| 摘要 | 第3-6页 |
| Abstract | 第6-9页 |
| 第一章 绪论 | 第13-23页 |
| 1.1 DNA结构概述 | 第13页 |
| 1.2 荧光在DNA结构和动力学研究中的应用 | 第13-15页 |
| 1.2.1 荧光碱基类似物作为结构和动力学探针 | 第13-14页 |
| 1.2.2 DNA大沟探针 | 第14页 |
| 1.2.3 DNA和RNA中荧光共振能量转移 | 第14-15页 |
| 1.3 荧光碱基类似物 | 第15-19页 |
| 1.3.1 环境不敏感型荧光碱基类似物 | 第15-16页 |
| 1.3.2 环境敏感型荧光碱基类似物 | 第16-19页 |
| 1.4 量子化学计算方法简介 | 第19-21页 |
| 1.4.1 从头算(Ab initio)方法 | 第19页 |
| 1.4.2 密度泛函理论简介 | 第19-20页 |
| 1.4.3 激发态的理论计算 | 第20-21页 |
| 1.4.4 自洽反应场模型（SCRF） | 第21页 |
| 1.5 论文研究目的、意义及主要研究内容 | 第21-23页 |
| 第二章 腺嘌呤碱基类似物的吸收和发射光谱理论研究 | 第23-42页 |
| 2.1 引言 | 第23页 |
| 2.2 计算方法 | 第23-24页 |
| 2.3 结果与讨论 | 第24-35页 |
| 2.3.1 基态结构 | 第24-25页 |
| 2.3.2 激发态结构 | 第25-27页 |
| 2.3.3 前线分子轨道 | 第27-28页 |
| 2.3.4 吸收光谱 | 第28-33页 |
| 2.3.5 发射光谱 | 第33-34页 |
| 2.3.6 碱基配对对吸收和发射光谱的影响 | 第34-35页 |
| 2.4 结论 | 第35-37页 |
| 附录信息 | 第37-42页 |
| 第三章 胞嘧啶碱基类似物的吸收和发射光谱理论研究 | 第42-59页 |
| 3.1 引言 | 第42页 |
| 3.2 计算细节 | 第42页 |
| 3.3 结果与讨论 | 第42-55页 |
| 3.3.1 基态结构 | 第42-44页 |
| 3.3.2 激发态结构 | 第44-46页 |
| 3.3.3 前线分子轨道 | 第46-47页 |
| 3.3.4 吸收光谱 | 第47-52页 |
| 3.3.5 碱基配对对吸收光谱的影响 | 第52-53页 |
| 3.3.6 发射光谱 | 第53-54页 |
| 3.3.7 TD-B3LYP方法的有效性 | 第54-55页 |
| 3.4 结论 | 第55-56页 |
| 附录信息 | 第56-59页 |
| 第四章 吡咯胞嘧啶碱基类似物的吸收和发射光谱理论研究 | 第59-74页 |
| 4.1 引言 | 第59页 |
| 4.2 计算方法 | 第59页 |
| 4.3 结果与讨论 | 第59-71页 |
| 4.3.1 基态结构 | 第59-61页 |
| 4.3.2 激发态结构 | 第61-62页 |
| 4.3.3 前线分子轨道 | 第62-63页 |
| 4.3.4 吸收光谱 | 第63-68页 |
| 4.3.5 碱基配对对吸收光谱的影响 | 第68-69页 |
| 4.3.6 发射光谱 | 第69-71页 |
| 4.4 结论 | 第71-72页 |
| 附录信息 | 第72-74页 |
| 第五章 苯扩环的双面AT碱基类似物的DFT和TD-DFT研究 | 第74-90页 |
| 5.1 引言 | 第74页 |
| 5.2 计算细节 | 第74-75页 |
| 5.3 结果与讨论 | 第75-85页 |
| 5.3.1 基态结构 | 第75-77页 |
| 5.3.2 前线分子轨道 | 第77-78页 |
| 5.3.3 吸收光谱 | 第78-79页 |
| 5.3.4 发射光谱 | 第79-80页 |
| 5.3.5 碱基配对对吸收光谱的影响 | 第80-85页 |
| 5.4 结论 | 第85-86页 |
| 附录信息 | 第86-90页 |
| 第六章 苯扩环的双面GC碱基类似物的DFT和TD-DFT研究 | 第90-102页 |
| 6.1 引言 | 第90页 |
| 6.2 计算细节 | 第90页 |
| 6.3 结果与讨论 | 第90-99页 |
| 6.3.1 基态结构 | 第90-92页 |
| 6.3.2 前线分子轨道 | 第92页 |
| 6.3.3 吸收光谱 | 第92-94页 |
| 6.3.4 发射光谱 | 第94-95页 |
| 6.3.5 碱基配对对吸收光谱的影响 | 第95-99页 |
| 6.4 结论 | 第99-100页 |
| 附录信息 | 第100-102页 |
| 第七章 主要结论与展望 | 第102-105页 |
| 7.1 主要结论 | 第102-104页 |
| 7.2 论文的创新点 | 第104页 |
| 7.3 问题与展望 | 第104-105页 |
| 致谢 | 第105-106页 |
| 参考文献 | 第106-118页 |
| 附录：作者在攻读博士学位期间发表的论文 | 第118页 |
