
| SUMMARY AND CONCLUSIONS | 第163-165页 |
| SIGNIFICANCE OF THE RESEARCH | 第165-167页 |
| FUTURE PERSPECTIVES | 第167-169页 |
| PUBLICATIONS | 第169-171页 |
| APPENDICES | 第171-173页 |
| ACKNOWLEDGMENT | 第173-174页 |
