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毛果杨PtrAMT与PtrNLP基因家族成员鉴定及表达模式分析

摘要第3-4页
Abstract第4页
1 绪论第7-13页
    1.1 杨树吸收与利用的氮素形态第7-8页
        1.1.1 氮素在自然界的存在形态第7页
        1.1.2 氮素对林木材质的影响第7-8页
    1.2 氮素营养物质的转运蛋白第8-10页
        1.2.1 硝酸盐转运蛋白(NRT)第8页
        1.2.2 铵转运蛋白(AMT)第8-10页
    1.3 NLP基因对氮素同化基因的调控第10-11页
    1.4 研究内容、目的和意义第11-13页
2 毛果杨PtrAMT基因家族成员的生物信息学重鉴定第13-24页
    2.1 材料第13页
    2.2 方法第13-15页
        2.2.1 毛果杨PtrAMT基因家族成员的鉴定第13页
        2.2.2 毛果杨PtrAMT基因家族成员间进化分析第13-14页
        2.2.3 毛果杨PtrAMT基因家族成员的染色体定位分析第14页
        2.2.4 毛果杨PtrAMT基因家族成员的基因结构与保守序列的识别第14-15页
    2.3 结果第15-22页
        2.3.1 毛果杨PtrAMT基因家族成员的鉴定第15页
        2.3.2 直系同源与旁系同源分析第15页
        2.3.3 基因结构与保守序列分布分析第15-19页
        2.3.4 染色体定位分析第19-22页
    2.4 本章小结第22-24页
3 小黑杨AMT基因家族成员表达模式分析第24-34页
    3.1 材料第24页
        3.1.1 植物材料第24页
        3.1.2 杨树的培养第24页
        3.1.3 EST数据的下载第24页
        3.1.4 所需试剂第24页
    3.2 方法第24-27页
        3.2.1 杨树休眠花芽RNA的提取第24-25页
        3.2.2 杨树组织样品RNA提取第25页
        3.2.3 杨树组织样品RNA的反转录第25页
        3.2.4 杨树各组织cDNA文库数据以及EST数据分析第25页
        3.2.5 PtrAMT基因家族成员引物设计与半定量PCR实验体系第25-27页
    3.3 结果第27-31页
        3.3.1 AMT基因家族成员全组织表达模式分析第27-28页
        3.3.2 AMT基因家族成员氮饥饿状态下表达模式分析第28-29页
        3.3.3 AMT基因家族成员氮回补状态下表达模式分析第29页
        3.3.4 AMT基因家族成员在茎中的空间表达模式分析第29-31页
    3.4 本章小结第31-34页
        3.4.1 PtrAMT基因家族成员在杨树中介导铵盐的吸收第31-32页
        3.4.2 PtrAMT基因家族成员响应环境中氮素浓度变化表达模式第32-34页
4 毛果杨NLP基因家族成员的生物信息学分析第34-43页
    4.1 材料第34页
    4.2 方法第34-35页
        4.2.1 PtrNLP基因家族成员的确定第34页
        4.2.2 PtrNLP基因家族成员蛋白质序列理化性质与细胞定位分析第34页
        4.2.3 PtrNLP直系与旁系同源分析第34页
        4.2.4 染色体定位分析第34页
        4.2.5 基因结构分析第34页
        4.2.6 PtrNLP基因家族成员表达模式分析第34页
        4.2.7 PtrAMT基因家族成员启动子顺式作用元件第34-35页
    4.3 结果第35-41页
        4.3.1 PtrNLP基因家族成员的鉴定第35页
        4.3.2 PtrNLP基因家族成员的进化与染色体定位分析第35页
        4.3.3 PtrNLP基因家族成员在毛果杨各组中的表达模式分析第35-36页
        4.3.4 PtrAMT基因家族成员启动子NRE顺式作用元件分析第36-41页
    4.4 本章小结第41-43页
结论第43-44页
参考文献第44-49页
附录第49-56页
攻读学位期间发表的学术论文第56-57页
致谢第57-58页

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