单细胞测序数据的噪音分析及拷贝数检测算法研究
| 摘要 | 第5-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 第一章 绪论 | 第10-12页 |
| 1.1 课题的研究背景及意义 | 第10-11页 |
| 1.2 论文的组织结构 | 第11-12页 |
| 第二章 相关技术和理论 | 第12-22页 |
| 2.1 拷贝数变异检测方法 | 第12-14页 |
| 2.1.1 拷贝数变异的概念 | 第12-13页 |
| 2.1.2 拷贝数变异与荧光原位杂交技术 | 第13-14页 |
| 2.1.3 拷贝数变异与比较基因组杂交技术 | 第14页 |
| 2.2 测序技术 | 第14-21页 |
| 2.2.1 测序技术介绍 | 第14-16页 |
| 2.2.2 单细胞测序技术的流程 | 第16-17页 |
| 2.2.3 拷贝数变异检测方法介绍 | 第17-19页 |
| 2.2.4 基于读深度数据的检测算法或工具介绍 | 第19-21页 |
| 2.3 本章小结 | 第21-22页 |
| 第三章 数据预处理及噪音分析 | 第22-35页 |
| 3.1 高通量测序数据预处理 | 第22-27页 |
| 3.1.1 预处理一般流程 | 第22-23页 |
| 3.1.2 窗口划分方法介绍 | 第23-24页 |
| 3.1.3 单细胞测序数据预处理 | 第24-27页 |
| 3.2 单细胞测序数据分析 | 第27-33页 |
| 3.2.1 高通量测序读序列分布及应用 | 第27-29页 |
| 3.2.2 单细胞测序数据噪音分析 | 第29-32页 |
| 3.2.3 单细胞测序数据质量控制 | 第32页 |
| 3.2.4 窗口数选择 | 第32-33页 |
| 3.3 本章小结 | 第33-35页 |
| 第四章 拷贝数变异检测模型 | 第35-47页 |
| 4.1 单细胞测序数据的拷贝数变异检测模型 | 第35-39页 |
| 4.1.1 问题描述与建模 | 第35-36页 |
| 4.1.2 模型求解 | 第36-38页 |
| 4.1.3 参数估计 | 第38-39页 |
| 4.2 实验验证 | 第39-45页 |
| 4.2.1 模拟数据验证 | 第39-42页 |
| 4.2.3 真实数据验证 | 第42-45页 |
| 4.3 本章小节 | 第45-47页 |
| 第五章 检测工具实现 | 第47-50页 |
| 5.1 拷贝数变异检测工具介绍 | 第47页 |
| 5.2 拷贝数变异检测工具设计和实现 | 第47-49页 |
| 5.3 本章小结 | 第49-50页 |
| 结论 | 第50-51页 |
| 总结 | 第50页 |
| 展望 | 第50-51页 |
| 参考文献 | 第51-55页 |
| 攻读硕士学位期间取得的研究成果 | 第55-56页 |
| 致谢 | 第56-57页 |
| 附件 | 第57页 |
