英文缩略词表 | 第5-7页 |
中文摘要 | 第7-9页 |
ABSTRACT | 第9-10页 |
前言 | 第12-18页 |
第一部分 应用高通量测序技术检测肌萎缩侧索硬化基因突变 | 第18-47页 |
1 实验材料 | 第18-22页 |
1.1 研究对象 | 第18页 |
1.2 仪器设备 | 第18-19页 |
1.3 高通量测序相关试剂和材料 | 第19-20页 |
1.4 其他试剂及配制 | 第20-21页 |
1.5 生物软件及生物信息学工具 | 第21-22页 |
2 实验方法 | 第22-37页 |
2.1 临床资料收集及样本采集 | 第22-23页 |
2.2 定制Ion Ampliseq~(TM) Primer Pool(ALS-Panel) | 第23页 |
2.3 基因组DNA提取 | 第23-24页 |
2.4 DNA样本定量 | 第24页 |
2.5 Ion torrent下一代测序 | 第24-34页 |
2.6 数据分析 | 第34-35页 |
2.7 一代测序验证 | 第35页 |
2.8 候选变异致病性分析 | 第35-37页 |
3 实验结果 | 第37-47页 |
3.1 ALS患者临床表现 | 第37页 |
3.2 候选致病变异筛选 | 第37-39页 |
3.3 ALS基因突变分析 | 第39-47页 |
第二部分 肌萎缩侧索硬化C9ORF72基因突变研究 | 第47-67页 |
1 实验材料 | 第47-51页 |
1.1 研究对象 | 第47页 |
1.2 仪器设备 | 第47页 |
1.3 Repeat-primed PCR相关试剂 | 第47-48页 |
1.4 基因克隆相关试剂 | 第48-49页 |
1.5 RNA提取及反转录相关试剂 | 第49页 |
1.6 细菌菌种及细菌培养用品 | 第49页 |
1.7 细胞株及细胞培养用品 | 第49-50页 |
1.8 主要相关试剂的配制 | 第50页 |
1.9 软件及数据库 | 第50-51页 |
2 实验方法 | 第51-64页 |
2.1 临床资料收集及样本采集 | 第51页 |
2.2 基因组DNA提取 | 第51页 |
2.3 C90RF72基因G_4C_2重复突变筛查 | 第51-53页 |
2.4 C90RF72基因编码区突变筛查 | 第53页 |
2.5 RNA体内剪接实验 | 第53-57页 |
2.6 RNA体外剪接实验(MiniGene Splicing Assay) | 第57-64页 |
3 实验结果 | 第64-67页 |
3.1 C90RF72基因G_4C_2重复扩增突变 | 第64-65页 |
3.2 C90RF72基因剪接位点突变 | 第65-67页 |
第三部分 肌萎缩侧索硬化的三核苷酸重复扩增突变研究 | 第67-75页 |
1 实验材料 | 第67-68页 |
1.1 研究对象 | 第67页 |
1.2 仪器设备 | 第67页 |
1.3 PCR反应相关试剂 | 第67页 |
1.4 引物序列 | 第67页 |
1.5 软件及数据库 | 第67-68页 |
2 实验方法 | 第68-72页 |
2.1 ATXN2基因(CAG)_n重复扩增突变筛查 | 第68页 |
2.2 ATXN3基因(CAG)_n重复扩增突变筛查 | 第68-69页 |
2.3 ATXN8基因(CAG)_n重复扩增突变筛查 | 第69-70页 |
2.4 AR基因重(CAG)_n复扩增突变筛查 | 第70-71页 |
2.5 三核苷酸重复扩增突变分析 | 第71-72页 |
3 实验结果 | 第72-75页 |
3.1 ATXN2基因重复扩增突变 | 第72页 |
3.2 ATXN3基因重复扩增突变 | 第72页 |
3.3 ATXN8基因重复扩增突变 | 第72页 |
3.4 AR基因重复扩增突变 | 第72-75页 |
讨论 | 第75-84页 |
结论 | 第84-85页 |
参考文献 | 第85-90页 |
附录 | 第90-108页 |
文献综述 | 第108-120页 |
参考文献 | 第118-120页 |
致谢 | 第120-122页 |
个人简历 | 第122-123页 |